植物中E(z)同源基因的保守性和功能分化研究
發(fā)布時(shí)間:2022-10-27 21:52
組蛋白甲基化修飾是一種重要的表觀遺傳調(diào)控過(guò)程,通過(guò)在組蛋白的賴(lài)氨酸和精氨酸等位點(diǎn)添加甲基來(lái)影響基因的轉(zhuǎn)錄表達(dá)過(guò)程,從而控制植物的生長(zhǎng)發(fā)育。PcG(Polycomb Group)蛋白參與動(dòng)植物的組蛋白甲基化修飾過(guò)程,在基因沉默和發(fā)育調(diào)控中都發(fā)揮著至關(guān)重要的作用。E(z)(Enhancer of Zeste)同源基因編碼一類(lèi)含有SET結(jié)構(gòu)域的PcG蛋白,參與組蛋白的甲基化過(guò)程。該基因廣泛存在于動(dòng)植物中。哺乳動(dòng)物中包含EZH1和EZH2兩種E(Z)同源基因,擬南芥中則包含CLF C CURLY LEAF)、SWN(SWINGER)和MEA(MEDEA)等三種E(Z)同源基因。為了深入解組蛋白甲基化相關(guān)基因在植物中的起源和進(jìn)化過(guò)程,本研究利用比較基因組學(xué)和系統(tǒng)發(fā)生學(xué)的手段對(duì)植物中的E(Z)同源基因進(jìn)行了分析。主要研究結(jié)果如下:(1)利用比較基因組學(xué)的方法進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育分析。系統(tǒng)發(fā)育分析結(jié)果表明E(Z)同源基因在綠色植物中高度保守,主要以單拷貝的形式存在于綠藻和早期陸生植物中。E(Z)同源基因在種子植物中卻分成了兩個(gè)分支:CLF分支和SWN分支,這兩個(gè)分支都有被子植物和裸子植物,表明這兩個(gè)分支可能...
【文章頁(yè)數(shù)】:69 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
1 緒論
1.1 基因組和轉(zhuǎn)錄組
1.1.1 植物基因組研究
1.1.2 植物轉(zhuǎn)錄組研究
1.1.3 植物比較基因組和轉(zhuǎn)錄組研究
1.2 基因重復(fù)
1.3 E(z)同源基因的背景介紹
1.3.1 PcG蛋白的發(fā)現(xiàn)
1.3.2 PcG蛋白在植物中的功能研究
1.3.3 E(z)同源基因的結(jié)構(gòu)和功能
1.3.4 印記基因MEDEA
1.4 本研究的目的和意義
2 材料和方法
2.1 數(shù)據(jù)檢索與數(shù)據(jù)庫(kù)的構(gòu)建
2.2 E(z)同源基因的鑒定
2.3 多序列比對(duì)與系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)的構(gòu)建
2.4 保守基序分析和基因結(jié)構(gòu)分析
2.5 共線(xiàn)性分析和選擇壓力分析
2.6 表達(dá)分析
3 結(jié)果
3.1 E(z)同源基因在綠色植物中的鑒定
3.2 E(z)同源基因在種子植物中的復(fù)制和分化
3.3 E(z)同源基因在被子植物中的擴(kuò)張
3.4 十字花科和豆科植物中E(z)同源基因的蛋白序列和基因結(jié)構(gòu)分析
3.5 豆科植物SWN2分支展現(xiàn)了明顯的氨基酸置換率和正向選擇
3.6 E(z)同源基因在大豆各組織中的表達(dá)譜分析
4 討論
4.1 綠色植物中E(z)同源基因的進(jìn)化模式
4.2 豆科植物E(z)同源基因的新功能化
參考文獻(xiàn)
附錄A 物種統(tǒng)計(jì)和系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)
附錄B 保守基序分析
附錄C 基因結(jié)構(gòu)分析
附錄D 選擇壓力分析
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]轉(zhuǎn)錄組研究新技術(shù):RNA-Seq及其應(yīng)用[J]. 祁云霞,劉永斌,榮威恒. 遺傳. 2011(11)
[2]Genome-wide transcriptional analysis of maize endosperm in response to ae wx double mutations[J]. Xiang Li,Guang Hui Chen,Wei Yang Zhang,Xiansheng Zhang State Key Laboratory of Crop Biology,College of Life Sciences,Shandong Agricultural University,Taian 271018,China. 遺傳學(xué)報(bào). 2010(11)
本文編號(hào):3697280
【文章頁(yè)數(shù)】:69 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
1 緒論
1.1 基因組和轉(zhuǎn)錄組
1.1.1 植物基因組研究
1.1.2 植物轉(zhuǎn)錄組研究
1.1.3 植物比較基因組和轉(zhuǎn)錄組研究
1.2 基因重復(fù)
1.3 E(z)同源基因的背景介紹
1.3.1 PcG蛋白的發(fā)現(xiàn)
1.3.2 PcG蛋白在植物中的功能研究
1.3.3 E(z)同源基因的結(jié)構(gòu)和功能
1.3.4 印記基因MEDEA
1.4 本研究的目的和意義
2 材料和方法
2.1 數(shù)據(jù)檢索與數(shù)據(jù)庫(kù)的構(gòu)建
2.2 E(z)同源基因的鑒定
2.3 多序列比對(duì)與系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)的構(gòu)建
2.4 保守基序分析和基因結(jié)構(gòu)分析
2.5 共線(xiàn)性分析和選擇壓力分析
2.6 表達(dá)分析
3 結(jié)果
3.1 E(z)同源基因在綠色植物中的鑒定
3.2 E(z)同源基因在種子植物中的復(fù)制和分化
3.3 E(z)同源基因在被子植物中的擴(kuò)張
3.4 十字花科和豆科植物中E(z)同源基因的蛋白序列和基因結(jié)構(gòu)分析
3.5 豆科植物SWN2分支展現(xiàn)了明顯的氨基酸置換率和正向選擇
3.6 E(z)同源基因在大豆各組織中的表達(dá)譜分析
4 討論
4.1 綠色植物中E(z)同源基因的進(jìn)化模式
4.2 豆科植物E(z)同源基因的新功能化
參考文獻(xiàn)
附錄A 物種統(tǒng)計(jì)和系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)
附錄B 保守基序分析
附錄C 基因結(jié)構(gòu)分析
附錄D 選擇壓力分析
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]轉(zhuǎn)錄組研究新技術(shù):RNA-Seq及其應(yīng)用[J]. 祁云霞,劉永斌,榮威恒. 遺傳. 2011(11)
[2]Genome-wide transcriptional analysis of maize endosperm in response to ae wx double mutations[J]. Xiang Li,Guang Hui Chen,Wei Yang Zhang,Xiansheng Zhang State Key Laboratory of Crop Biology,College of Life Sciences,Shandong Agricultural University,Taian 271018,China. 遺傳學(xué)報(bào). 2010(11)
本文編號(hào):3697280
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