組蛋白甲基化修飾是一種重要的表觀遺傳調(diào)控過程,通過在組蛋白的賴氨酸和精氨酸等位點(diǎn)添加甲基來影響基因的轉(zhuǎn)錄表達(dá)過程,從而控制植物的生長(zhǎng)發(fā)育。PcG（Polycomb Group）蛋白參與動(dòng)植物的組蛋白甲基化修飾過程,在基因沉默和發(fā)育調(diào)控中都發(fā)揮著至關(guān)重要的作用。E（z）（Enhancer of Zeste）同源基因編碼一類含有SET結(jié)構(gòu)域的PcG蛋白,參與組蛋白的甲基化過程。該基因廣泛存在于動(dòng)植物中。哺乳動(dòng)物中包含EZH1和EZH2兩種E（Z）同源基因,擬南芥中則包含CLF C CURLY LEAF)、SWN（SWINGER）和MEA（MEDEA）等三種E（Z）同源基因。為了深入解組蛋白甲基化相關(guān)基因在植物中的起源和進(jìn)化過程,本研究利用比較基因組學(xué)和系統(tǒng)發(fā)生學(xué)的手段對(duì)植物中的E（Z）同源基因進(jìn)行了分析。主要研究結(jié)果如下:（1）利用比較基因組學(xué)的方法進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育分析。系統(tǒng)發(fā)育分析結(jié)果表明E（Z）同源基因在綠色植物中高度保守,主要以單拷貝的形式存在于綠藻和早期陸生植物中。E（Z）同源基因在種子植物中卻分成了兩個(gè)分支:CLF分支和SWN分支,這兩個(gè)分支都有被子植物和裸子植物,表明這兩個(gè)分支可能... 

【文章頁數(shù)】：69 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
1 緒論
    1.1 基因組和轉(zhuǎn)錄組
        1.1.1 植物基因組研究
        1.1.2 植物轉(zhuǎn)錄組研究
        1.1.3 植物比較基因組和轉(zhuǎn)錄組研究
    1.2 基因重復(fù)
    1.3 E(z)同源基因的背景介紹
        1.3.1 PcG蛋白的發(fā)現(xiàn)
        1.3.2 PcG蛋白在植物中的功能研究
        1.3.3 E(z)同源基因的結(jié)構(gòu)和功能
        1.3.4 印記基因MEDEA
    1.4 本研究的目的和意義
2 材料和方法
    2.1 數(shù)據(jù)檢索與數(shù)據(jù)庫的構(gòu)建
    2.2 E(z)同源基因的鑒定
    2.3 多序列比對(duì)與系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建
    2.4 保守基序分析和基因結(jié)構(gòu)分析
    2.5 共線性分析和選擇壓力分析
    2.6 表達(dá)分析
3 結(jié)果
    3.1 E(z)同源基因在綠色植物中的鑒定
    3.2 E(z)同源基因在種子植物中的復(fù)制和分化
    3.3 E(z)同源基因在被子植物中的擴(kuò)張
    3.4 十字花科和豆科植物中E(z)同源基因的蛋白序列和基因結(jié)構(gòu)分析
    3.5 豆科植物SWN2分支展現(xiàn)了明顯的氨基酸置換率和正向選擇
    3.6 E(z)同源基因在大豆各組織中的表達(dá)譜分析
4 討論
    4.1 綠色植物中E(z)同源基因的進(jìn)化模式
    4.2 豆科植物E(z)同源基因的新功能化
參考文獻(xiàn)
附錄A 物種統(tǒng)計(jì)和系統(tǒng)發(fā)育樹
附錄B 保守基序分析
附錄C 基因結(jié)構(gòu)分析
附錄D 選擇壓力分析
致謝


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]轉(zhuǎn)錄組研究新技術(shù):RNA-Seq及其應(yīng)用[J]. 祁云霞,劉永斌,榮威恒.  遺傳. 2011(11)
[2]Genome-wide transcriptional analysis of maize endosperm in response to ae wx double mutations[J]. Xiang Li,Guang Hui Chen,Wei Yang Zhang,Xiansheng Zhang State Key Laboratory of Crop Biology,College of Life Sciences,Shandong Agricultural University,Taian 271018,China.  遺傳學(xué)報(bào). 2010(11)



本文編號(hào)：3697280