亞麻薺油脂相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子CsLEC2基因家族的鑒定及表達(dá)分析
發(fā)布時(shí)間:2022-09-27 17:07
對亞麻薺CsLEC2家族進(jìn)行全基因組鑒定、半定量RT-PCR、qRT-PCR,檢測CsLEC2基因的時(shí)空表達(dá)特性并通過轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)預(yù)測CsLEC2下游靶基因,以解析CsLEC2調(diào)控亞麻薺種子油脂合成和積累等生物學(xué)功能。結(jié)果表明,在亞麻薺基因組中共鑒定到3個(gè)亞麻薺CsLEC2基因(CsLEC2.1、CsLEC2.2和CsLEC2.3)。蛋白理化性質(zhì)和高級結(jié)構(gòu)分析顯示,亞麻薺CsLEC2蛋白具有與擬南芥AtLEC2相似的理化性質(zhì),且其二級結(jié)構(gòu)的主體也相似。系統(tǒng)進(jìn)化分析表明,亞麻薺CsLEC2蛋白與模式植物擬南芥AtLEC2蛋白及擬南芥琴亞種AlLEC2蛋白親緣關(guān)系最近。qRT-PCR結(jié)果顯示亞麻薺CsLEC2在未成熟的種子中高表達(dá)。轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析顯示下游基因CsWRI1和CsOLE3高表達(dá),推測CsLEC2可能直接上調(diào)CsWRI1和CsOLE3的轉(zhuǎn)錄表達(dá),參與油脂代謝調(diào)控。
【文章頁數(shù)】:10 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)材料
1.2 數(shù)據(jù)來源與序列鑒定
1.3 Cs LEC2基因及編碼蛋白的基本結(jié)構(gòu)分析
1.4 Cs LEC2蛋白的保守結(jié)構(gòu)域和系統(tǒng)進(jìn)化分析
1.5 Cs LEC2啟動(dòng)子序列順式元件分析
1.6 Cs LEC2基因的實(shí)時(shí)定量PCR表達(dá)分析
1.7 Cs LEC2下游基因預(yù)測
2 結(jié)果與分析
2.1 Cs LEC2家族基因結(jié)構(gòu)與編碼蛋白序列基本特征分析
2.2 Cs LEC2蛋白高級結(jié)構(gòu)分析
2.3 Cs LEC2氨基酸多序列比對
2.4 Cs LEC2家族蛋白保守基序和系統(tǒng)進(jìn)化分析
2.5 Cs LEC2啟動(dòng)子的功能元件分析
2.6 Cs LEC2基因的表達(dá)分析
2.7 Cs LEC2調(diào)控的下游基因預(yù)測
3 討論
3.1 Cs LEC2的序列特征分析
3.2 Cs LEC2的表達(dá)模式分析
3.3 Cs LEC2的下游基因預(yù)測分析
4 結(jié)論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]玉米ZmCOL3pro217啟動(dòng)子的克隆及功能分析[J]. 果天宇,尹悅佳,賈偉,柳青,郭嘉,劉洋,陳子奇,郝東云,劉相國. 玉米科學(xué). 2020(02)
[2]LAFL基因在種子發(fā)育和萌發(fā)中的功能[J]. 郭秀芬,張海龍,王明晶,趙振杰,宋揚(yáng),李立新. 植物生理學(xué)報(bào). 2019(04)
[3]新型工業(yè)油料作物亞麻薺:從基因組到代謝工程[J]. 苑麗霞,毛雪,高昌勇,張莉,薛金愛,李潤植. 植物生理學(xué)報(bào). 2015(08)
[4]植物脂肪酸的生物合成及其生理功能的研究進(jìn)展[J]. 李昌珠,李正茂. 湖南林業(yè)科技. 2009(06)
[5]番木瓜proteinase omega基因啟動(dòng)子的克隆及功能初步研究[J]. 楊英軍,周鵬. 云南植物研究. 2005(05)
碩士論文
[1]植物中油脂調(diào)節(jié)基因ABSCISIC ACID INSENSITIVE3、FUSCA3和LEAFY COTYLEDON2的鑒定、系統(tǒng)進(jìn)化和結(jié)構(gòu)特征分析[D]. 唐通.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2019
[2]大豆GmLEC2基因的克隆及再生功能的初步分析[D]. 馬彥龍.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
本文編號:3681267
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【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)材料
1.2 數(shù)據(jù)來源與序列鑒定
1.3 Cs LEC2基因及編碼蛋白的基本結(jié)構(gòu)分析
1.4 Cs LEC2蛋白的保守結(jié)構(gòu)域和系統(tǒng)進(jìn)化分析
1.5 Cs LEC2啟動(dòng)子序列順式元件分析
1.6 Cs LEC2基因的實(shí)時(shí)定量PCR表達(dá)分析
1.7 Cs LEC2下游基因預(yù)測
2 結(jié)果與分析
2.1 Cs LEC2家族基因結(jié)構(gòu)與編碼蛋白序列基本特征分析
2.2 Cs LEC2蛋白高級結(jié)構(gòu)分析
2.3 Cs LEC2氨基酸多序列比對
2.4 Cs LEC2家族蛋白保守基序和系統(tǒng)進(jìn)化分析
2.5 Cs LEC2啟動(dòng)子的功能元件分析
2.6 Cs LEC2基因的表達(dá)分析
2.7 Cs LEC2調(diào)控的下游基因預(yù)測
3 討論
3.1 Cs LEC2的序列特征分析
3.2 Cs LEC2的表達(dá)模式分析
3.3 Cs LEC2的下游基因預(yù)測分析
4 結(jié)論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]玉米ZmCOL3pro217啟動(dòng)子的克隆及功能分析[J]. 果天宇,尹悅佳,賈偉,柳青,郭嘉,劉洋,陳子奇,郝東云,劉相國. 玉米科學(xué). 2020(02)
[2]LAFL基因在種子發(fā)育和萌發(fā)中的功能[J]. 郭秀芬,張海龍,王明晶,趙振杰,宋揚(yáng),李立新. 植物生理學(xué)報(bào). 2019(04)
[3]新型工業(yè)油料作物亞麻薺:從基因組到代謝工程[J]. 苑麗霞,毛雪,高昌勇,張莉,薛金愛,李潤植. 植物生理學(xué)報(bào). 2015(08)
[4]植物脂肪酸的生物合成及其生理功能的研究進(jìn)展[J]. 李昌珠,李正茂. 湖南林業(yè)科技. 2009(06)
[5]番木瓜proteinase omega基因啟動(dòng)子的克隆及功能初步研究[J]. 楊英軍,周鵬. 云南植物研究. 2005(05)
碩士論文
[1]植物中油脂調(diào)節(jié)基因ABSCISIC ACID INSENSITIVE3、FUSCA3和LEAFY COTYLEDON2的鑒定、系統(tǒng)進(jìn)化和結(jié)構(gòu)特征分析[D]. 唐通.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2019
[2]大豆GmLEC2基因的克隆及再生功能的初步分析[D]. 馬彥龍.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
本文編號:3681267
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