【目的】獲得豬FANK1基因CDS序列、組織表達和蛋白質(zhì)功能信息�！痉椒ā恳訥enBank下載的豬及近緣物種的FANK1 mRNA序列為參考序列,設(shè)計特異引物從版納微型豬近交系（BMI）睪丸組織中擴增FANK1基因完全編碼序列及部分側(cè)翼序列。應(yīng)用實時熒光定量PCR技術(shù)檢測BMI 15個重要組織的FANK1 mRNA轉(zhuǎn)錄表達水平,并對FANK1翻譯的蛋白質(zhì)序列進行多種功能生物信息學(xué)分析,預(yù)測FANK1蛋白質(zhì)的功能,最后構(gòu)建FANK1多物種氨基酸系統(tǒng)進化樹�！窘Y(jié)果】獲得了BMI FANK1編碼區(qū)序列長1 041 bp,編碼346個氨基酸,序列已提交GenBank,基因登錄號為KU705617和KU705618,對應(yīng)的氨基酸登錄號為AOC89035和AOC89036�；蚪M結(jié)構(gòu)分析表明FANK1基因定位于豬14號染色體,有11個外顯子和10個內(nèi)含子。多組織相對熒光定量表達分析表明FANK1基因在睪丸、尿道球腺和精囊腺中呈高表達水平;在其他組織中呈中低表達水平。功能生物信息學(xué)分析表明FANK1蛋白質(zhì)含有2種保守結(jié)構(gòu)域FN3和ANK,無跨膜螺旋結(jié)構(gòu),無N端信號肽序列,二級結(jié)構(gòu)以無規(guī)卷曲為主,N末... 

【文章頁數(shù)】：7 頁

【文章目錄】：
1 材料和方法
    1.1 材料
    1.2 方法
        1.2.1 總RNA提取和第一鏈c DNA合成
        1.2.2 引物設(shè)計及合成
        1.2.3 RT-PCR分離FANK1基因
        1.2.4 FANK1基因多組織表達分析
        1.2.5 序列確定和數(shù)據(jù)分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 FANK1基因RT-PCR擴增結(jié)果
    2.2 FANK1基因序列及其編碼的氨基酸序列
    2.3 FANK1基因組結(jié)構(gòu)分析
    2.4 多組織熒光定量表達分析
    2.5 FNAK1蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)信息
    2.6 FANK1蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)
    2.7 FANK1蛋白質(zhì)功能域
    2.8 FANK1蛋白質(zhì)的疏水性
    2.9 FANK1蛋白質(zhì)功能位點分析
    2.1 0 FANK1蛋白質(zhì)信號肽及跨膜結(jié)構(gòu)分析
    2.1 1 FANK1蛋白質(zhì)序列多物種系統(tǒng)進化分析
3 討論和結(jié)論



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