從人類正確認識到癌癥的存在以來,雖然經(jīng)過了多年漫長而不懈的努力研究,但是至今它仍然是嚴重危害人類生命安全的疾病,沒有嚴格意義上能夠治愈的方法。一般情況下,癌癥的發(fā)生都會伴隨著遺傳物質(zhì)的改變,癌癥的發(fā)生與細胞內(nèi)基因的非正常表達密切相關(guān)已經(jīng)是關(guān)于癌癥的普遍共識,原癌基因激活或是抑癌基因受到抑制都是癌癥發(fā)生的潛在因素。近些年來,一種全新的遺傳分子,microRNA（miRNA）的發(fā)現(xiàn),引起了研究者的廣泛關(guān)注。microRNA是一類內(nèi)源性的,長度為20²2個核苷酸分子的單鏈RNA,隨著學(xué)術(shù)界對它的認知不斷增加,它在生物體內(nèi)正常生命活動和包括癌癥在內(nèi)的疾病發(fā)病過程中所起到的作用也越來越受到關(guān)注。成熟體miRNA通過堿基互補配對同它所對應(yīng)的靶基因的信使RNA進行綁定,進而阻礙或抑制信使RNA翻譯成為蛋白質(zhì),由此對靶基因起到后轉(zhuǎn)錄調(diào)控的作用。越來越多的研究表明,miRNA在癌癥發(fā)病過程中的作用不可忽視。大量的對比研究結(jié)果顯示,癌癥的發(fā)生通常會伴隨著某些基因和miRNA的異常表達,主要體現(xiàn)在序列變異、缺失和表達量的升高或降低。這些基因和miRNA在特定的癌癥組織中異常表達,使它們... 

【文章頁數(shù)】：105 頁

【學(xué)位級別】：博士

【文章目錄】：
摘要
abstract
第1章 緒論
    1.1 癌癥簡介
    1.2 相關(guān)研究現(xiàn)狀
    1.3 主要工作
        1.3.1 15種癌癥中異常表達基因和miRNA的收集
        1.3.2 異常表達miRNA和基因的靶位關(guān)系獲取
        1.3.3 15種癌癥異常表達基因的富集分析、及調(diào)控網(wǎng)絡(luò)建立
        1.3.4 癌癥中異常表達基因和miRNA的評價模型
        1.3.5 重要基因和miRNA的GO和KEGG分析及ClueGO富集分析
    1.4 目的和意義
    1.5 文章結(jié)構(gòu)
第2章 涉及概念、數(shù)據(jù)構(gòu)成與相關(guān)方法介紹
    2.1 生物數(shù)據(jù)簡述
        2.1.1 癌癥基因
        2.1.2 抑癌基因
        2.1.3 異常表達
        2.1.4 microRNA
        2.1.5 GO Term富集分析
        2.1.6 信號通路
        2.1.7 癌癥相關(guān)的主題
    2.2 相關(guān)研究工具及數(shù)據(jù)庫介紹
        2.2.1 DAVID
        2.2.2 Cytoscape和ClueGO
        2.2.3 KEGG數(shù)據(jù)庫
        2.2.4 Cancer Genetics Web
        2.2.5 PhenomiR
        2.2.6 miR2Diease數(shù)據(jù)庫
        2.2.7 Tarbase數(shù)據(jù)庫
        2.2.8 NCBI與ENTREZ ID
第3章 異常表達因子評價模型建立、應(yīng)用和調(diào)控網(wǎng)絡(luò)建立
    3.1 本章提要
    3.2 異常表達因子評級模型建立
        3.2.1 異常表達基因和miRNA收集和預(yù)處理
        3.2.2 所關(guān)注生物過程和信號通路的選定
        3.2.3 異常表達基因富集分析
        3.2.4 異常表達基因評價、分級和關(guān)鍵基因提取
        3.2.5 實驗證實的靶位關(guān)系獲取
        3.2.6 異常表達miRNA評價、分級和關(guān)鍵基因提取靶位關(guān)系獲取
        3.2.7 核心調(diào)控網(wǎng)絡(luò)建立
    3.3 異常表達因子評級模型評估
    3.4 使用評價模型對15種癌癥異常數(shù)據(jù)的應(yīng)用分析
    3.5 本章小結(jié)
第4章 癌癥中異常表達基因和MIRNA在癌癥中的全局性統(tǒng)計和網(wǎng)絡(luò)分析
    4.1 本章提要
    4.2 15種癌癥中異常表達基因和MIRNA的數(shù)量特征分析
    4.3 GO分析及網(wǎng)絡(luò)建立
        4.3.1 研究結(jié)果分析
        4.3.2 miRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)建立及關(guān)鍵miRNA討論
    4.4 KEGG分析及核心基因與MIRNA探討
        4.4.1 KEGG網(wǎng)絡(luò)建立
        4.4.2 核心基因討論
        4.4.3 miRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)建立及關(guān)鍵miRNA討論
    4.5 本章小結(jié)
第5章 總結(jié)與展望
    5.1 研究總結(jié)
    5.2 研究展望
參考文獻
作者介紹及在學(xué)期間所取得的科研成果
致謝


【參考文獻】：
期刊論文
[1]Aberrant control of NF-κB in cancer permits transcriptional and phenotypic plasticity, to curtail dependence on host tissue: molecular mode[J]. Spiros A.Vlahopoulos.  Cancer Biology & Medicine. 2017(03)



本文編號：3645880