在沒有參考基因組的情況下,為了揭示川百合（Lilium davidii）在4℃處理下基因表達(dá)譜的變化,為百合抗寒育種、引種及栽培提供理論支撐及技術(shù)支持。采用高通量Illumina Hiseq測(cè)序平臺(tái)對(duì)川百合20℃（對(duì)照組）與4℃（處理組）溫度條件下進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,并對(duì)測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行了分析研究,進(jìn)一步探究川百合寒冷應(yīng)答的分子機(jī)制。結(jié)果表明,經(jīng)富集分析后得,與光合作用、光合作用-天線蛋白、光合生物體中的碳固定、葉綠素代謝等相關(guān)的基因可以作為研究川百合寒冷響應(yīng)機(jī)制的主要研究對(duì)象。實(shí)時(shí)熒光定量PCR（qRT-PCR）分析結(jié)果表明,隨機(jī)選出的10個(gè)差異性表達(dá)基因的表達(dá)趨勢(shì)與高通量測(cè)序結(jié)果一致。這為川百合響應(yīng)低溫相關(guān)基因的發(fā)掘與利用、川百合耐寒分子機(jī)制的揭示及百合種植資源遺傳改良奠定了基礎(chǔ)。 

【文章來(lái)源】：江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020,48(22)

【文章頁(yè)數(shù)】：9 頁(yè)

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 試驗(yàn)材料
    1.2 低溫脅迫處理
    1.3 指標(biāo)測(cè)定
        1.3.1 轉(zhuǎn)錄測(cè)序
        1.3.2 PCR驗(yàn)證
    1.4 數(shù)據(jù)分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 測(cè)序結(jié)果與Trinity拼接
    2.2 基因功能注釋結(jié)果
    2.3 基因表達(dá)差異分析
        2.3.1 GO富集分析
        2.3.2 KEGG富集分析
    2.4 qRT-PCR驗(yàn)證
3 討論與結(jié)論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]轉(zhuǎn)錄組測(cè)序研究蘭州百合抗凍關(guān)鍵基因及途徑[J]. 田雪慧,郁繼華,頡建明.  廣東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2019(08)
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[3]干旱脅迫及復(fù)水對(duì)入侵植物節(jié)節(jié)麥幼苗生長(zhǎng)及生理特性的影響[J]. 王寧,袁美麗,陳浩,李真真,張銘鑫.  草業(yè)學(xué)報(bào). 2019(01)
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[10]9個(gè)野生早熟禾對(duì)低溫脅迫的生理響應(yīng)及苗期抗寒性評(píng)價(jià)[J]. 呂優(yōu)偉,賀佳圓,白小明,董沁,雷婭偉.  草地學(xué)報(bào). 2014(02)

博士論文
[1]野生百合卷丹（Lilium lancifolium）響應(yīng)低溫信號(hào)的分子機(jī)制研究[D]. 王晶懋.北京林業(yè)大學(xué) 2015



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