本文關(guān)鍵詞：綿羊嗅覺受體（OR）和味覺受體（T1Rs）基因多態(tài)性研究，，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：哺乳動(dòng)物具有較敏感的嗅覺和味覺,在采食過程中可根據(jù)食物的氣味和味道選擇偏好性的食物。其中,嗅覺主要是在遠(yuǎn)距離內(nèi)通過空氣中的氣味尋找和辨別食物,味覺則是在口腔內(nèi)通過不同的味道和口感選擇食物。哺乳動(dòng)物的嗅覺和味覺分別由嗅覺受體和味覺受體基因決定,這些受體基因?qū)儆诓溉閯?dòng)物基因組中較大的基因家族。研究表明,在基因方面,動(dòng)物的嗅覺和味覺除了和受體基因的數(shù)量和假基因率有關(guān)外,與受體基因的多態(tài)性也密切相關(guān)。本研究選取同為中國(guó)蒙古系綿羊中以放牧為主的烏珠穆沁羊(96只)和以舍飼為主的湖羊(72只)為研究對(duì)象,對(duì)3個(gè)嗅覺受體基因OR4A47、OR4C46和OR4D1基因,以及味覺受體第一家族3個(gè)基因TAS1R1、TAS1R2和TAS1R3基因外顯子進(jìn)行序列擴(kuò)增和遺傳變異分析,揭示了綿羊這6個(gè)基因外顯子多態(tài)性和遺傳多樣性,及其在烏珠穆沁羊和湖羊遺傳差異性及對(duì)mRNA和蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)的影響。本研究的結(jié)果如下:1、采用DNA池和直接測(cè)序法對(duì)兩個(gè)綿羊品種的OR4A47、OR4C46、OR4D1、TAS1R1、TAS1R2和TAS1R3基因的遺傳變異情況進(jìn)行分析。在綿羊的3個(gè)嗅覺受體基因上共檢測(cè)到了26個(gè)突變位點(diǎn),其中OR4A47基因上8個(gè)SNPs,OR4C46基因上7個(gè)SNPs,OR4D1基因上11個(gè)SNPs,說明烏珠穆沁羊和湖羊在這3個(gè)嗅覺受體基因上具有較高的遺傳多態(tài)性。同時(shí),在綿羊的T1R家族基因中篩查到9個(gè)SNPs,其中,TAS1R1基因上2個(gè),TAS1R2基因上5個(gè),TAS1R3基因上1個(gè)。且這6個(gè)基因在兩個(gè)綿羊品種中檢測(cè)到的SNPs個(gè)數(shù)相同。2、利用飛行時(shí)間質(zhì)譜(MALDI-TOF MS)法對(duì)2個(gè)綿羊品種共172個(gè)個(gè)體的20個(gè)SNP位點(diǎn)進(jìn)行基因型分析,群體遺傳學(xué)分析結(jié)果表明,這20個(gè)SNPs位點(diǎn)在烏珠穆沁羊群體中的多態(tài)性較高。3、獨(dú)立性卡方檢驗(yàn)表明,3個(gè)OR基因上有6個(gè)位點(diǎn)的基因型分布在兩個(gè)綿羊群體間的分布存在顯著差異,分別為OR4A47基因上的snp4、OR4C46基因上的snp6、snp7和snp8;OR4D1基因上的snp9和snp11;對(duì)這6個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行連鎖不平衡分析發(fā)現(xiàn),OR4C46基因上的3個(gè)SNP位點(diǎn)與OR4D1基因上的2個(gè)SNPs位點(diǎn)同樣為完全連鎖;T1Rs基因上有5個(gè)多態(tài)位點(diǎn)基因型的分布在兩個(gè)綿羊群體中存在顯著性差異,分別為TAS1R1基因上的snp13,TAS1R2基因上的snp15、snp17和snp18,TAS1R3上的snp20。4、利用生物信息學(xué)軟件預(yù)測(cè)多態(tài)位點(diǎn)對(duì)研究基因mRNA二級(jí)結(jié)構(gòu)和蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)的影響。結(jié)果表明,在3個(gè)OR基因中,snp11為同義突變,導(dǎo)致mRNA二級(jí)結(jié)構(gòu)發(fā)生改變,snp4、snp6、snp7、snp8和snp9為錯(cuò)義突變,導(dǎo)致相應(yīng)蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)發(fā)生改變。在TIRs基因中,snp13、snp17和snp20為同義突變,其中snp13和snp20導(dǎo)致相應(yīng)基因mRNA二級(jí)結(jié)構(gòu)和最小自由能的改變;snp15和snp18為錯(cuò)義突變,均導(dǎo)致TAS1R2蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)均發(fā)生改變。綜上所述,OR4A47、OR4C46、OR4D1、TAS1R1、TAS1R2和TAS1R3基因在不同飼養(yǎng)方式綿羊品種間的多態(tài)性存在顯著性差異,部分位點(diǎn)可使mRNA和蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)發(fā)生改變,從而導(dǎo)致受體蛋白結(jié)合嗅覺、味覺分子的能力發(fā)生改變。
【關(guān)鍵詞】：綿羊 OR基因 T1Rs基因 多態(tài)性 遺傳多樣性 生物信息學(xué)
【學(xué)位授予單位】：甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號(hào)】：S826
【目錄】：

• 論文部分縮寫詞的中英文對(duì)照4-5
• 摘要5-7
• Summary7-12
• 第一章 文獻(xiàn)綜述12-25
• 1 嗅覺、味覺相關(guān)基因研究進(jìn)展12-21
• 1.1 嗅覺12-14
• 1.1.1 嗅覺受體12-13
• 1.1.2 嗅覺受體基因及表達(dá)13-14
• 1.2 味覺14-18
• 1.2.1 味覺受體15-16
• 1.2.2 味覺受體基因及表達(dá)16-17
• 1.2.3 味覺影響因素17-18
• 1.3 嗅覺、味覺受體基因在畜禽生產(chǎn)中的作用及多態(tài)性18-21
• 1.3.1 嗅覺、味覺在畜禽生產(chǎn)中的作用18-20
• 1.3.2 嗅覺、味覺受體基因多態(tài)性研究進(jìn)展20-21
• 2 烏珠穆沁羊和湖羊的相關(guān)背景21
• 3 單核苷酸多態(tài)性分型技術(shù)21-24
• 3.1 PCR-RFLP分型技術(shù)22
• 3.2 TaqMan探針分型技術(shù)22
• 3.3 Multiplex SNaPshot分型技術(shù)22-23
• 3.4 HRM法23
• 3.5 Illumina BeadXpress法23
• 3.6 飛行時(shí)間質(zhì)譜（MALDI-TOF MS）分型技術(shù)23-24
• 4 本研究目的與意義24-25
• 第二章 綿羊嗅覺受體和味覺受體基因多態(tài)性研究25-76
• 1 試驗(yàn)材料與方法25-36
• 1.1 試驗(yàn)材料25-27
• 1.1.1 樣品采集25
• 1.1.2 主要儀器設(shè)備25-26
• 1.1.3 主要試劑耗材26
• 1.1.4 主要溶液配制26
• 1.1.5 主要數(shù)據(jù)庫(kù)26
• 1.1.6 主要分子生物學(xué)軟件26-27
• 1.2 試驗(yàn)方法27-36
• 1.2.1 基因組DNA提取、檢測(cè)及DNA池構(gòu)建27-28
• 1.2.2 PCR引物設(shè)計(jì)與合成28-31
• 1.2.3 PCR擴(kuò)增與測(cè)序31
• 1.2.4 基因型檢測(cè)31-34
• 1.2.5 統(tǒng)計(jì)分析34-36
• 2 結(jié)果與分析36-67
• 2.1 基因多態(tài)性研究36-41
• 2.1.1 DNA提取與PCR擴(kuò)增36-37
• 2.1.2 序列測(cè)定及SNP鑒定37-41
• 2.2 群體遺傳學(xué)分析41-54
• 2.2.1 MALDI-TOF MS引物設(shè)計(jì)前SNP位點(diǎn)的篩選41-42
• 2.2.2 綿羊OR4A47、OR4C46和OR4D1基因群體遺傳學(xué)分析42-48
• 2.2.3 綿羊TAS1R1、TAS1R2和TAS1R3基因群體遺傳學(xué)分析48-54
• 2.3 群體間的遺傳差異分析54-59
• 2.3.1 OR基因群體間的遺傳差異分析54-56
• 2.3.2 T1Rs基因群體間的遺傳差異分析56-59
• 2.4 生物信息學(xué)分析59-67
• 2.4.1 OR4A47、OR4C46和OR4D1基因mRNA二級(jí)結(jié)構(gòu)分析59-61
• 2.4.2 OR4A47、OR4C46和OR4D1蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)分析61-63
• 2.4.3 TAS1R1、TAS1R2和TAS1R3基因mRNA二級(jí)結(jié)構(gòu)分析63-65
• 2.4.4 TAS1R2蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)分析65-67
• 3 討論67-74
• 3.1 關(guān)于基因多態(tài)性檢測(cè)67-68
• 3.1.1 綿羊OR基因多態(tài)性67-68
• 3.1.2 T1Rs基因多態(tài)性68
• 3.2 關(guān)于受體基因遺傳多樣性分析68-70
• 3.2.1 綿羊OR基因遺傳多樣性分析68-69
• 3.2.2 綿羊T1Rs基因遺傳多樣性分析69-70
• 3.3 關(guān)于受體基因群體間遺傳差異性遺傳分化性分析70-71
• 3.3.1 綿羊OR基因群體間遺傳差異性分析70
• 3.3.2 綿羊T1Rs基因群體間遺傳差異性分析70-71
• 3.4 關(guān)于生物信息學(xué)分析71-72
• 3.4.1 綿羊OR基因生物信息學(xué)分析71
• 3.4.2 綿羊T1Rs基因生物信息學(xué)分析71-72
• 3.5 受體基因多態(tài)性與采食相關(guān)性分析72-74
• 4 結(jié)論74-76
• 4.1 本研究結(jié)論74
• 4.2 本研究的創(chuàng)新點(diǎn)與特色74-75
• 4.3 本研究的不足之處及進(jìn)一步值得研究的工作75-76
• 參考文獻(xiàn)76-86
• 致謝86-87
• 個(gè)人簡(jiǎn)介87-88
• 導(dǎo)師簡(jiǎn)介88-89
• 附錄1 綿羊TAS1R1基因外顯子序列89-91
• 附錄2 綿羊TAS1R2基因外顯子序列91-93
• 附錄3 綿羊TAS1R3基因外顯子序列93-95
• 附錄4 綿羊OR4A47基因外顯子序列95-96
• 附錄5 綿羊OR4C46基因外顯子序列96-97
• 附錄6 綿羊OR4D1基因外顯子序列97-98

【相似文獻(xiàn)】

中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條

1 軒俊麗;綿羊嗅覺受體（OR）和味覺受體（T1Rs）基因多態(tài)性研究[D];甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué);2016年

  本文關(guān)鍵詞：綿羊嗅覺受體（OR）和味覺受體（T1Rs）基因多態(tài)性研究，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

本文編號(hào)：281926