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基于安全多方計(jì)算的分布式基因序列相似性計(jì)算

發(fā)布時(shí)間:2017-03-31 17:03

  本文關(guān)鍵詞:基于安全多方計(jì)算的分布式基因序列相似性計(jì)算,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


【摘要】:編輯距離作為一種重要的相似性度量方法被廣泛應(yīng)用于基因序列的相關(guān)分析研究中。針對(duì)現(xiàn)有的安全基因序列編輯距離計(jì)算方案效率很低沒(méi)有實(shí)用性的問(wèn)題,利用基于秘密共享理論Goldreich-Micali-Wigderson(GMW)的安全多方計(jì)算協(xié)議(secure multiparty computation,SMC)設(shè)計(jì)了一個(gè)安全的分布式基因序列近似編輯距離計(jì)算方案。它能夠使多個(gè)參與單位同時(shí)進(jìn)行序列之間的距離計(jì)算而不泄露任何一方的基因數(shù)據(jù)信息。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,該方案能夠安全有效地實(shí)現(xiàn)分布式的基因序列相似性計(jì)算。
【作者單位】: 西北農(nóng)林科技大學(xué)信息工程學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】編輯距離 安全多方計(jì)算 信息安全 基因序列對(duì)比 隱私保護(hù)分析 分布式計(jì)算
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金面上資助項(xiàng)目(61271280) 國(guó)家青年科學(xué)基金資助項(xiàng)目(61001100)
【分類(lèi)號(hào)】:Q811.4;TP309
【正文快照】: 0引言人類(lèi)基因組數(shù)據(jù)的迅速產(chǎn)生和累積使科研工作者可以容易地訪(fǎng)問(wèn)大量基因序列數(shù)據(jù)集。一些科技公司如華大基因[1]、23 and Me[2]已經(jīng)開(kāi)始提供面向用戶(hù)的測(cè)序和DNA特征提取服務(wù)。在學(xué)術(shù)研究領(lǐng)域,科學(xué)家們正在努力建立更多的開(kāi)放基因數(shù)據(jù)存儲(chǔ)平臺(tái),如PGP(personal genome proje

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本文編號(hào):279846

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