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馬氏珠母貝載脂蛋白基因Pm-APOL3克

發(fā)布時間:2018-05-17 14:29

  本文選題:馬氏珠母貝 + 載脂蛋白L ; 參考:《基因組學與應(yīng)用生物學》2016年07期


【摘要】:Apolipoprotein L3(APOL3)是新發(fā)現(xiàn)的一種高密度脂蛋白,屬于載脂蛋白L基因家族的成員之一,具有運載脂類物質(zhì)進行生化代謝的功能。本研究利用c DNA末端快速擴增技術(shù)獲得了馬氏珠母貝APOL3基因(Pm-APOL3)c DNA全長序列,分析其序列及功能特征,檢測Pm-APOL3基因在不同組織的表達,并分析了金黃殼色群體與養(yǎng)殖群體類胡蘿卜素含量與Pm-APOL3基因表達量的相關(guān)性。結(jié)果表示,Pm-APOL3基因c DNA全長874 bp,開放閱讀框(ORF)為357 bp,編碼118個氨基酸,包含475 bp的5'UTR,42 bp的3'UTR,相對分子量為12.795 5 ku,等電點為4.71。該蛋白質(zhì)的不穩(wěn)定指數(shù)為34.09,屬于穩(wěn)定蛋白質(zhì),疏水性分析表明其親水性平均系數(shù)為0.74,屬疏水蛋白,信號肽預(yù)測結(jié)果表示其不含信號肽,為非分泌蛋白。熒光定量PCR分析表明Pm-APOL3基因在鰓、外套膜、閉殼肌與肝胰臟均有表達,其中肝胰臟表達量顯著大于其它三個組織(p0.05)。金黃殼色群體類胡蘿卜素含量與Pm-APOL3基因表達量均顯著大于養(yǎng)殖群體(p0.05)。本研究結(jié)果表明Pm-APOL3是參與馬氏珠母貝類胡蘿卜素代謝重要基因。
[Abstract]:Apolipoprotein L3 / APOL3 is a newly discovered high density lipoprotein, which belongs to the apolipoprotein L gene family and has the function of carrying lipid substances for biochemical metabolism. In this study, the full-length of APOL3 gene Pm-APOL3C DNA was obtained by rapid amplification of c DNA terminal, and its sequence and functional characteristics were analyzed, and the expression of Pm-APOL3 gene in different tissues was detected. The correlation between carotenoid content and Pm-APOL3 gene expression was analyzed. The results showed that the total length of c DNA of Pm-APOL3 gene was 874bp.The open reading frame (ORF) was 357bp, encoding 118 amino acids, containing 475bp of 5- UTR4bp, with a relative molecular weight of 12.795 5kuand an isoelectric point of 4.71. The instability index of this protein is 34.09, which belongs to stable protein. The hydrophobic average coefficient of the protein is 0.74, which is hydrophobic protein. The prediction result of signal peptide indicates that the protein is non-secretory protein without signal peptide. Fluorescence quantitative PCR analysis showed that Pm-APOL3 gene was expressed in Gill, mantle, obturator muscle and hepatopancreas. The expression of Pm-APOL3 gene in hepatopancreas was significantly higher than that in the other three tissues. The content of carotenoid and the expression of Pm-APOL3 gene in golden shell color population were significantly higher than that in cultured population. The results suggest that Pm-APOL3 is an important gene involved in carotenoid metabolism of Eucalyptus martensii.
【作者單位】: 廣東海洋大學水產(chǎn)學院;廣東省珍珠養(yǎng)殖與加工工程技術(shù)研究中心;
【基金】:廣東省科技廳項目“近江牡蠣三倍體優(yōu)質(zhì)苗種及馬氏珠母貝新品種培育技術(shù)研究與開發(fā)”(2013B020201002) 廣東省海洋與漁業(yè)局科技專項“馬氏珠母貝優(yōu)質(zhì)抗逆選系苗種規(guī);庇c示范養(yǎng)殖”(Z2014009) 2015年廣東海洋大學“海之帆-起航計劃”大學生科技創(chuàng)新項目“馬氏珠母貝類胡蘿卜素與相關(guān)基因表達量在關(guān)聯(lián)分析”;2015年廣東海洋大學水產(chǎn)學院創(chuàng)新項目“馬氏珠母貝類胡蘿卜富集機理分析”共同資助
【分類號】:S917.4

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