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基于CPU-GPU加速的擴(kuò)散光學(xué)斷層成像軟件框架設(shè)計(jì)與實(shí)現(xiàn)

發(fā)布時(shí)間:2020-10-16 03:57
   擴(kuò)散光學(xué)斷層成像(Diffuse optical tomography,DOT)是一種新型近紅外組織功能成像技術(shù),和傳統(tǒng)成像技術(shù)相比,具有特異性強(qiáng)、成本低、無侵害等優(yōu)點(diǎn)。DOT在乳腺癌早期檢測(cè)、新輔助化療、藥物療效在體評(píng)估等領(lǐng)域有著較好的應(yīng)用前景。然而,DOT重建是一個(gè)復(fù)雜的數(shù)學(xué)迭代過程,其運(yùn)算量非常大。本文工作圍繞如何準(zhǔn)確以及高效地重建光學(xué)參數(shù)進(jìn)行展開,主要包含如下三個(gè)方面:1.DOT重建算法設(shè)計(jì)。根據(jù)DOT重建原理,設(shè)計(jì)了重建算法的實(shí)現(xiàn)方案;谟邢拊(Finite Element Method,FEM)針對(duì)連續(xù)波(Continuous Wave,CW)以及頻域(Frequency Domain,FD)DOT重建過程中正向與逆向問題,設(shè)計(jì)了剛度矩陣運(yùn)算、雅克比矩陣運(yùn)算、光源向量計(jì)算以及節(jié)點(diǎn)光子密度求解等過程的計(jì)算方案。2.DOT加速方案設(shè)計(jì)。根據(jù)重建算法的可并行性,提出了連續(xù)波DOT以及頻域DOT重建的加速方案,并進(jìn)行驗(yàn)證;谥醒胩幚韱卧(Central Processing Unit,CPU),圖形處理單元(Graphic Processing Unit,GPU)對(duì)DOT重建中的剛度矩陣計(jì)算部分、雅克比矩陣計(jì)算部分、更新量計(jì)算部分進(jìn)行加速,獲得了較大的加速比,在三維連續(xù)波DOT重建中,當(dāng)重建網(wǎng)格含有61322個(gè)節(jié)點(diǎn),使用5292對(duì)源-探測(cè)器對(duì)時(shí)加速比為22.50;在三維頻域DOT重建中,當(dāng)重建網(wǎng)格含有61322個(gè)節(jié)點(diǎn),使用2916對(duì)源-探測(cè)器對(duì)時(shí)加速比為17.78。3.DOT重建軟件開發(fā)。基于Visual Studio平臺(tái)上開發(fā)出一套用于DOT重建的C++版本軟件。該軟件功能廣泛,可以實(shí)現(xiàn)二維連續(xù)波、三維連續(xù)波、二維頻域、三維頻域重建;通過多組連續(xù)波、頻域仿真以及仿體實(shí)驗(yàn)對(duì)該軟件的重建精度進(jìn)行了驗(yàn)證,證明其具有較高的重建精度;另外,在不同的重建問題規(guī)模、不同重建類型條件下,本文使用常用的DOT重建軟件NIRFAST(Near Infrared Fluorescence and Spectral Tomography)與本軟件進(jìn)行速度對(duì)比實(shí)驗(yàn),結(jié)果表明本軟件在不同的實(shí)驗(yàn)條件下均比NIRFAST快10倍以上。
【學(xué)位單位】:西安電子科技大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位年份】:2019
【中圖分類】:TP391.41;TP332
【部分圖文】:

示意圖,成像探測(cè),過程,示意圖


DOT成像探測(cè)過程示意圖

示意圖,時(shí)域測(cè)量,測(cè)量方式,正向問題


DOT 三種測(cè)量方式示意圖 (a)連續(xù)波測(cè)量,(b)時(shí)域測(cè)量,OT 重建方法涉及正向問題和逆向問題。正向問題描述的是近紅之后最終到達(dá)探測(cè)器的過程。逆向問題描述的是通

模型圖,組織體,實(shí)際傳輸,模型


光在組織體中的實(shí)際傳輸模型
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