黃渤海日本鰻草(Zostera japonica)根際細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)及時空分布特征
發(fā)布時間:2023-04-20 20:31
海草床是藍(lán)碳的重要組成,然而多種人為及自然因素導(dǎo)致海草床在全球范圍內(nèi)大幅度退化,中國海草亦未能幸免。良好的微生物群落結(jié)構(gòu)會增強(qiáng)植物對環(huán)境的適應(yīng)性,結(jié)構(gòu)失衡則會導(dǎo)致植物的致病衰亡。目前,我們對海草床根際沉積物中細(xì)菌多樣性及群落結(jié)構(gòu)的了解較為匱乏,尤其是根際微生物隨時間和空間變化的演替規(guī)律。本研究分別在2017年至2018年間的春(4月)夏(8月)秋(10月)冬(1月)四季,于東營墾利區(qū)、大連長?h和威海榮成市三地采集日本鰻草(Zostera japonica)根際及無海草定植的沉積物樣品。采用16S rRNA高通量測序分析細(xì)菌群落組成和結(jié)構(gòu)。研究結(jié)果顯示根際細(xì)菌種群豐富,其中變形菌門(42.8%)、擬桿菌門(17.6%)、放線菌門(8.1%)、藍(lán)細(xì)菌門(7%)是最主要類群;一方面,優(yōu)勢類群會隨季節(jié)而演替,放線菌門、綠彎菌門、擬桿菌門、芽單胞菌門的相對豐度分別在春、夏、秋、冬季達(dá)到最高值;另一方面,群落組成還會受到區(qū)域和樣品類型(有無海草定植)的影響,例如Patescibacteria菌門在東營的相對豐度最高,綠彎菌門和變形菌門分別是根際和非根際的主要類群之一。α多樣性分析顯示樣品內(nèi)的物種...
【文章頁數(shù)】:79 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
abstract
第一章 引言
1.1 海草床生態(tài)系統(tǒng)
1.1.1 海草及其生態(tài)學(xué)價值
1.1.2 全球海草退化現(xiàn)狀
1.1.3 我國海草床及其退化狀況
1.2 國內(nèi)外海草床研究進(jìn)展
1.2.1 國外海草研究進(jìn)展
1.2.2 國內(nèi)研究進(jìn)展
1.3 根際微生物及日本鰻草
1.3.1 根際及根際微生物的功能
1.3.2 海草根際微生物多樣性研究意義
1.3.3 理化因素對細(xì)菌多樣性的影響
1.3.4 日本鰻草(Zostera japonica)
1.4 海洋微生物研究方法
1.4.1 分子生物學(xué)方法
1.4.2 PICRUSt基因分析
1.5 主要研究內(nèi)容及技術(shù)路線
1.5.1 主要研究內(nèi)容
1.5.2 技術(shù)路線
第二章 研究區(qū)域概況和方法
2.1 研究區(qū)域概況
2.1.1 東營海草床概況
2.1.2 天鵝湖海草床概況
2.1.3 大連海草床概況
2.2 實驗材料和儀器
2.3 實驗方法
2.3.1 樣品采集與處理
2.3.2 沉積物理化因子測定
2.3.3 DNA提取
2.3.4 PCR擴(kuò)增
2.3.5 構(gòu)建文庫和高通量測序
2.3.6 數(shù)據(jù)處理與統(tǒng)計分析
第三章 結(jié)果
3.1 海草床沉積物細(xì)菌群落組成
3.2 細(xì)菌α多樣性
3.3 細(xì)菌β多樣性
3.4 沉積物物理化學(xué)性質(zhì)
3.5 細(xì)菌群落與環(huán)境變量的關(guān)系
3.6 沉積物細(xì)菌功能預(yù)測
第四章 討論
4.1 時空及海草定植對細(xì)菌群落組成影響
4.2 時空及海草定植對α多樣性的影響
4.3 時空及海草定植對β多樣性的影響
4.4 不同地點、生長階段、樣品類型(根際非根際)沉積物理化性質(zhì)不同
4.5 細(xì)菌功能預(yù)測分析
第五章 結(jié)論與展望
5.1 結(jié)論
5.2 創(chuàng)新性
5.3 展望
參考文獻(xiàn)
致謝
作者簡歷及攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文與研究成果
本文編號:3795240
【文章頁數(shù)】:79 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
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第一章 引言
1.1 海草床生態(tài)系統(tǒng)
1.1.1 海草及其生態(tài)學(xué)價值
1.1.2 全球海草退化現(xiàn)狀
1.1.3 我國海草床及其退化狀況
1.2 國內(nèi)外海草床研究進(jìn)展
1.2.1 國外海草研究進(jìn)展
1.2.2 國內(nèi)研究進(jìn)展
1.3 根際微生物及日本鰻草
1.3.1 根際及根際微生物的功能
1.3.2 海草根際微生物多樣性研究意義
1.3.3 理化因素對細(xì)菌多樣性的影響
1.3.4 日本鰻草(Zostera japonica)
1.4 海洋微生物研究方法
1.4.1 分子生物學(xué)方法
1.4.2 PICRUSt基因分析
1.5 主要研究內(nèi)容及技術(shù)路線
1.5.1 主要研究內(nèi)容
1.5.2 技術(shù)路線
第二章 研究區(qū)域概況和方法
2.1 研究區(qū)域概況
2.1.1 東營海草床概況
2.1.2 天鵝湖海草床概況
2.1.3 大連海草床概況
2.2 實驗材料和儀器
2.3 實驗方法
2.3.1 樣品采集與處理
2.3.2 沉積物理化因子測定
2.3.3 DNA提取
2.3.4 PCR擴(kuò)增
2.3.5 構(gòu)建文庫和高通量測序
2.3.6 數(shù)據(jù)處理與統(tǒng)計分析
第三章 結(jié)果
3.1 海草床沉積物細(xì)菌群落組成
3.2 細(xì)菌α多樣性
3.3 細(xì)菌β多樣性
3.4 沉積物物理化學(xué)性質(zhì)
3.5 細(xì)菌群落與環(huán)境變量的關(guān)系
3.6 沉積物細(xì)菌功能預(yù)測
第四章 討論
4.1 時空及海草定植對細(xì)菌群落組成影響
4.2 時空及海草定植對α多樣性的影響
4.3 時空及海草定植對β多樣性的影響
4.4 不同地點、生長階段、樣品類型(根際非根際)沉積物理化性質(zhì)不同
4.5 細(xì)菌功能預(yù)測分析
第五章 結(jié)論與展望
5.1 結(jié)論
5.2 創(chuàng)新性
5.3 展望
參考文獻(xiàn)
致謝
作者簡歷及攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文與研究成果
本文編號:3795240
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