基于綜合毒性作用模式分類構(gòu)建有機化合物對大型蚤急性毒性QSAR模型
發(fā)布時間:2023-02-14 20:49
化學品對水生生物的毒理信啟,是化學品風險評價和優(yōu)先污染物篩選的關(guān)鍵指標之一。毒理信息通常通過毒理實驗獲得,然而傳統(tǒng)的毒理實驗往往存在一些弊端,如耗費大量的人力財力,違背動物實驗3R原則等。因此,發(fā)展替代動物實驗的預測方法具有重要意義。定量結(jié)構(gòu)-活性關(guān)系(QSAR)能夠基于化合物的分子結(jié)構(gòu)參數(shù)對其理化性質(zhì)、環(huán)境行為參數(shù)和毒理學效應進行預測,是目前應用較為廣泛,被認為有應用前景的技術(shù)之一。化合物的毒性作用除受化合物結(jié)構(gòu)的影響外,還同化合物與受體之間的相互作用有關(guān),因此,基于毒性作用模式(MOA)構(gòu)建水生生物急性毒性QSAR模型是目前較為認可的研究方法。本文基于多種毒性MOA對化合物進行分類,以大型蚤48小時半數(shù)效應濃度(EC50)為毒性終點,依照經(jīng)濟合作與發(fā)展組織(OECD)提出的有關(guān)QSAR構(gòu)建和使用導則構(gòu)建了化學品對大型蚤急性毒性的QSAR模型,對模型性能和應用域進行了表征,對模型機理進行了解釋。主要研究內(nèi)容和結(jié)果如下:(1)選取961個化合物的大型蚤急性毒性數(shù)據(jù),根據(jù)Verhaar等提出的分類機制將化合物分成五類,采用多元線性回歸(MLR)的方法構(gòu)建了化合物對大型蚤急性毒性的QSAR...
【文章頁數(shù)】:91 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
引言
1 水生生物急性毒性QSAR模型研究進展及選題依據(jù)
1.1 化學品風險評價信息需求
1.2 QSAR模型構(gòu)建的方法及評價指標
1.2.1 QSAR的概念與意義
1.2.2 QSAR的構(gòu)建方法
1.2.3 QSAR模型的評價指標
1.2.4 QSAR模型的應用域(AD)
1.3 水生生物急性毒性QSAR模型的研究進展
1.3.1 基于同類化合物構(gòu)建模型
1.3.2 基于數(shù)理統(tǒng)計構(gòu)建模型
1.3.3 基于毒性作用機制構(gòu)建模型
1.4 研究目的、內(nèi)容與技術(shù)路線
1.4.1 研究目的與內(nèi)容
1.4.2 技術(shù)路線
2 基于Verhaar分類方法構(gòu)建大型蚤急性毒性QSAR模型
2.1 引言
2.2 材料與方法
2.2.1 數(shù)據(jù)搜集與分類
2.2.2 分子結(jié)構(gòu)描述符的計算
2.2.3 模型的構(gòu)建與表征
2.3 結(jié)果與討論
2.3.1 魚和大型蚤種間關(guān)系研究
2.3.2 Class 1模型結(jié)果
2.3.3 Class 2模型結(jié)果
2.3.4 Class 3模型結(jié)果
2.3.5 Class 4模型結(jié)果
2.3.6 Class 5模型結(jié)果
2.4 小結(jié)
3 基于綜合分類方法構(gòu)建大型蚤急性毒性QSAR模型
3.1 引言
3.2 材料與方法
3.2.1 數(shù)據(jù)搜集與分類
3.2.2 分子結(jié)構(gòu)描述符的計算與模型構(gòu)建
3.3 結(jié)果與討論
3.3.1 綜合的毒性作用模式分類方法
3.3.2 Class 1模型結(jié)果
3.3.3 Class 2模型結(jié)果
3.3.4 Class 3模型結(jié)果
3.4 小結(jié)
4 不同算法構(gòu)建QSAR模型以及模型比較
4.1 引言
4.2 材料與方法
4.2.1 數(shù)據(jù)搜集
4.2.2 分子結(jié)構(gòu)描述符的計算與模型構(gòu)建
4.3 結(jié)果與討論
4.3.1 GA模型及表征結(jié)果
4.3.2 SVM模型結(jié)果
4.4 模型比較
4.4.1 基于不同分類和算法的模型比較
4.4.2 與前人構(gòu)建的模型比較
4.5 小結(jié)
結(jié)論
參考文獻
附錄
攻讀碩士學位期間發(fā)表學術(shù)論文情況
致謝
本文編號:3743001
【文章頁數(shù)】:91 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
引言
1 水生生物急性毒性QSAR模型研究進展及選題依據(jù)
1.1 化學品風險評價信息需求
1.2 QSAR模型構(gòu)建的方法及評價指標
1.2.1 QSAR的概念與意義
1.2.2 QSAR的構(gòu)建方法
1.2.3 QSAR模型的評價指標
1.2.4 QSAR模型的應用域(AD)
1.3 水生生物急性毒性QSAR模型的研究進展
1.3.1 基于同類化合物構(gòu)建模型
1.3.2 基于數(shù)理統(tǒng)計構(gòu)建模型
1.3.3 基于毒性作用機制構(gòu)建模型
1.4 研究目的、內(nèi)容與技術(shù)路線
1.4.1 研究目的與內(nèi)容
1.4.2 技術(shù)路線
2 基于Verhaar分類方法構(gòu)建大型蚤急性毒性QSAR模型
2.1 引言
2.2 材料與方法
2.2.1 數(shù)據(jù)搜集與分類
2.2.2 分子結(jié)構(gòu)描述符的計算
2.2.3 模型的構(gòu)建與表征
2.3 結(jié)果與討論
2.3.1 魚和大型蚤種間關(guān)系研究
2.3.2 Class 1模型結(jié)果
2.3.3 Class 2模型結(jié)果
2.3.4 Class 3模型結(jié)果
2.3.5 Class 4模型結(jié)果
2.3.6 Class 5模型結(jié)果
2.4 小結(jié)
3 基于綜合分類方法構(gòu)建大型蚤急性毒性QSAR模型
3.1 引言
3.2 材料與方法
3.2.1 數(shù)據(jù)搜集與分類
3.2.2 分子結(jié)構(gòu)描述符的計算與模型構(gòu)建
3.3 結(jié)果與討論
3.3.1 綜合的毒性作用模式分類方法
3.3.2 Class 1模型結(jié)果
3.3.3 Class 2模型結(jié)果
3.3.4 Class 3模型結(jié)果
3.4 小結(jié)
4 不同算法構(gòu)建QSAR模型以及模型比較
4.1 引言
4.2 材料與方法
4.2.1 數(shù)據(jù)搜集
4.2.2 分子結(jié)構(gòu)描述符的計算與模型構(gòu)建
4.3 結(jié)果與討論
4.3.1 GA模型及表征結(jié)果
4.3.2 SVM模型結(jié)果
4.4 模型比較
4.4.1 基于不同分類和算法的模型比較
4.4.2 與前人構(gòu)建的模型比較
4.5 小結(jié)
結(jié)論
參考文獻
附錄
攻讀碩士學位期間發(fā)表學術(shù)論文情況
致謝
本文編號:3743001
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