外源性化合物在魚體內(nèi)生物半減期的QSAR模型的構(gòu)建
發(fā)布時(shí)間:2021-09-01 04:59
隨著社會(huì)的發(fā)展,越來(lái)越多的外源性化合物伴隨人類活動(dòng)進(jìn)入環(huán)境,水生態(tài)系統(tǒng)是在人類的生活環(huán)境中起著十分重要的作用,而魚是水生態(tài)系統(tǒng)的重要生物,因此評(píng)價(jià)外源性化合物在魚體內(nèi)的蓄積作用,對(duì)生態(tài)風(fēng)險(xiǎn)評(píng)價(jià)具有重要意義。生物半減期(t1/2)是評(píng)價(jià)這種蓄積作用的重要參數(shù),現(xiàn)有化合物種類已超過(guò)14萬(wàn)種,然而大部分化合物魚體t1/2實(shí)測(cè)值缺失。實(shí)驗(yàn)測(cè)定t1/2的速度慢、成本高,很難滿足對(duì)化合物進(jìn)行生態(tài)風(fēng)險(xiǎn)評(píng)價(jià)的需求,需要發(fā)展替代實(shí)驗(yàn)的模型預(yù)測(cè)方法。本研究基于定量構(gòu)效關(guān)系(QSAR),依據(jù)經(jīng)濟(jì)合作與發(fā)展組織(OECD)對(duì)于QSAR建模的導(dǎo)則構(gòu)建了預(yù)測(cè)化合物魚體t1/2的通用和局域模型,具體研究工作如下:(1)本研究搜集了653種化合物魚體t1/2實(shí)測(cè)值,構(gòu)建QSAR模型的化合物三維分子結(jié)構(gòu)采用Gaussian 09優(yōu)化,Dragon6.0軟件計(jì)算優(yōu)化后的分子結(jié)構(gòu)描述符,將化合物按照2:1的比例分成訓(xùn)練集和驗(yàn)證集,采用多元線性回歸(MLR)和支持向量機(jī)(SVM)兩種方法,分別建立了魚體t1...
【文章來(lái)源】:大連理工大學(xué)遼寧省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:67 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
引言
1 生物半減期QSAR模型的研究進(jìn)展
1.1 外源性化合物的生物半減期
1.1.1 外源性化合物蓄積毒性概述
1.1.2 生物半減期
1.1.3 生物半減期實(shí)驗(yàn)測(cè)定方法
1.2 外源性化合物定量構(gòu)效關(guān)系(QSAR)模型
1.2.1 定量構(gòu)效關(guān)系概述
1.2.2 QSAR模型的構(gòu)建
1.2.3 QSAR模型性能評(píng)價(jià)
1.2.4 QSAR模型的優(yōu)點(diǎn)及應(yīng)用
1.3 外源性化合物生物半減期QSAR模型研究進(jìn)展
1.3.1 通用QSAR模型
1.3.2 局域QSAR模型
1.4 選題依據(jù)、研究目的和內(nèi)容
1.4.1 選題依據(jù)
1.4.2 研究目的和內(nèi)容
1.4.3 技術(shù)路線
2 外源性化合物魚體內(nèi)生物半減期的QSAR模型
2.1 引言
2.2 數(shù)據(jù)與方法
2.2.1 數(shù)據(jù)搜集及分子結(jié)構(gòu)描述符計(jì)算
2.2.2 模型構(gòu)建和評(píng)價(jià)
2.3 結(jié)果與討論
2.3.1 預(yù)測(cè)模型
2.3.2 應(yīng)用域表征
2.3.3 模型解釋
2.3.4 模型比較
2.4 本章小結(jié)
3 化合物魚體內(nèi)生物半減期局域QSAR模型
3.1 引言
3.1.1 多鹵代芳香烴概述
3.1.2 有機(jī)磷化合物概述
3.2 數(shù)據(jù)與方法
3.2.1 數(shù)據(jù)搜集及分子結(jié)構(gòu)描述符計(jì)算
3.2.2 模型構(gòu)建和評(píng)價(jià)
3.3 結(jié)果與討論
3.3.1 多鹵代芳香烴預(yù)測(cè)模型
3.3.2 多鹵代芳香烴模型應(yīng)用域表征
3.3.3 多鹵代芳香烴模型機(jī)理解釋
3.3.4 有機(jī)磷化合物預(yù)測(cè)模型
3.3.5 有機(jī)磷化合物預(yù)測(cè)模型應(yīng)用域表征
3.3.6 有機(jī)磷化合物預(yù)測(cè)模型機(jī)理解釋
3.3.7 模型比較
3.4 本章小結(jié)
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄A 構(gòu)建QSAR模型的化合物信息
攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表學(xué)術(shù)論文情況
致謝
本文編號(hào):3376306
【文章來(lái)源】:大連理工大學(xué)遼寧省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:67 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
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摘要
Abstract
引言
1 生物半減期QSAR模型的研究進(jìn)展
1.1 外源性化合物的生物半減期
1.1.1 外源性化合物蓄積毒性概述
1.1.2 生物半減期
1.1.3 生物半減期實(shí)驗(yàn)測(cè)定方法
1.2 外源性化合物定量構(gòu)效關(guān)系(QSAR)模型
1.2.1 定量構(gòu)效關(guān)系概述
1.2.2 QSAR模型的構(gòu)建
1.2.3 QSAR模型性能評(píng)價(jià)
1.2.4 QSAR模型的優(yōu)點(diǎn)及應(yīng)用
1.3 外源性化合物生物半減期QSAR模型研究進(jìn)展
1.3.1 通用QSAR模型
1.3.2 局域QSAR模型
1.4 選題依據(jù)、研究目的和內(nèi)容
1.4.1 選題依據(jù)
1.4.2 研究目的和內(nèi)容
1.4.3 技術(shù)路線
2 外源性化合物魚體內(nèi)生物半減期的QSAR模型
2.1 引言
2.2 數(shù)據(jù)與方法
2.2.1 數(shù)據(jù)搜集及分子結(jié)構(gòu)描述符計(jì)算
2.2.2 模型構(gòu)建和評(píng)價(jià)
2.3 結(jié)果與討論
2.3.1 預(yù)測(cè)模型
2.3.2 應(yīng)用域表征
2.3.3 模型解釋
2.3.4 模型比較
2.4 本章小結(jié)
3 化合物魚體內(nèi)生物半減期局域QSAR模型
3.1 引言
3.1.1 多鹵代芳香烴概述
3.1.2 有機(jī)磷化合物概述
3.2 數(shù)據(jù)與方法
3.2.1 數(shù)據(jù)搜集及分子結(jié)構(gòu)描述符計(jì)算
3.2.2 模型構(gòu)建和評(píng)價(jià)
3.3 結(jié)果與討論
3.3.1 多鹵代芳香烴預(yù)測(cè)模型
3.3.2 多鹵代芳香烴模型應(yīng)用域表征
3.3.3 多鹵代芳香烴模型機(jī)理解釋
3.3.4 有機(jī)磷化合物預(yù)測(cè)模型
3.3.5 有機(jī)磷化合物預(yù)測(cè)模型應(yīng)用域表征
3.3.6 有機(jī)磷化合物預(yù)測(cè)模型機(jī)理解釋
3.3.7 模型比較
3.4 本章小結(jié)
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄A 構(gòu)建QSAR模型的化合物信息
攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表學(xué)術(shù)論文情況
致謝
本文編號(hào):3376306
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