酚類化合物是一種重要的化工原料,廣泛應(yīng)用于多種行業(yè),如農(nóng)藥和有機(jī)合成等,其能夠在生物體內(nèi)富集、在環(huán)境中遷移、毒性較強(qiáng)、不易生物降解,嚴(yán)重危害生態(tài)環(huán)境。因此,本文利用三維定量構(gòu)效關(guān)系模型（3D-QSAR）和分子對接技術(shù)研究酚類化合物的生物富集性以及設(shè)計(jì)低生物富集性酚類衍生物�；�36種酚類化合物生物富集因子對數(shù)（logBCF）數(shù)據(jù),借助比較分子相似性指數(shù)分析法（CoMSIA）和比較分子立場分析法（CoMFA）構(gòu)建3D-QSAR模型,對250種酚類化合物的logBCF進(jìn)行預(yù)測的同時(shí),以五氯酚（PCP）為例分析其CoMSIA模型三維等勢圖。由結(jié)果可知,兩種模型都能很好的預(yù)測酚類化合物的logBCF值,靜電場對酚類生物富集性的影響較大;在PCP的R2、R6位點(diǎn)處引入電負(fù)性較小基團(tuán)可顯著降低化合物的logBCF值。此外,PCP與超氧化物歧化酶（SOD）的結(jié)合可導(dǎo)致PCP在生物體內(nèi)的蓄積量減少,從而其在生物體內(nèi)的生物富集性降低。利用分子對接方法將PCP分別與8種SOD進(jìn)行對接,從氫鍵相互作用以及氨基酸殘基兩方面分析PCP生物富集性降低機(jī)制。由結(jié)果可知,PCP生物富集性的降低與PCP與SOD的結(jié)合有... 

【文章來源】：華北電力大學(xué)(北京)北京市 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：73 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
第1章 緒論
    1.1 選題背景及其意義
        1.1.1 酚類化合物性質(zhì)、環(huán)境污染及危害
        1.1.2 研究意義
    1.2 國內(nèi)外研究現(xiàn)狀
        1.2.1 3D-QSAR模型國內(nèi)外研究現(xiàn)狀
        1.2.2 分子對接技術(shù)國內(nèi)外研究現(xiàn)狀
        1.2.3 酚類化合物生物富集性國內(nèi)外研究現(xiàn)狀
        1.2.4 基于3D-QSAR模型的分子設(shè)計(jì)方法國內(nèi)外研究現(xiàn)狀
    1.3 存在的問題
    1.4 本文主要研究內(nèi)容及意義
第2章 計(jì)算軟件及方法
    2.1 SYBYL軟件簡介
    2.2 3D-QSAR建模方法
        2.2.1 CoMFA建模方法簡介
        2.2.2 CoMSIA建模方法簡介
        2.2.3 模型穩(wěn)定性和可靠性評價(jià)
        2.2.4 模型三維等勢圖分析
    2.3 分子對接方法
        2.3.1 分子對接方法簡介
        2.3.2 分子對接過程
        2.3.3 分子對接結(jié)果評價(jià)
第3章 基于3D-QSAR模型的酚類生物富集性模型
    3.1 模型數(shù)據(jù)來源
    3.2 生物富集性3D-QSAR模型
        3.2.1 酚類化合物構(gòu)象優(yōu)化與分子疊合
        3.2.2 生物富集性模型構(gòu)建及評價(jià)
        3.2.3 生物富集性模型驗(yàn)證
    3.3 酚類化合物logBCF值預(yù)測
    3.4 生物富集性模型三維等勢圖分析
    3.5 本章小結(jié)
第4章 基于3D-QSAR/分子對接的低生物富集性酚類分子修飾
    4.1 蛋白質(zhì)受體結(jié)構(gòu)來源
    4.2 分子對接參數(shù)確定
    4.3 分子對接可靠性評價(jià)
    4.4 基于分子對接的分子修飾因素分析
    4.5 基于3D-QSAR/分子對接的分子修飾點(diǎn)位精確篩選
    4.6 基于3D-QSAR/分子對接的PCP分子修飾
        4.6.1 新型PCP分子衍生化反應(yīng)能壘計(jì)算
        4.6.2 PCP衍生物生物富集性、毒性、厭氧生物降解性和遷移性評價(jià)
    4.7 本章小結(jié)
第5章 基于分子對接的酚類低生物富集性研究
    5.1 蛋白質(zhì)受體結(jié)構(gòu)來源
    5.2 分子對接參數(shù)確定及可靠性評價(jià)
    5.3 PCP衍生物與SOD酶對接效果分析
    5.4 基于氫鍵的酚類低生物富集性機(jī)理分析
    5.5 基于氨基酸種類的酚類低生物富集性機(jī)理分析
    5.6 本章小結(jié)
第6章 結(jié)論與展望
    6.1 結(jié)論
    6.2 本文創(chuàng)新點(diǎn)
    6.3 展望
參考文獻(xiàn)
攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表的論文及其它成果
致謝
作者簡介


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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博士論文
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碩士論文
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[3]水合銨根離子和硫酸根離子體系的理論研究[D]. 趙飛耀.遼寧師范大學(xué) 2011
[4]2，4，6-三氯酚慢性暴露對青鳉生長和生殖影響的研究[D]. 何悅.西南大學(xué) 2010



本文編號：2913209