一氧化氮（Nitric oxide,NO）是一種主要大氣污染物,極易造成臭氧層耗竭或酸雨酸霧等二次環(huán)境污染問題。生物凈化法已被證明是綠色治理NO的有效方法,該方法去除NO的主要原理是微生物主導(dǎo)的反硝化反應(yīng),即微生物體內(nèi)的關(guān)鍵還原酶可結(jié)合底物NO,通過酶促反應(yīng)將NO還原為無毒無害的N₂。本文以課題組前期篩選獲得的一株反硝化細(xì)菌Achromobacter denitrificans strain TB為實(shí)驗(yàn)菌株,通過細(xì)菌De Novo測(cè)序獲得該菌株基因組序列,并對(duì)序列中的反硝化基因進(jìn)行了鑒定。以測(cè)序獲得的一氧化氮還原酶（Nitric oxide reductase,NOR）編碼序列為參考,PCR擴(kuò)增成功得到TB菌中的norB基因,并通過表達(dá)載體的構(gòu)建獲得了基因工程菌E.coli BL21（DE3）-pET28a-norB。通過IPTG的誘導(dǎo),使NorB蛋白在大腸桿菌內(nèi)得到表達(dá),然后從mRNA水平檢測(cè)了norB基因在菌株內(nèi)的轉(zhuǎn)錄情況,并考察了該菌株對(duì)NO的還原性能,主要結(jié)論如下:通過細(xì)菌De Novo測(cè)序獲得Achromobacter sp.TB全基因組序列,該序列總長... 

【文章來源】：浙江工業(yè)大學(xué)浙江省

【文章頁數(shù)】：83 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

TB菌細(xì)胞形態(tài)

圖 3-2 TB 菌基因組圈圖Figure 3-2. Genome circle of strain TB從外至內(nèi)，第一圈是基因組位置信息，第二圈是 GC 含量信息,第三圈基因(紅色標(biāo)注)，第四圈是負(fù)鏈上的編碼基因(綠色標(biāo)注)，第五圈是正息(藍(lán)色標(biāo)注)，第六圈是負(fù)鏈上的 ncRNA 信息(紫色標(biāo)注)，第七圈標(biāo)注組內(nèi)長片段重復(fù)序列信息(橙色標(biāo)注)m the outside to the inside, the first circle is the genomic location informrcle is the GC content information, the third circle is the coding gene on rked in red), and the fourth circle is the coding gene on the negative cha) The fifth circle is the ncRNAinformation on the positive chain (marke circle is the ncRNAinformation on the negative chain (marked in purpl circle is the long fragment repeat information in the genome (marked in碼基因功能注釋 Nr、KEGG、COG、GO 數(shù)據(jù)庫分別對(duì) TB 菌基因組中的編碼

浙江工業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文分類為反硝化無色桿菌 Achromobacterdenitrificans。馮潔儀化無色桿菌隸屬于產(chǎn)堿桿菌屬，故 Alcaligenes denitrifica分類學(xué)名稱應(yīng)為 Achromobacter denitrificans strain TB。 數(shù)據(jù)庫（Kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG和基因組信息的數(shù)據(jù)庫。它整合了基因組學(xué)，生物化學(xué)及并按照不同類型的生物過程進(jìn)行繪制相應(yīng)的生物通路圖。劃分為 6 類，分別為：細(xì)胞過程（CellularProcesses）、環(huán)mental Information Processing）、遺傳信息處理（Genetic）、人類疾�。℉umanDiseases）、新陳代謝（Metabolism）、alSystems），每一類又被系統(tǒng)分為二級(jí)分類，統(tǒng)計(jì)二級(jí)分的基因數(shù)目，如圖 3-3 所示�；蚪M中有 3200 個(gè)基因都謝中，占 KEGG 總注釋基因數(shù) 65.08%，其中氨基酸代謝數(shù)量分別是 645 與 609 個(gè)。部分基因參與了環(huán)境信息處理5 個(gè)基因參與到生物體系統(tǒng)、人類疾病和遺傳信息處理三條


本文編號(hào)：2896184