基于高通量技術(shù)的高效秸稈類(lèi)纖維素降解菌篩選及應(yīng)用
【學(xué)位單位】:遼寧大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位年份】:2018
【中圖分類(lèi)】:X172;X71
【部分圖文】:
2.2.2 高通量測(cè)序?yàn)榱丝焖俅_定采集到的樣品是否含有纖維素降解菌,將采集到的樣品進(jìn)行了高通量測(cè)序,通過(guò)分析其中的細(xì)菌種群分類(lèi)和限制性培養(yǎng)的結(jié)果相結(jié)合,對(duì)采集到的樣品有個(gè)初步的篩選,以便更快的篩選到高效纖維素降解菌株。對(duì)測(cè)得序列進(jìn)行生物信息學(xué)分析包括進(jìn)行質(zhì)量控制,去除前后引物和條形碼得到有效序列, 將所有樣本序列按照序列間的距離進(jìn)行聚類(lèi),后根據(jù)序列之間的相似性將序列分成不同的操作分類(lèi)單元 (OUT)。通常在 97%的相似水平下的 OTU 進(jìn)行生物信息統(tǒng)計(jì)分析。為了得到每個(gè) OTU 對(duì)應(yīng)的物種分類(lèi)信息,需要對(duì) OTU 進(jìn)行物種分類(lèi),采用兩種分類(lèi)方式:RDP classifier 和 Blast。
樣本CNWY物種豐度餅
樣本GFZ物種豐度餅
【參考文獻(xiàn)】
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本文編號(hào):2810962
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