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基于高通量技術(shù)的高效秸稈類纖維素降解菌篩選及應(yīng)用

發(fā)布時間:2020-09-02 18:47
   纖維素類生物質(zhì)資源是自然界中最豐富的可再生資源之一,纖維素資源的開發(fā)利用對于解決當前環(huán)境污染、能源危機和糧食短缺等世界性難題具有重要的意義。為進一步增加纖維素生物質(zhì)的分解效率,獲得更多的纖維素降解菌資源,因此,開展了纖維素降解菌篩選的研究。本研究首先建立了高通量纖維素降解菌的篩選方法;趥鹘y(tǒng)的纖維素降解菌篩選原理,以24孔板和96孔板作為載體減小體系和增加篩選通量,結(jié)合剛果紅培養(yǎng)基的鑒別作用,以及酶標儀批量采集數(shù)據(jù)的功能,建立了一套微量、靈敏、快速的高通量篩選方法,并對該方法的培養(yǎng)體系及檢測體系進行了優(yōu)化。結(jié)果發(fā)現(xiàn),當24孔深孔板的裝液量為2.5mL,培養(yǎng)時間為48h時,微生物的生長效果最好。當酶標儀的檢測波長為500nm,96孔板中DNS添加量為120μL時,檢測體系的準確性最佳;诒狙芯拷⒌母咄亢Y選方法,從牛糞中初篩得到9株纖維素降解菌。24孔板發(fā)酵復篩后,選取纖維素酶高產(chǎn)菌C-7進一步研究。菌株C-7為革蘭氏陽性短桿菌,大小約為1.5~2μm×0.5μm。初步鑒定為Aneurinibacillus sp.strain N8。對其產(chǎn)酶條件進行優(yōu)化。在初始pH為9,55°C搖瓶培養(yǎng)120h時能夠表現(xiàn)出最大的產(chǎn)酶活性,此時CMCase活力和FPase活力分別為1.68U/mL和0.91U/mL。以土壤、牛糞、牛瘤胃液作為篩選源,在厭氧條件下,經(jīng)長期富集、馴化培養(yǎng)獲得具有高效降解纖維素功能的復合菌系H1。該復合菌系5天濾紙纖維素降解率可達89%,在不同培養(yǎng)代數(shù)、不同接種量和不同濃度底物培養(yǎng)時均能對濾紙纖維素保持較高的降解量。對玉米秸稈、水稻秸稈的降解率最高可達61.5%和56.4%。H1的發(fā)酵的產(chǎn)物主要為丁酸和乙酸,且發(fā)酵過程中可以產(chǎn)生一定量的H_2。分別以0.5%的濾紙、玉米秸稈和水稻秸稈為底物發(fā)酵7天,乙酸的產(chǎn)量分別為1566mg/L、923 mg/L和740 mg/L左右。丁酸的產(chǎn)量分別為2600mg/L、1323mg/L和986mg/L左右。H_2積累量分別為32ml、9.6mL和5mL左右,約占總產(chǎn)氣量的23%、15%和12%左右。在不斷富集培養(yǎng)的過程中,復合菌系H1中微生種類和比例組成趨于穩(wěn)定。對復合菌系進行高通量測序,發(fā)現(xiàn)梭菌為主要的優(yōu)勢菌種,主要功能為纖維素的降解及產(chǎn)氫,其次含有一部分桿狀菌,主要作用為產(chǎn)酸。
【學位單位】:遼寧大學
【學位級別】:碩士
【學位年份】:2018
【中圖分類】:X172;X71
【部分圖文】:

柱狀圖,樣本群,結(jié)構(gòu)分布,柱狀圖


2.2.2 高通量測序為了快速確定采集到的樣品是否含有纖維素降解菌,將采集到的樣品進行了高通量測序,通過分析其中的細菌種群分類和限制性培養(yǎng)的結(jié)果相結(jié)合,對采集到的樣品有個初步的篩選,以便更快的篩選到高效纖維素降解菌株。對測得序列進行生物信息學分析包括進行質(zhì)量控制,去除前后引物和條形碼得到有效序列, 將所有樣本序列按照序列間的距離進行聚類,后根據(jù)序列之間的相似性將序列分成不同的操作分類單元 (OUT)。通常在 97%的相似水平下的 OTU 進行生物信息統(tǒng)計分析。為了得到每個 OTU 對應(yīng)的物種分類信息,需要對 OTU 進行物種分類,采用兩種分類方式:RDP classifier 和 Blast。

物種豐度,樣本


樣本CNWY物種豐度餅

物種豐度,樣本


樣本GFZ物種豐度餅

【參考文獻】

相關(guān)期刊論文 前10條

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本文編號:2810962

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