DDT降解菌Ochrobactrum sp.DDT-2谷胱甘肽S-轉移酶的克
發(fā)布時間:2020-05-06 21:32
【摘要】:有機氯農藥曾廣泛用于農業(yè)害蟲與公共衛(wèi)生防治,雖早已被禁,但如DDT等及其主要代謝產物在自然環(huán)境中的殘留依然可以檢測出來,存在一定的健康與生態(tài)風險。谷胱甘肽S-轉移酶(GSTs)作為一類保守的具有多種功能的超基因家族酶系,普遍存在生物體中。GSTs主要功能是催化內源、外源等有毒物質形成低毒易溶于水的化合物而排出體外,減少或避免對機體造成損害。本文通過對實驗室保存的DDT降解菌Ochrobactrum sp.DDT-2進行全基因組測序分析,主要研究結果如下:(1)通過使用Illumina Hiseq和SOAPdenovo(v2.04),測序、組裝、優(yōu)化和補洞后獲得了 DDT降解菌Ochrobactrum sp.DDT-2基因信息。通過組裝序列、ncRNA信息、編碼基因、COG、GO、KEGG功能注釋,繪制得到了 DDT降解菌Ochrobbactrum sp.DDT-2基因組圈圖。預測全基因組注釋中編號為U1GM001187的基因序列,編碼谷胱甘肽S-轉移酶,命名為dhc基因,作用于DDT→DDE的轉化。(2)利用PCR方法從DDT降解菌Ochrobactrum sp.DDT-2菌株中克隆到谷胱甘肽S-轉移酶基因dhc,構建重組表達菌株,在IPTG(Isopropylβ-D-Thiogalactoside)的誘導下,在26kDa左右有明顯的表達蛋白條帶。試驗表明其具有降解DDT、DDE和DDD的作用,DDT在dhc基因作用下降解為DDE,隨后繼續(xù)脫氯化氫生成DDMU,DDE和DDD都降解為DDMU。(3)純化經IPTG誘導的重組表達蛋白,研究其酶學基礎特性。純化后的蛋白酶可在一個較寬的溫度(20-45℃)和pH(6.0-7.0)范圍內具有降解作用,同時還能降解七氯、林丹、百菌清和β-666,通過對代謝產物的分析得到純化酶對其作用途徑是:β-HCH→五氯環(huán)己烯;林丹—→五氯環(huán)己烯→三氯苯;百菌清→1,3-二酰胺-四氯苯;七氯→外環(huán)氧七氯。本研究獲得的降解酶具有較好的降解能力,且具有較好的底物廣泛性,有較好的潛在應用價值。
【圖文】:
邐DDOII邐DDNU逡逑圖2.8基因組預測DDT降解菌Oc/wo6ac/rwm邋sp.邋DDT-2對DDT的降解途徑逡逑Fig邋2.8邋The邋potential邋degradation邋pathway邋of邋DDT邋by邋Ochrobactrum邋sp.邋DDT-2邋on逡逑the邋base邋of邋genome邋annotation逡逑DDT生物降解通常是不完整的,并產生一些易于生物降解的化合物,如4-逡逑氯苯酚-乙酸鹽和高度持久性化合物
-0.593。使用TMHMM2.0預測,結果表明該蛋白氨基酸全位于細胞膜的表面,逡逑為非跨膜蛋白。逡逑將氨基酸序列遞交到SOPMA進行二級結構分析,結果如圖2.9,可知該脫逡逑氯化氫蛋白的二級結構主要以a螺旋為主,占總結構的42.13%,其次是無規(guī)卷逡逑曲,占總結構的36.17%;邋P轉角最少,僅占總結構的5.53%,,使用SMART服務逡逑器分析其結構功能域,該蛋白的6至86位之間是GST_N邋121結構功能域,126逡逑至206位之間是GST_C_3結構功能域
【學位授予單位】:浙江大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2019
【分類號】:Q78;X592;X172
本文編號:2651887
【圖文】:
邐DDOII邐DDNU逡逑圖2.8基因組預測DDT降解菌Oc/wo6ac/rwm邋sp.邋DDT-2對DDT的降解途徑逡逑Fig邋2.8邋The邋potential邋degradation邋pathway邋of邋DDT邋by邋Ochrobactrum邋sp.邋DDT-2邋on逡逑the邋base邋of邋genome邋annotation逡逑DDT生物降解通常是不完整的,并產生一些易于生物降解的化合物,如4-逡逑氯苯酚-乙酸鹽和高度持久性化合物
-0.593。使用TMHMM2.0預測,結果表明該蛋白氨基酸全位于細胞膜的表面,逡逑為非跨膜蛋白。逡逑將氨基酸序列遞交到SOPMA進行二級結構分析,結果如圖2.9,可知該脫逡逑氯化氫蛋白的二級結構主要以a螺旋為主,占總結構的42.13%,其次是無規(guī)卷逡逑曲,占總結構的36.17%;邋P轉角最少,僅占總結構的5.53%,,使用SMART服務逡逑器分析其結構功能域,該蛋白的6至86位之間是GST_N邋121結構功能域,126逡逑至206位之間是GST_C_3結構功能域
【學位授予單位】:浙江大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2019
【分類號】:Q78;X592;X172
【參考文獻】
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本文編號:2651887
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