本文選題：尿道致病性大腸埃希菌 + 敗血性大腸埃希菌��； 參考：《浙江大學(xué)》2015年碩士論文

【摘要】：背景和目的： 腸外致病性大腸埃希菌(Extraintestinal pathogenic Escherichia coli, ExPEC)是一類能引起人和動物腸外組織感染的重要人畜共患病病原,可致使不同宿主發(fā)生腦膜炎、敗血癥、泌尿道和呼吸道感染,每年給全球公共衛(wèi)生事業(yè)造成巨大的財政支出。70-95%的社區(qū)獲得性尿路感染和50%的醫(yī)院獲得性尿路感染都由尿路致病性大腸埃希菌(Uropathogenic Escherichia coli, UPEC)引起的。同時敗血性大腸埃希菌(Sepsis-associated Escherichia coli, SEPEC)也是血液感染的主要原因之一,由其引起的菌血癥和敗血癥的病例越來越多,且具有相當(dāng)高的死亡率。本研究的目的是了解我院臨床分離到的尿液和血液來源的大腸埃希菌的系統(tǒng)分群、分子分型特征、毒力基因分布以及藥物敏感性情況,為防治E.coli疾病提供科學(xué)依據(jù)。 方法： 選取2011年7月至2012年6月間浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬第一醫(yī)院臨床微生物實驗室分離保存的ExPEC104株,包括55株UPEC和49株SEPEC,采用多重PCR技術(shù)對其進行系統(tǒng)分群、多位點序列分型(multilocus sequence typing, MLST)和44種毒力基因篩查,采用K-B紙片法開展藥物敏感性試驗。 結(jié)果： 1.系統(tǒng)分群結(jié)果顯示,104株ExPEC主要屬于D群(51株,49.0%),其次為B2群(37株,35.6%)、A群(10株,9.6%)和B1群(6株,5.8%)。其中55株UPEC中B2、D、A和B1分別占43.6%、41.8%、9.1%和5.5%,49株SEPEC中B2、D、A和B1分別占26.5%、57.2%、10.2%和6.1%。 2. MLST分析顯示7個管家基因adk、fume、gyrB、icd、mdh、purA、recA的等位基因數(shù)值(allele numbers)分別有18、21、20、17、15、15、13種。104株ExPEC共發(fā)現(xiàn)34種ST (sequence types)型,以ST131型菌株最多,占14.42%(15/104),其他主要ST型依次為ST648型,占10.58%(11/104)；ST69型,占9.62%(10/104)；ST10型.占7.69%(8/104)。55株UPEC分屬于20種不同ST型.以ST131型最多.占20.00%,49株SEPEC分屬于24種不同的ST型,以ST10型和ST648型最多,各占10.20%。新型ST型2型,分別為ST3905、ST3907,且分別位于UPEC和SEPEC菌株中。 3.毒力基因sfaS、iha、papA、iroN,、fyuA、Kps Ⅲ在104株菌株的檢出率均大于50%；毒力基因afaE8、cdtB、pic在104株菌株中未檢出。55株UPEC中檢出率≥20.0%的毒力基因有22種,檢出率最高的為fyuA(96.4%)和kps Ⅲ(92.7%),有4種毒力基因未檢出(bmaE、afaE8、cdtB和pic),毒力分數(shù)(攜帶毒力基因個數(shù))為5-20,第25百分位數(shù)(P25)、P50、P75分別為7、11和14。在49株SEPEC中,檢出率≥20.0%的毒力基因有15種,檢出率最高的為papEF(91.7%)、iha和astA(均為87.5%),有12種毒力基因未檢出(f17, afaE8, cvaC, K1, rfc, vat, cdtB, pic, usp, uidA, malX,H7fliC),毒力分數(shù)為2-19,第25百分位數(shù)(P25)、P50、P75分別為6、9和11。 4.104株ExPEC對氨芐西林的耐藥率高達86.5%,對9種抗生素(氨芐西林、四環(huán)素、頭孢唑啉、頭孢噻肟、復(fù)方新諾明、頭孢呋辛、環(huán)丙沙星、氨芐西林／舒巴坦、慶大霉素)的耐藥率均超過了50%,耐藥率最低的為美羅培南(2.9%),美羅培南耐藥株均來源于血液。UPEC菌株和SEPEC菌株的ESBL (extended-spectrumβ-lactamases)陽性率分別為60.0%(33/55)、61.7%(30/49),多重耐藥菌檢出率分別為80.0%(44/55)、85.7%(42/49),耐抗菌藥物類數(shù)的中位數(shù)分別為7和8,差異均無統(tǒng)計學(xué)意義。 結(jié)論： (1)D群是腸道外致病性大腸埃希菌中較常見的系統(tǒng)分群,ST131比例較高,應(yīng)引起更廣范圍的關(guān)注。 (2)粘附因子、保護素、鐵載體、毒素等相關(guān)的毒力因子在腸道外致病性大腸埃希菌中廣泛分布。 (3)本地區(qū)臨床分離的腸道外大腸埃希菌耐藥情況較嚴(yán)重,需密切關(guān)注產(chǎn)ESBLs菌株的耐藥情況,同時繼續(xù)加強抗菌藥物的管理和監(jiān)測。
[Abstract]:Background and Purpose :

Extraintestinal pathogenic Escherichia coli ( ExPEC ) is a kind of important human and livestock co - infection which can cause the infection of human and animal intestinal tissues . It can cause meningitis , septicemia , urinary tract and respiratory tract infection in different hosts .

Method :

ExPEC104 strains isolated from clinical microbiology laboratory of Zhejiang University Medical College from July 2011 to June 2012 were selected , including 55 strains of UPEC and 49 SEPEC , which were subjected to systematic clustering , multilocus sequence typing ( MLST ) and 44 virulence gene screening by multiplex PCR .

Results :

1 . The results showed that 104 strains of ExPEC belong to group D ( 51 , 49.0 % ) , followed by B2 group ( 37 strains , 35 . 6 % ) , group A ( 10 , 9.6 % ) and B1 group ( 6 strains , 5.8 % ) . Among 55 strains of UPEC , B2 , D , A and B1 accounted for 43.6 % , 41.8 % , 9.1 % and 5.5 % , respectively . In 49 strains , B2 , D , A and B1 accounted for 26.5 % , 57.2 % , 10.2 % and 6.1 % , respectively .

2.MLST analysis showed that there were 18 , 21 , 20 , 17 , 15 , 15 , 13 kinds of allele numbers of 7 housekeeping genes adk , fume , gyrB , icd , mdh , purA and recA .
Type ST69 , accounting for 9.62 % ( 10 / 104 ) ;
There were 20 different types of ST - type . Among them , there were 20 different types of ST - type , 20 . 00 % and 20 . 00 % , and 49 strains of SEPEC belong to 24 different ST - type . The ST10 - type and ST648 - type were the most and 10 . 20 % respectively . The new type ST - type 2 was ST3905 and ST3907 , respectively , and were respectively located in the strains of UPEC and SEPEC .

3 . The detection rate of sfaS , iha , papA , iroN , fyuA and Kps 鈪，

本文編號：1859210