內(nèi)蒙古包頭地區(qū)臨床來源腸球菌耐藥基因與致病基因的研究
本文選題:腸球菌 切入點:耐藥機制 出處:《內(nèi)蒙古科技大學包頭醫(yī)學院》2015年碩士論文 論文類型:學位論文
【摘要】:目的檢測腸球菌在內(nèi)蒙古包頭地區(qū)的臨床標本中及臨床各科室中的分布特點和耐藥性,了解腸球菌流行病學特征,為合理使用抗菌藥物和防止耐藥株的流行提供依據(jù)。研究包頭地區(qū)耐藥腸球菌致病基因及耐藥基因的分布特點,探討腸球菌耐藥機制。方法應用瓊脂篩選法檢測117株臨床來源的腸球菌菌株并分析其耐藥性,從中選出50株,采用PCR法檢測其6種致病基因cylA、gelE、esp、ace、agg、efaA,探討其分布情況。采用PCR法檢測腸球菌對氨基糖苷類、大環(huán)內(nèi)脂類、糖肽類、四環(huán)素類抗生素耐藥基因aac(6')-Ie-aph(2'')-Ia、aph(2'')-Ib、aph(2'')-Ic、aph(2'')-Id、aph(3')-IIIa、ant(6')-Ia、erm(B)、MazEF、vanA、vanB、tet(L),并分析其分布特點。檢測β-內(nèi)酰胺類、喹諾酮類抗生素的耐藥基因PBP5,gyrA,parC,其擴增產(chǎn)物行DNA測序,分析突變區(qū)域,探討基因突變與細菌耐藥的相關性。結果(1)耐藥性分析:實驗菌株對9種抗菌藥物均有不同程度的耐藥,有半數(shù)以上的菌株對3種甚至3種以上抗生素耐藥,屎腸球菌的耐藥率高于糞腸球菌。(2)致病基因分布:腸球菌的致病基因檢出率為:cylA(18%)、gelE(28%)、esp(16%)、ace(2%)、agg(0)、efaA在糞腸球菌中的檢出率為92.9%。(3)耐藥基因分布:實驗菌株中HLGR的AME基因的攜帶率:aac(6')-Ie-aph(2'')-Ia(89.3%)、aph(2'')-Ib(0)、aph(2'')-Ic(7%)、aph(2'')-Id(10.7%)、aph(3')-IIIa(23.3%),HLSR的AME基因的攜帶率:aph(3')-IIIa(53.3%)、ant(6')-Ia(66.7%)。紅霉素耐藥基因ermB的攜帶率為83.3%。四環(huán)素的耐藥基因tet(L)的攜帶率為73.91%。實驗菌株對萬古霉素耐藥率為4.27%,VRE中僅有1株MazEF陽性,vanA、vanB均為陰性。(4)耐藥基因突變分析:實驗菌株中E.faecium的耐藥基因PBP5攜帶率為100%,實驗發(fā)現(xiàn)屎腸球菌的PBP5的C端兩個新的氨基酸突變。氟喹諾酮類抗生素的耐藥基因parC、gyrA攜帶率分別為87.5%、91.30%,實驗發(fā)現(xiàn)parC、gyrA發(fā)生突變。結論(1)包頭地區(qū)腸球菌對于9種臨床應用的抗菌藥物具有不同程度的耐藥,并存在多重耐藥菌株,而且不同類型腸球菌耐藥譜不同。(2)腸球菌致病基因及耐藥基因與腸球菌的抗生素耐藥性具有明顯的相關性。(3)通過對β-內(nèi)酰胺類及喹諾酮類抗生素耐藥基因PBP5、gyrA、parC突變分析,發(fā)現(xiàn)了屎腸球菌的PBP5的C末端兩個新氨基酸突變,影響了與青霉素結合能力,并與細菌的耐藥性相關。gyrA的突變位點為Ser83→Tyr、Ile、Arg,parC的突變位點為Ser80→Arg、Ile和Glu84→Ala。突變位點從親水性氨基酸突變?yōu)槭杷园被?使該位點親水性降低,導致細菌耐藥的產(chǎn)生。
[Abstract]:Objective to detect the distribution and drug resistance of Enterococcus in clinical specimens and clinical departments in Baotou, Inner Mongolia, and to understand the epidemiological characteristics of Enterococcus. To provide basis for rational use of antimicrobial agents and to prevent the epidemic of drug-resistant strains, the distribution characteristics of pathogenic genes and drug-resistant genes of drug-resistant Enterococcus in Baotou area were studied. Methods 117 clinical strains of Enterococcus were detected by Agar screening method and their drug resistance was analyzed. PCR method was used to detect six pathogenic genes, cylAgel EespaceaggefaA, and to investigate its distribution. PCR method was used to detect enterococcus to aminoglycosides, macrolipids, glycopeptides, tetracycline antibiotic resistant genes aacan6- Ie-aph-2a-Iaapaphora, and to analyze the distribution characteristics of 尾 -lactamide, 尾 -lactamide, 尾 -lactamide, 尾 -lactamide, 尾 -lactamide, 尾 -lactamide, 尾 -lactamide, 尾 -lactamide, 尾 -lactamide, 尾 -lactamide, 尾 -lactamide, 尾 -lactamide, 尾 -lactamide, 尾 -lactamide, 尾 -lactamide, 尾 -lactamide, 尾 -lactamide, 尾 -lactamide, 尾 -lactamide, 尾 -lactamide, 尾 -lactamide, 尾 -lactamide, 尾 -lactamide, 尾 -lactamide, 尾 -lactamide, 尾 -lactamide, 尾 -lactamides, Quinolone antibiotic resistant gene PBP5gyrAparC.The amplified product was sequenced by DNA, the mutation region was analyzed, and the correlation between gene mutation and bacterial resistance was discussed. Results: the experimental strains were resistant to 9 antimicrobial agents to varying degrees. More than half of the strains were resistant to three or more antibiotics. The rate of drug resistance of Enterococcus faecium is higher than that of Enterococcus faecalis.) the distribution of pathogenic genes of Enterococcus faecium is higher than that of Enterococcus faecalis.) the detection rate of E. faecium is higher than that of Enterococcus faecalis. The detection rate of E. faecium is higher than that of Enterococcus faecalis. The detection rate of the pathogenic gene of Enterococcus faecium is higher than that of Enterococcus faecium. The detection rate of E. faecium is cylA1Af1818. The detection rate of E. faecii is cylAp1818. The detection rate of E. faecium is 92. 9%. 3) in Enterococcus faecium, the distribution of AME gene in E. faecalis is 92.9. 3): the carrying rate of the AME gene of HLGR in the experimental strain is aacap6- Iaaph-2a89.3. The carrying rate of AME gene was 53.3%. The carrying rate of erythromycin resistance gene (ermB) was 83.3%. The rate of tetracycline resistance gene was 73.91%. The rate of vancomycin resistance of experimental strains was 4.27%. Only 1 MazEF positive van AvanB gene was negative. Mutation analysis: the PBP5 carrying rate of E. faecium resistance gene was 100. Two new amino acid mutations at C-terminal of PBP5 of Enterococcus faecium were found. The carrying rate of fluoroquinolone antibiotic resistance gene parc gyrA was 87.5% and 91.30%, respectively. Conclusion Enterococcus in Baotou area is resistant to 9 kinds of antimicrobial agents. And there are multidrug resistant strains, Moreover, different types of enterococci have different drug resistance profiles.) Enterococcus pathogenicity genes and drug resistance genes have a significant correlation with antibiotic resistance of Enterococcus. The mutation analysis of 尾 -lactam and quinolone antibiotic resistance gene PBP5gyrAparC was carried out. Two new amino acid mutations at the C-terminal of PBP5 of Enterococcus faecium were found, which affected the binding ability to penicillin, and the mutation site related to bacterial resistance was Ser83. 鈫扵he mutation site of Tyrus Ileus Argoper C is Ser80. 鈫扐rg Ile and Glu84. 鈫扵he mutation site of Ala. changed from hydrophilic amino acid to hydrophobic amino acid, which reduced the hydrophilicity of Ala. and led to the production of drug resistance of bacteria.
【學位授予單位】:內(nèi)蒙古科技大學包頭醫(yī)學院
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2015
【分類號】:R440
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,本文編號:1598522
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