新疆地區(qū)漢族和維吾爾族部分人群HLA-DRB1、HLA-DQB1、HLA-DPB1基因多態(tài)性與單倍型的比較
本文關鍵詞:新疆地區(qū)漢族和維吾爾族部分人群HLA-DRB1、HLA-DQB1、HLA-DPB1基因多態(tài)性與單倍型的比較 出處:《細胞與分子免疫學雜志》2016年04期 論文類型:期刊論文
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【摘要】:目的了解中國新疆維吾爾自治區(qū)漢族和維吾爾族人類白細胞抗原DRB1(HLA-DRB1)、HLA-DQB1、HLA-DPB1高分辨分型基礎上的基因多態(tài)性和單倍型分布的特點。方法應用聚合酶鏈反應-直接測序基因分型(PCR-SBT)法對新疆地區(qū)188例漢族人群與90例維吾爾族人群進行HLA-DRB1、HLA-DQB1、HLA-DPB1基因分型,直接計數(shù)法計算基因頻率,應用Arlequin3.5軟件以最大似然法獲得單倍型頻率。結(jié)果漢族人群頻率最高的HLA-Ⅱ類基因分別是DRB1*09∶01(12.8%)、DQB1*03∶01(20.3%)和DPB1*05∶01(33.5%);三位點組成的單倍型頻率最高的分別是DRB1*09∶01-DQB1*03∶03(8.8%)、DRB1*09∶01-DPB1*05∶01(5.0%)、DQB1*03∶01-DPB1*05∶01(9.6%)和DRB1*09∶01-DQB1*03∶03-DPB1*05∶01(6.3%)。維吾爾族人群頻率最高的HLA-Ⅱ類基因分別是DRB1*07∶01(18.3%)、DQB1*03∶01(18.9%)和DPB1*04∶01(30.0%);三位點組成的單倍型頻率最高的分別是DRB1*07∶01-DQB1*02∶02(16.1%)、DRB1*07∶01-DPB1*04∶01(5.0%)、DQB1*03∶01-DPB1*04∶01(7.3%)、DRB1*07∶01-DQB1*02∶02-DPB1*04∶01(7.4%)。兩組人群中等位基因有顯著差異的是∶DRB1*04∶04、DRB1*07∶01、DRB1*08∶03、DRB1*11∶04、DRB1*12∶02、DRB1*13∶01、DRB1*15∶01、DQB1*02∶02、DQB1*06∶01、DPB1*04∶01和DPB1*05∶01。結(jié)論中國新疆漢族與維吾爾族人群HLA-DRB1、HLA-DQB1、HLA-DPB1等位基因頻率、單倍型頻率分布均有自己的多態(tài)性特征。
[Abstract]:Objective to investigate the HLA-DQB1 HLA-DQB1 of human leukocyte antigen (DRB1) of the Han and Uygur nationalities in Xinjiang Uygur Autonomous region of China. The characteristics of polymorphism and haplotype distribution on the basis of HLA-DPB1 high resolution typing. Methods PCR-SBT was applied to genotyping by polymerase chain reaction-direct sequencing. Methods HLA-DRB1 was performed in 188 Han and 90 Uygur populations in Xinjiang. HLA-DQB1 alleles of HLA-DPB1 were genotyped and the frequency of HLA-DPB1 was calculated by direct counting method. Arlequin3.5 software was used to obtain haplotype frequencies by maximum likelihood method. Results the most frequent HLA-II genes in Han population were DRB1 / 09: 01 / 12.8). DQB1 03: 01: 20.3) and DPB105: 013.5. The highest frequency of haplotype was DRB1: 09: 01-DQB1 03: 038.8. DRB1 09: 01-DPB105: 015.0. DQB1: 01-DPB1: 05: 01-09.6) and DRB109-0901-DQB103: 03-DPB1-01-01-01-6.3). The most frequent HLA-II genes in Uygur population were DRB1: 07: 01. 3). DQB1: 03: 0118.9) and DPB1 / 04: 01 / 00.0. The highest frequency of haplotype was DRB1: 07: 01-DQB1: 02: 02: 16.1). DRB1 / 07: 01-DPB1 / 04: 01 / 05.0and DQB103: 01-DPB1 / 04: 01 / 07.3. DRB1 / 07: 01-DQB1 / 02: 02-DPB1 / 04: 017.4The allele of the two groups was significantly different from that of DRB1 / 04: 04: 04. DRB1 / 07: 01DRB1 / 08: 03DRB1 / 11: 04DRB1 / 12: 02DRB1 / 13: 01DRB1 / 1501. DQB1: 02: 02DQB1: 06: 01DPB1: 01 and DPB1 / 05: 01.Conclusion HLA-DRB1 of Han and Uygur populations in Xinjiang, China. The allele frequencies and haplotypes of HLA-DQB1 alleles had their own polymorphism characteristics.
【作者單位】: 石河子大學新疆地方病與民族高發(fā)病教育部重點實驗室;石河子大學醫(yī)學院第一附屬醫(yī)院感染性疾病科;
【基金】:國家自然科學基金(81160001)
【分類號】:R440
【正文快照】: 新疆維吾爾自治區(qū)(簡稱新疆)位于我國西北邊陲,居住有漢族、維吾爾族、哈薩克族等47個民族,主要以漢族(40.1%)、維吾爾族(45.8%)人口最多[1]。維吾爾族世代居住在新疆,有自己獨特的生活習慣和明顯的面部、體格特征,因強烈的宗教信仰鮮有與外族通婚,其基因保守性好;新疆漢族是
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