本文關鍵詞：海藻糖低溫保存血小板miRNA差異表達分析　出處：《第三軍醫(yī)大學學報》2016年18期 　論文類型：期刊論文

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【摘要】：目的探討海藻糖低溫保存血小板過程中miRNA的變化。方法收集3份來自相同血型無償獻血員的單采血小板,少量混勻后,平均分為2組。對照組:新鮮血小板組(22℃,100%血漿儲存的新鮮血小板2 h);實驗組:海藻糖低溫保存血小板組(10℃,70%海藻糖保存液儲存5 d);采用高通量測序方法對兩組樣品進行了Small RNA測序,進行生物信息分析,主要包括已知miRNA鑒定、miRNA差異表達分析及富集分析。結果 2組樣品經Small RNA高通量測序,平均每個樣品獲得了11兆凈讀值(Clean reads),經過生物信息分析,分別獲得了821個已知miRNA。通過差異表達分析,在已知的miRNA中共有460個差異表達miRNA,其中194個miRNA表達上調,266個miRNA表達下調,其中顯著差異表達已知miRNA共44個,分別在鈣離子通路、MAPK通路、凋亡路徑、軸突導向等儲存損傷相關路徑中富集程度較高。相對于對照組,實驗組中hsa-miR-4449、hsa-miR-1296表達顯著上調(P0.01,且差異倍數(shù)2),hsa-miR-665表達被抑制。結論血小板經過海藻糖低溫保存后的miRNA呈現(xiàn)出特征性表達變化,提示miRNA活動參與了低溫時海藻糖對血小板儲存損傷的保護作用。
[Abstract]:Objective to investigate the changes of miRNA during the cryopreservation of trehalose at low temperature. Methods a total of 3 platelets from the same blood type unpaid blood donors were collected. After a small amount of mixing, the average was divided into 2 groups. Control group: fresh platelet group (22 DEG, 100% plasma stored fresh platelet 2 h); the experimental group: platelets group trehalose (10 DEG, 70% trehalose preservation liquid storage for 5 d); using high-throughput sequencing method in two groups of samples were Small RNA sequencing, analysis of information, including analysis and enrichment analysis of miRNA identification, the difference of miRNA expression is known. Results 2 groups of samples were sequenced by Small RNA high throughput sequencing. The average sample obtained 11 trillion net reading value (Clean reads). After bioinformatics analysis, 821 known miRNA were obtained. Through the analysis of the differences in expression, known as miRNA, a total of 460 differentially expressed miRNA, of which 194 up-regulated the expression of miRNA and 266 miRNA expression, the significant difference of the expression of known miRNA a total of 44, the damage degree of enrichment of the relevant path in high calcium ion pathway, MAPK pathway, apoptosis pathway, axon guidance and storage respectively. Compared with the control group, the expression of hsa-miR-4449 and hsa-miR-1296 in the experimental group was significantly up (P0.01, and the difference multiplier was 2), and the expression of hsa-miR-665 was inhibited. Conclusion the miRNA expression of platelets after trehalose cryopreservation showed a characteristic expression change, suggesting that miRNA activity is involved in the protective effect of trehalose on platelet storage damage at low temperature.
【作者單位】： 第三軍醫(yī)大學西南醫(yī)院輸血科 中國人民解放軍重慶血站;
【基金】：國家自然科學基金面上項目(81270649)~~
【分類號】：R446.1
【正文快照】： 血小板在保存過程中結構和功能會隨著時間延長而發(fā)生變化,這些改變統(tǒng)稱為儲存損傷(platelet storagelesion,PSL)[1]。常規(guī)的血小板保存條件為22℃振蕩保存5 d。為了減少血小板的儲存損傷,人們嘗試采用低溫保存方法,低溫保存雖可以延長血小板保存時限,但低溫易致血小板發(fā)生活化

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