本文選題：蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò) + 評價方法　； 參考：《計算機(jī)科學(xué)》2013年12期

【摘要】：蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)(Protein-Protein Interaction,PPI)聚類結(jié)果的評價方法的研究是檢測PPI網(wǎng)絡(luò)功能模塊聚類結(jié)果正確與否的關(guān)鍵。介紹并分析了4種有代表性的PPI網(wǎng)絡(luò)聚類的評價方法,即p-value、匹配統(tǒng)計量、基于準(zhǔn)確率和查全率的綜合評價以及基于層結(jié)構(gòu)的hF-measure,在此基礎(chǔ)上考慮了主錯誤劃分類與該預(yù)測類的相似性,提出了新的罰分函數(shù)和新的Sf-measure評價方法。仿真結(jié)果表明了各評價方法的特點及Sf-measure評價方法的有效性及合理性。
[Abstract]:The research on the evaluation method of protein interaction (PPI) clustering results is the key to detect whether the clustering results of the functional modules of the PPI network are correct or not. This paper introduces and analyzes four representative evaluation methods of PPI network clustering, that is, p-value. matching statistics. Based on the comprehensive evaluation of accuracy and recall and the hF-measurement based on hierarchical structure, the similarity between the classification of the main error classification and the prediction class is considered, and a new penalty function and a new evaluation method of Sf-measure are proposed. The simulation results show the characteristics of each evaluation method and the validity and rationality of Sf-measure evaluation method.
【作者單位】： 陜西師范大學(xué)計算機(jī)科學(xué)學(xué)院;
【基金】：國家自然科學(xué)基金青年基金(61100164,61173190) 教育部留學(xué)回國人員科研啟動基金(教外司留[2012]1707號) 陜西省2010年自然科學(xué)基礎(chǔ)研究計劃青年基金(2010JQ8034)資助
【分類號】：TP393.0

【參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前1條

1 雷秀娟;田建芳;;蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)的蜂群信息流聚類模型與算法[J];計算機(jī)學(xué)報;2012年01期

【共引文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前2條

1 鄢樹;;基于人工蜂群和小波變換的PID主動隊列管理方法[J];科學(xué)技術(shù)與工程;2013年14期

2 王沖;雷秀娟;;基于人工免疫系統(tǒng)的蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)聚類算法[J];計算機(jī)應(yīng)用;2013年12期

相關(guān)碩士學(xué)位論文 前4條

1 田建芳;PPI網(wǎng)絡(luò)的群智能信息流模型與算法研究[D];陜西師范大學(xué);2012年

2 吳爽;基于群智能機(jī)理的PPI網(wǎng)絡(luò)功能模塊聚類[D];陜西師范大學(xué);2012年

3 王敏;個性化搜索中隱私保護(hù)的問題研究[D];河北工程大學(xué);2012年

4 王沖;基于群智能優(yōu)化的聚類算法研究[D];陜西師范大學(xué);2013年

【二級參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前1條

1 王正華;董蘊(yùn)源;王勇獻(xiàn);;蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)的幾種聚類方法綜述[J];國防科技大學(xué)學(xué)報;2009年04期

【相似文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 李吉梅;宋鐵英;;公共部門網(wǎng)站服務(wù)質(zhì)量評價:框架、過程與方法[J];情報雜志;2009年05期

2 于庚;劉應(yīng)海;石全勝;;基于因子分析的省級政府門戶網(wǎng)站評價研究[J];數(shù)字通信;2011年03期

3 李宏汀;葛列眾;鄭燕;;網(wǎng)頁可用性評價的視線追蹤技術(shù)研究[J];人類工效學(xué);2007年04期

4 韓新華;;電子商務(wù)網(wǎng)站評價研究與分析[J];吉林省經(jīng)濟(jì)管理干部學(xué)院學(xué)報;2008年02期

5 梁靚;黃玉清;張曉琴;;基于神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的計算機(jī)網(wǎng)絡(luò)性能評價[J];計算機(jī)工程;2010年04期

6 劉丹;;網(wǎng)絡(luò)信息資源的評價[J];湖南科技學(xué)院學(xué)報;2007年04期

7 許潔斌;宋婭;梁永椿;;P2P流媒體數(shù)據(jù)分配算法的新評價方法[J];計算機(jī)工程;2009年16期

8 張征宇;王然;厲言;;B2B網(wǎng)站易用性評價系統(tǒng)的構(gòu)建[J];黑龍江科技信息;2009年34期

9 黃微,畢勝男,賈春華;網(wǎng)站系統(tǒng)綜合測評方法的研究[J];情報科學(xué);2003年08期

10 汪祖柱;胡兵;;電子商務(wù)網(wǎng)站服務(wù)質(zhì)量的模糊語義評價研究[J];情報雜志;2010年03期

相關(guān)會議論文 前4條

1 劉柏嵩;高濟(jì);;通用本體學(xué)習(xí)框架研究(英文)[A];全國語域web與本體能研討會論文集[C];2006年

2 梁建華;李學(xué)慶;榮風(fēng)光;周霆;;網(wǎng)站可用性評估模型研究[A];第二屆和諧人機(jī)環(huán)境聯(lián)合學(xué)術(shù)會議(HHME2006)——第2屆中國人機(jī)交互學(xué)術(shù)會議(CHCI'06)論文集[C];2006年

3 趙水寧;邵軍力;;Web服務(wù)器的網(wǎng)絡(luò)負(fù)載評價和檢測[A];開創(chuàng)新世紀(jì)的通信技術(shù)——第七屆全國青年通信學(xué)術(shù)會議論文集[C];2001年

4 張敏;馬亮;馬少平;陳群秀;;TREC2002介紹及清華大學(xué)實驗研究[A];語言計算與基于內(nèi)容的文本處理——全國第七屆計算語言學(xué)聯(lián)合學(xué)術(shù)會議論文集[C];2003年

相關(guān)重要報紙文章 前1條

1 清華大學(xué)計算機(jī)系智能技術(shù)與系統(tǒng)國家重點實驗室 劉奕群 張敏 金奕江;孰優(yōu)孰劣 如何評斷？[N];計算機(jī)世界;2003年

相關(guān)博士學(xué)位論文 前2條

1 朱紅寧;面向Web服務(wù)組合的服務(wù)QoS評價技術(shù)的研究[D];東北大學(xué);2009年

2 余偉;基于用戶個性挖掘的Web社區(qū)營銷研究[D];武漢大學(xué);2011年

相關(guān)碩士學(xué)位論文 前10條

1 王芳;網(wǎng)站主題目錄重要性評價[D];哈爾濱工業(yè)大學(xué);2006年

2 關(guān)鐵軍;電子商務(wù)安全策略研究[D];北京郵電大學(xué);2008年

3 于少然;網(wǎng)絡(luò)拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)中節(jié)點重要性評價方法的研究[D];北京交通大學(xué);2012年

4 吳洋;電子商務(wù)安全方法研究[D];天津大學(xué);2006年

5 黃麗民;計算機(jī)網(wǎng)絡(luò)信息系統(tǒng)安全評價方法研究[D];山東大學(xué);2005年

6 陳娜;高校校園網(wǎng)絡(luò)安全評價分析研究[D];山西財經(jīng)大學(xué);2011年

7 魏巍;面向客戶感知的網(wǎng)絡(luò)質(zhì)量評價系統(tǒng)研究與實現(xiàn)[D];電子科技大學(xué);2013年

8 曹成;基于GABP算法的復(fù)雜計算機(jī)網(wǎng)絡(luò)安全評價方法[D];合肥工業(yè)大學(xué);2007年

9 李超;神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)在高校門戶網(wǎng)站評價中的應(yīng)用研究[D];安徽大學(xué);2011年

10 薛春剛;基于QoS的語義Web服務(wù)選擇技術(shù)的研究[D];北京郵電大學(xué);2008年

，

本文編號：1907722