目的:驗證74重單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)（SNP,Single Nucleotide Polymorphism）復(fù)合擴(kuò)增體系用于全球十個區(qū)域亞人群（撒哈拉以南的非洲、北非、歐洲、西南亞、南亞、北亞、東亞、東南亞、大洋洲、美洲）推斷的準(zhǔn)確性。方法:基于Agena Mass ARRY平臺構(gòu)建74重SNP復(fù)合擴(kuò)增體系,檢測176份盲測樣本和10份已知族群的對照樣本,使用全球57個人群3628份個體SNP分型作為參考人群庫,使用項目組自主研發(fā)的族群來源推斷自動分析系統(tǒng)（DNA Ancestry Analyzer Version 1.0,以下簡稱DAA V1.0）計算176份盲測樣本和10份對照樣本的群體匹配概率（AMP,Population Assignment Match Probability）、似然比（LR,Likelihood Ratio）和族群成分,綜合分析三個結(jié)果進(jìn)行推斷。結(jié)果:176份盲測樣本的族群推斷結(jié)果與樣本信息一致性為92.34%,10份對照樣本族群推斷結(jié)果與樣本信息一致性為100%。結(jié)論:該74重SNP復(fù)合擴(kuò)增體系能夠準(zhǔn)確推斷未知個體洲際人群和亞人群來源,在實際案件中可應(yīng)用,為... 

【文章來源】：中國法醫(yī)學(xué)雜志. 2019,34(04)CSCD

【文章頁數(shù)】：6 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 樣本信息
    1.2 主要儀器
    1.3 DNA提取與定量
    1.4 檢測SNP分型
        1.4.1 PCR復(fù)合擴(kuò)增與純化
        1.4.2 單堿基延伸反應(yīng)
        1.4.3 樹脂純化
        1.4.4 芯片點(diǎn)樣
        1.4.5 質(zhì)譜檢測
    1.5 數(shù)據(jù)分析
2 結(jié)果
    2.1 群體匹配概率AMP和似然比LR
    2.2 族群成分分析
    2.3 族群推斷結(jié)果統(tǒng)計
3 討論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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[2]對于未知來源個體進(jìn)行族群推斷的自動分析系統(tǒng)[J]. 劉京,李盛,江麗,趙蕾,趙雯婷,豐蕾,劉海渤,季安全,李彩霞.  生命科學(xué)研究. 2018(01)
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[7]27重SNP種族推斷體系準(zhǔn)確性驗證研究[J]. 劉海渤,孫啟凡,陳健剛,魏以梁,李越,唐暉,程寶文,李平,迪力·夏提,張濤,馬泉,趙興春,李彩霞.  中國法醫(yī)學(xué)雜志. 2015(06)
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本文編號：3562231