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法醫(yī)學(xué)尸體組織中管家基因的穩(wěn)定性研究及影響因素分析

發(fā)布時(shí)間:2017-03-30 12:25

  本文關(guān)鍵詞:法醫(yī)學(xué)尸體組織中管家基因的穩(wěn)定性研究及影響因素分析,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


【摘要】:研究目的 在進(jìn)行基因表達(dá)研究之前,數(shù)據(jù)的標(biāo)準(zhǔn)化策略顯得尤為重要。理想的內(nèi)參基因應(yīng)該容易檢測(cè)并且在細(xì)胞周期中保持穩(wěn)定表達(dá)。在不同死后經(jīng)過時(shí)間里獲取的法醫(yī)學(xué)尸體組織對(duì)內(nèi)參基因的穩(wěn)定性提出了更高的要求。為了判斷通常使用的人體內(nèi)參照基因(管家基因)在不同的死后間隔時(shí)間內(nèi)的穩(wěn)定性,本課題組在前期動(dòng)物實(shí)驗(yàn)研究基礎(chǔ)上,以法醫(yī)學(xué)尸體組織中管家基因表達(dá)的穩(wěn)定性為主要研究目標(biāo),收集不同死后間隔時(shí)間的尸體檢材(腦皮質(zhì)、脾組織、胸大。,并延長觀察時(shí)間,使用實(shí)時(shí)定量RT-PCR技術(shù)檢測(cè)六種常用的管家基因HMBS、TFRC、B2M、GAPDH、HPRT1和OAZ1的Ct值,力求探究法醫(yī)學(xué)尸體組織中管家基因的穩(wěn)定性與完整性;并對(duì)rRNA各亞基(5s、5.8s、18s、28s)、非管家基因(HIF1A、TNF-a)進(jìn)行相對(duì)定量,試圖解決分子標(biāo)記物的選擇對(duì)RNA定量的影響;在此基礎(chǔ)上還初步研究了年齡對(duì)管家基因穩(wěn)定性的影響。 材料方法 研究對(duì)象:分別提取6例不同死后間隔時(shí)間的尸體上的三種組織(腦皮質(zhì)、脾組織和胸大。⒏鶕(jù)年齡段分為嬰幼兒組(0-3歲)和成人組(15-60歲),每組3例。尸檢即刻分別于大腦皮質(zhì)、脾組織、左側(cè)胸大肌處取1cm3大小組織塊(50mg),經(jīng)100mMCaCl2和PBS緩沖液清洗、RNAlater穩(wěn)定液處理后轉(zhuǎn)入-80度低溫冰箱保存?zhèn)溆。另取適量(5g)組織放入裝有PBS緩沖液的廣口瓶并離體放置于人工氣候箱中(比照生前環(huán)境溫、濕度設(shè)定),依次按不同時(shí)間點(diǎn)(48h、72h、96h、120h、144h、168h、192h、216h、240h)取樣,并分裝于RNAlater穩(wěn)定液中低溫凍存。 試驗(yàn)方法:組織提取RNA;RNA反轉(zhuǎn)錄為cDNA第一鏈;分別設(shè)計(jì)引物,通過實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)6例尸體腦皮質(zhì)、胸大肌、脾組織中不同時(shí)間點(diǎn)的六種常用的管家基因HMBS、TFRC、B2M、GAPDH、HPRT1和OAZ1的Ct值及rRNA各亞基(5s、5.8s、18s、28s)與非管家基因(HIF1A、TNF-a)的Ct值。 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理:實(shí)驗(yàn)所得數(shù)據(jù)采用均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差表示,多樣本均數(shù)比較采用方差分析,各組數(shù)據(jù)用SPSS13.0軟件進(jìn)行t檢驗(yàn)。 研究結(jié)果 1.6種管家基因在直到死后間隔時(shí)間第10天時(shí),,仍可以被檢出。其中大腦皮質(zhì)中,除管家基因OAZ1各時(shí)間點(diǎn)Ct值差別無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,其余5種管家基因HMBS在PMI=10天時(shí)Ct值開始顯著增高,TFRC、B2M、GAPDH、HPRT1在PMI=9天時(shí)Ct值開始顯著增高;脾組織中,6種管家基因除B2M在PMI=10天時(shí)Ct值開始顯著增高,其余管家基因HMBS、TFRC、GAPDH、HPRT1、OAZ1在PMI=9天時(shí)Ct值即開始顯著增高;而胸大肌內(nèi)6種管家基因各時(shí)間點(diǎn)Ct值差別均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,且Ct值上下波動(dòng)無規(guī)律性。 2.作為對(duì)照的2種非管家基因HIF1(低氧誘導(dǎo)因子,Hypoxia inducible factor1)、TNFα(腫瘤壞死因子α,Tumor necrosis factor α)盡管直到死后間隔時(shí)間第10天時(shí)仍可以被檢出,但其表達(dá)則無明顯的規(guī)律性可言,其中大腦皮質(zhì)中,TNFα和成人組HIF1A各時(shí)間點(diǎn)Ct值差別無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,嬰幼兒組HIF1A直到PMI=9天時(shí)Ct值顯著增高;脾組織中,TNFα各時(shí)間點(diǎn)Ct值差別無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,HIF1A直到PMI=9天時(shí)Ct值顯著增高;胸大肌內(nèi),TNFα和HIF1A各時(shí)間點(diǎn)Ct值差別無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,且Ct值上下波動(dòng)無規(guī)律性。 3.4種rRNA亞基在直到死后間隔時(shí)間第10天時(shí),仍可以被檢出。其中大腦皮質(zhì)中,4種rRNA亞基在PMI=10天時(shí)Ct值開始顯著增高;脾組織中,18s rRNA各時(shí)間點(diǎn)與第1時(shí)間點(diǎn)相比,Ct值差別無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義;但18s rRNA的Ct值先降低后增高,PMI=4天時(shí)是折點(diǎn)低值,因此PMI=9天、PMI=10天與PMI=4天相比,Ct值顯著增高,差別有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義;5s rRNA在PMI=10天時(shí)Ct值開始顯著增高,5.8s、28s在PMI=9天時(shí)Ct值即開始顯著增高;而胸大肌內(nèi),5s、5.8s、28s各時(shí)間點(diǎn)Ct值差別均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,且Ct值上下波動(dòng)無規(guī)律性;18s rRNA的Ct值在PMI=2天時(shí)顯著降低,之后各時(shí)間點(diǎn)之間相比,Ct值差別無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。 4.嬰幼兒組與成人組相比,管家基因的表達(dá)存在明顯差異,但年齡差異與死后經(jīng)過時(shí)間無交互作用。成人組內(nèi)年齡差異是否會(huì)影響PMI推斷尚需驗(yàn)證。 5.腦皮質(zhì)、脾組織中管家基因的穩(wěn)定性可保持死后經(jīng)過時(shí)間9天以上,胸大肌中管家基因死后10天內(nèi)仍然保持穩(wěn)定,但管家基因表達(dá)波動(dòng)無規(guī)律,無明顯時(shí)間相關(guān)性。 研究結(jié)論 1.法醫(yī)學(xué)尸體組織中管家基因的穩(wěn)定性較好,可在PMI9-10天內(nèi)保持穩(wěn)定,其穩(wěn)定性足以應(yīng)用于推斷晚期死后經(jīng)過時(shí)間的研究。管家基因的組織差異性明顯,腦皮質(zhì)、脾組織更適于推斷死后經(jīng)過時(shí)間。不同管家基因之間也存在一定的表達(dá)差異,應(yīng)該進(jìn)一步篩選穩(wěn)定性好的管家基因。非管家基因的波動(dòng)性較強(qiáng),不適于推斷死后經(jīng)過時(shí)間。 2.法醫(yī)學(xué)尸體組織中rRNA各類亞基的穩(wěn)定性與管家基因類似,除18srRNA表達(dá)波動(dòng)性較強(qiáng)外,其余rRNA亞基(5s、5.8s、28s)可以作為內(nèi)參基因用于死后經(jīng)過時(shí)間推斷,其表達(dá)規(guī)律性尚需進(jìn)一步驗(yàn)證。 3.嬰幼兒組織中管家基因的表達(dá)與成人相比有明顯統(tǒng)計(jì)學(xué)差異,在今后研究中應(yīng)加以注意。
【關(guān)鍵詞】:法醫(yī)病理學(xué) 管家基因 rRNA亞基 實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR 法醫(yī)學(xué)尸體組織
【學(xué)位授予單位】:山西醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2014
【分類號(hào)】:D919
【目錄】:
  • 摘要5-7
  • Abstract7-10
  • 前言10-12
  • 材料與方法12-16
  • 結(jié)果16-52
  • 討論52-56
  • 結(jié)論56-57
  • 參考文獻(xiàn)57-60
  • 附表 1 研究案例的個(gè)體信息60-61
  • 綜述61-67
  • 參考文獻(xiàn)65-67
  • 個(gè)人簡介67-68
  • 致謝68

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  本文關(guān)鍵詞:法醫(yī)學(xué)尸體組織中管家基因的穩(wěn)定性研究及影響因素分析,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。



本文編號(hào):277135

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