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基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和分子對(duì)接探討葛根-丹參藥對(duì)治療2型糖尿病作用機(jī)制研究

發(fā)布時(shí)間:2024-04-26 05:53
  目的基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和分子對(duì)接探討葛根-丹參藥對(duì)治療2型糖尿病潛在分子機(jī)制。方法通過中藥系統(tǒng)藥理學(xué)技術(shù)平臺(tái)(TCMSP)檢索葛根、丹參化學(xué)成分和作用靶點(diǎn);通過GeneCards數(shù)據(jù)庫(kù)獲取2型糖尿病相關(guān)靶標(biāo)基因,運(yùn)用Cytoscape3.7.1構(gòu)建成分-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)圖,綜合活性化合物與T2DM的交集基因,獲取蛋白相互作用關(guān)系,篩選出核心靶點(diǎn)。基于分子對(duì)接(AutoDock Vina)對(duì)篩選所得葛根、丹參活性成分與核心靶點(diǎn)進(jìn)行分子對(duì)接驗(yàn)證。最后進(jìn)行GO生物學(xué)過程和KEGG通路富集分析。結(jié)果葛根-丹參藥對(duì)成分-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)包含60個(gè)成分,155個(gè)相應(yīng)靶點(diǎn),其中57個(gè)靶點(diǎn)為葛根-丹參治療T2DM的靶點(diǎn)。分子對(duì)接結(jié)果顯示葛根素、芒柄花黃素、丹參酮ⅡA和木犀草素活性化合物與STAT3、AKT1、JUN、MAPK1有較佳的結(jié)合活性。主要的生物學(xué)過程包括血管的生成、炎癥反應(yīng)、細(xì)胞增殖、神經(jīng)保護(hù)作用,主要信號(hào)通路包括PI3K-AKT信號(hào)通路、糖尿病并發(fā)癥AGE/RAGE信號(hào)通路、TNF-α信號(hào)通路、IL-17信號(hào)通路等。結(jié)論網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)是從整體角度上闡述中藥作用機(jī)制的有效工具,葛根-丹參藥對(duì)通過網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)預(yù)測(cè)分子機(jī)...

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【部分圖文】:

圖1葛根-丹參藥對(duì)化合物-靶點(diǎn)相互網(wǎng)絡(luò)作用圖

圖1葛根-丹參藥對(duì)化合物-靶點(diǎn)相互網(wǎng)絡(luò)作用圖

網(wǎng)絡(luò)圖直觀反映化合物和靶點(diǎn)間相互作用,節(jié)點(diǎn)代表化合物,邊代表了化合物和靶點(diǎn)之間關(guān)系。黃色、粉色、藍(lán)色節(jié)點(diǎn)分別代表藥物靶點(diǎn)、葛根化合物、丹參化合物;衔-靶標(biāo)網(wǎng)絡(luò)包含了215個(gè)節(jié)點(diǎn)和954條邊,葛根-丹參藥對(duì)中每個(gè)化合物平均作用于15.9個(gè)靶標(biāo),每個(gè)靶標(biāo)平均與6.15個(gè)化合物連接....


圖2葛根-丹參作用靶點(diǎn)與T2DM靶點(diǎn)交集基因韋恩圖

圖2葛根-丹參作用靶點(diǎn)與T2DM靶點(diǎn)交集基因韋恩圖

本研究基于STRING數(shù)據(jù)庫(kù)分析葛根-丹參藥對(duì)治療T2DM作用靶點(diǎn)之間的交互作用,通過在線韋恩圖得到化合物-疾病共有基因57個(gè)導(dǎo)入STRING,交互作用可信度設(shè)置為最高值(0.900)構(gòu)建靶點(diǎn)相互作用網(wǎng)絡(luò)(圖3),并進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)分析。該網(wǎng)絡(luò)包括48個(gè)節(jié)點(diǎn)(9個(gè)靶點(diǎn)未發(fā)生蛋白互....


圖3葛根、丹參與T2DM蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)圖

圖3葛根、丹參與T2DM蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)圖

圖2葛根-丹參作用靶點(diǎn)與T2DM靶點(diǎn)交集基因韋恩圖2.5葛根-丹參藥對(duì)治療T2DM活性成分干預(yù)關(guān)鍵靶點(diǎn)的分子對(duì)接預(yù)測(cè)


圖4活性化合物與核心靶點(diǎn)最佳結(jié)合模式

圖4活性化合物與核心靶點(diǎn)最佳結(jié)合模式

KEGG結(jié)果分析,共富集136條信號(hào)通路,主要與PI3K-AKT信號(hào)通路、糖尿病并發(fā)癥的AGE/RAGE信號(hào)通路、TNF-α信號(hào)通路、IL-17信號(hào)通路、HIF-1信號(hào)通路、流體剪切應(yīng)力與動(dòng)脈粥樣硬化等有著密切聯(lián)系。圖4活性化合物與核心靶點(diǎn)最佳結(jié)合模式



本文編號(hào):3964807

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