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基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和分子對接探討葛根-丹參藥對治療2型糖尿病作用機(jī)制研究

發(fā)布時間:2024-04-26 05:53
  目的基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和分子對接探討葛根-丹參藥對治療2型糖尿病潛在分子機(jī)制。方法通過中藥系統(tǒng)藥理學(xué)技術(shù)平臺(TCMSP)檢索葛根、丹參化學(xué)成分和作用靶點;通過GeneCards數(shù)據(jù)庫獲取2型糖尿病相關(guān)靶標(biāo)基因,運用Cytoscape3.7.1構(gòu)建成分-靶點網(wǎng)絡(luò)圖,綜合活性化合物與T2DM的交集基因,獲取蛋白相互作用關(guān)系,篩選出核心靶點。基于分子對接(AutoDock Vina)對篩選所得葛根、丹參活性成分與核心靶點進(jìn)行分子對接驗證。最后進(jìn)行GO生物學(xué)過程和KEGG通路富集分析。結(jié)果葛根-丹參藥對成分-靶點網(wǎng)絡(luò)包含60個成分,155個相應(yīng)靶點,其中57個靶點為葛根-丹參治療T2DM的靶點。分子對接結(jié)果顯示葛根素、芒柄花黃素、丹參酮ⅡA和木犀草素活性化合物與STAT3、AKT1、JUN、MAPK1有較佳的結(jié)合活性。主要的生物學(xué)過程包括血管的生成、炎癥反應(yīng)、細(xì)胞增殖、神經(jīng)保護(hù)作用,主要信號通路包括PI3K-AKT信號通路、糖尿病并發(fā)癥AGE/RAGE信號通路、TNF-α信號通路、IL-17信號通路等。結(jié)論網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)是從整體角度上闡述中藥作用機(jī)制的有效工具,葛根-丹參藥對通過網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)預(yù)測分子機(jī)...

【文章頁數(shù)】:7 頁

【部分圖文】:

圖1葛根-丹參藥對化合物-靶點相互網(wǎng)絡(luò)作用圖

圖1葛根-丹參藥對化合物-靶點相互網(wǎng)絡(luò)作用圖

網(wǎng)絡(luò)圖直觀反映化合物和靶點間相互作用,節(jié)點代表化合物,邊代表了化合物和靶點之間關(guān)系。黃色、粉色、藍(lán)色節(jié)點分別代表藥物靶點、葛根化合物、丹參化合物;衔-靶標(biāo)網(wǎng)絡(luò)包含了215個節(jié)點和954條邊,葛根-丹參藥對中每個化合物平均作用于15.9個靶標(biāo),每個靶標(biāo)平均與6.15個化合物連接....


圖2葛根-丹參作用靶點與T2DM靶點交集基因韋恩圖

圖2葛根-丹參作用靶點與T2DM靶點交集基因韋恩圖

本研究基于STRING數(shù)據(jù)庫分析葛根-丹參藥對治療T2DM作用靶點之間的交互作用,通過在線韋恩圖得到化合物-疾病共有基因57個導(dǎo)入STRING,交互作用可信度設(shè)置為最高值(0.900)構(gòu)建靶點相互作用網(wǎng)絡(luò)(圖3),并進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)分析。該網(wǎng)絡(luò)包括48個節(jié)點(9個靶點未發(fā)生蛋白互....


圖3葛根、丹參與T2DM蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)圖

圖3葛根、丹參與T2DM蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)圖

圖2葛根-丹參作用靶點與T2DM靶點交集基因韋恩圖2.5葛根-丹參藥對治療T2DM活性成分干預(yù)關(guān)鍵靶點的分子對接預(yù)測


圖4活性化合物與核心靶點最佳結(jié)合模式

圖4活性化合物與核心靶點最佳結(jié)合模式

KEGG結(jié)果分析,共富集136條信號通路,主要與PI3K-AKT信號通路、糖尿病并發(fā)癥的AGE/RAGE信號通路、TNF-α信號通路、IL-17信號通路、HIF-1信號通路、流體剪切應(yīng)力與動脈粥樣硬化等有著密切聯(lián)系。圖4活性化合物與核心靶點最佳結(jié)合模式



本文編號:3964807

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