目的研究龍葵治療肺癌的藥理機制。方法以藥代動力學(xué)參數(shù)(口服生物利用度≥30%,藥物相似性≥0.18)作為篩選標準,從中藥成分檢索數(shù)據(jù)庫中篩選出龍葵的主要活性成分,并預(yù)測活性成分相關(guān)作用靶點。用Genecards數(shù)據(jù)庫查詢已知的肺癌治療靶點,通過Calculate and draw custom Venn diagrams構(gòu)建藥物靶點與肺癌靶點韋恩圖并獲得兩者共同靶點,用String數(shù)據(jù)庫繪制共同靶點的蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)圖;再用Cytoscape軟件構(gòu)建龍葵的成分-靶點-疾病網(wǎng)絡(luò)模型,用WebGestalt和David分別進行基因本體論和京都基因與基因組百科全書功能富集分析。結(jié)果共篩選出龍葵活性成分7個,相關(guān)靶點51個。根據(jù)蛋白質(zhì)相互作用(PPI)網(wǎng)絡(luò)圖,可知共有51個節(jié)點,146條關(guān)系。富集分析顯示龍葵可以通過多個通路對肺癌產(chǎn)生治療作用。結(jié)論龍葵可通過作用于多個靶點,并參與調(diào)控多個網(wǎng)絡(luò)通路發(fā)揮治療肺癌的作用。

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圖1龍葵的成分-靶點-疾病網(wǎng)絡(luò)圖

將上述所獲得的數(shù)據(jù)藥物、活性成分、靶點、疾病導(dǎo)入Cytoscape3.7.2軟件中進行網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建,從而得到其互作網(wǎng)絡(luò)圖。其中外周的菱形代表靶點,內(nèi)部的八邊形代表活性成分,長方形代表藥物,六邊形表示疾病(圖1)。通過藥物-成分-靶點-疾病網(wǎng)絡(luò)圖,可以大致了解到龍葵治療肺癌的基本互作....

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