基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的白及治療胃潰瘍的作用研究
發(fā)布時(shí)間:2022-07-12 16:58
目的基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法探討白及治療胃潰瘍可能的分子機(jī)制。方法通過(guò)中國(guó)知網(wǎng)、中藥系統(tǒng)藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)和分析平臺(tái)(TCMSP)等數(shù)據(jù)庫(kù),以生物利用度≥30%及類藥性≥0.18為篩選條件,收集白及藥材的主要化學(xué)成分。用PubChem數(shù)據(jù)庫(kù)獲得白及各活性成分的SMILES結(jié)構(gòu)或2D結(jié)構(gòu),通過(guò)Swiss Target Prediction和Drugbank數(shù)據(jù)庫(kù)篩選出藥物成分潛在作用靶點(diǎn)。用GeneCards數(shù)據(jù)庫(kù)預(yù)測(cè)并篩選胃潰瘍的潛在作用靶點(diǎn),用FunRich軟件繪制韋恩圖,對(duì)藥物靶點(diǎn)和疾病靶點(diǎn)進(jìn)行匹配映射,獲得白及治療胃潰瘍的潛在靶點(diǎn)。首先借助Cytoscape軟件構(gòu)建"活性成分-關(guān)鍵靶點(diǎn)"網(wǎng)絡(luò)。通過(guò)STRING數(shù)據(jù)庫(kù)結(jié)合Cytoscape軟件繪制蛋白-蛋白互作網(wǎng)絡(luò)圖作用圖,并進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)拓?fù)鋮?shù)分析,篩選白及治療胃潰瘍的關(guān)鍵靶點(diǎn)。再者用DAVID數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)白及治療胃潰瘍的關(guān)鍵靶點(diǎn)進(jìn)行基因本體富集分析及東京基因組百科全書(shū)通路富集分析,并構(gòu)建"成分-靶點(diǎn)-通路"網(wǎng)絡(luò)圖。結(jié)果通過(guò)篩選得到9個(gè)白及活性成分,排除重復(fù)后共有452個(gè)潛在靶點(diǎn);與胃潰瘍的靶點(diǎn)匹配后得到41個(gè)關(guān)鍵靶點(diǎn)。通過(guò)富集分析得到,白及活性成分...
【文章頁(yè)數(shù)】:4 頁(yè)
【文章目錄】:
材料與方法
1 白及化學(xué)成分的篩選
2 白及相關(guān)靶點(diǎn)信息的篩選
3 胃潰瘍相關(guān)靶點(diǎn)的篩選
4 構(gòu)建活性成分-關(guān)鍵靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)
5 構(gòu)建PPI網(wǎng)絡(luò)
6 白及作用通路的富集分析與活性成分-核心靶點(diǎn)-通路PPI構(gòu)建
結(jié) 果
1 白及活性化合物及其對(duì)應(yīng)靶點(diǎn)的確定
2 胃潰瘍靶點(diǎn)的確定
3 活性成分-關(guān)鍵靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)圖的分析
4 PPI網(wǎng)絡(luò)的分析
5 靶點(diǎn)通路富集分析
6 活性成分-關(guān)鍵靶點(diǎn)-信號(hào)通路網(wǎng)絡(luò)分析
討 論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的氣滯胃痛顆?寡祖(zhèn)痛活性作用分析[J]. 楊曉娟,胡黃婉茵,張海珠,郝俊杰,劉靖,劉曉熠,王玄,鄔國(guó)松,肖小河,牛明,羅光明. 中草藥. 2019(13)
[2]白及對(duì)阿司匹林致大鼠胃潰瘍的治療作用研究[J]. 高俊,丁興紅,丁志山,范永升. 浙江中醫(yī)藥大學(xué)學(xué)報(bào). 2019(02)
[3]網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)在中藥作用機(jī)制中的研究進(jìn)展[J]. 邢心睿,呂狄亞,柴逸峰,朱臻宇. 藥學(xué)實(shí)踐雜志. 2018(02)
本文編號(hào):3659503
【文章頁(yè)數(shù)】:4 頁(yè)
【文章目錄】:
材料與方法
1 白及化學(xué)成分的篩選
2 白及相關(guān)靶點(diǎn)信息的篩選
3 胃潰瘍相關(guān)靶點(diǎn)的篩選
4 構(gòu)建活性成分-關(guān)鍵靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)
5 構(gòu)建PPI網(wǎng)絡(luò)
6 白及作用通路的富集分析與活性成分-核心靶點(diǎn)-通路PPI構(gòu)建
結(jié) 果
1 白及活性化合物及其對(duì)應(yīng)靶點(diǎn)的確定
2 胃潰瘍靶點(diǎn)的確定
3 活性成分-關(guān)鍵靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)圖的分析
4 PPI網(wǎng)絡(luò)的分析
5 靶點(diǎn)通路富集分析
6 活性成分-關(guān)鍵靶點(diǎn)-信號(hào)通路網(wǎng)絡(luò)分析
討 論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的氣滯胃痛顆?寡祖(zhèn)痛活性作用分析[J]. 楊曉娟,胡黃婉茵,張海珠,郝俊杰,劉靖,劉曉熠,王玄,鄔國(guó)松,肖小河,牛明,羅光明. 中草藥. 2019(13)
[2]白及對(duì)阿司匹林致大鼠胃潰瘍的治療作用研究[J]. 高俊,丁興紅,丁志山,范永升. 浙江中醫(yī)藥大學(xué)學(xué)報(bào). 2019(02)
[3]網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)在中藥作用機(jī)制中的研究進(jìn)展[J]. 邢心睿,呂狄亞,柴逸峰,朱臻宇. 藥學(xué)實(shí)踐雜志. 2018(02)
本文編號(hào):3659503
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