山西不同產(chǎn)地酸棗仁的ITS序列比較研究
發(fā)布時(shí)間:2022-06-02 22:54
目的:通過(guò)分析山西不同產(chǎn)地酸棗仁核糖體基因內(nèi)部轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)序列,為酸棗仁藥材鑒定提供DNA分子標(biāo)記方法。方法:采用植物基因組DNA快速提取試劑盒的方法,提取22個(gè)不同產(chǎn)地酸棗仁藥材中的總DNA,以通用引物采用PCR擴(kuò)增rDNA-ITS序列并測(cè)序。采用contig分析軟件進(jìn)行序列拼接、CLUSTAL X軟件進(jìn)行序列比對(duì),再使用MEGA 7.0軟件進(jìn)行遺傳分析并構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)。結(jié)果:種內(nèi)變異位點(diǎn)分析共獲得22條ITS序列,11個(gè)單倍型,根據(jù)單倍型的數(shù)目,單倍型1、單倍型2、單倍型3為酸棗仁的核心單倍型,占所有條帶的60.87%。種間序列分析NJ樹(shù)分為兩大支,正品酸棗仁與偽品枳椇子各一支,聚類分析可以對(duì)酸棗仁及其偽品ITS序列差異進(jìn)行識(shí)別。結(jié)論:rDNA-ITS序列可用于對(duì)山西不同產(chǎn)地酸棗仁的分析,是酸棗仁藥材分子鑒定的有效方法之一。
【文章頁(yè)數(shù)】:6 頁(yè)
【文章目錄】:
材料
1. 儀器
2. 試劑
方法
1.DNA提取
2. DNA濃度檢測(cè)
3. PCR擴(kuò)增
3.1 引物
3.2 反應(yīng)體系
3.3 PCR反應(yīng)體系條件考察
3.3.1 退火溫度的考察:實(shí)驗(yàn)隨機(jī)選用樣品T1和J2,設(shè)置溫
3.3.2 DNA模板濃度考察:實(shí)驗(yàn)選用樣品T1和J2考察PCR
3.4 循環(huán)參數(shù)
4. 電泳
5. PCR產(chǎn)物測(cè)序
5.1 種內(nèi)變異位點(diǎn)分
5.2 種間序列分析
結(jié)果與序列分析
討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]中藥白頭翁及混偽品的DNA條形碼分子鑒定[J]. 張丹純,宮璐,黃志海. 中華中醫(yī)藥雜志. 2020(02)
[2]南方紅豆杉不同組織總RNA提取方法研究[J]. 陶倩,范慧艷,張水利,陳如兵,樓柯浪,張春椿. 中華中醫(yī)藥雜志. 2018(08)
[3]酸棗仁湯治療失眠的有效成分預(yù)測(cè)與靶點(diǎn)通路分析[J]. 鄺梓君,湯順莉,黃雁,趙金龍,陳國(guó)銘,張家萌,張琳琳,張潔,田燕華,賴家文. 中華中醫(yī)藥雜志. 2018(08)
[4]酸棗仁、理?xiàng)椚始拌讞鹤拥娘@微鑒別[J]. 王雪,楊光,周修騰,邵愛(ài)娟,韋穎,池秀蓮,李穎,程蒙,李曉琳. 現(xiàn)代中藥研究與實(shí)踐. 2018(03)
[5]酸棗仁中黃酮成分及其藥理作用研究進(jìn)展[J]. 張婷,張巖,王文彤,陶遵威. 天津藥學(xué). 2018(01)
[6]Molecular Identification of Salvia miltiorrhiza Bge. and Its Adulterants Based on ITS2 Sequences[J]. Ping ZHANG,Xianjun LI,Weibo DU,Jingran CHEN,Jing FU,Zhiqiang ZHANG,Jianmei SHEN. Agricultural Biotechnology. 2018(01)
[7]市售中藥材冬葵子和苘麻子ITS2條形碼鑒定[J]. 高婷,辛天怡,宋潔潔,宋經(jīng)元. 中草藥. 2017(13)
[8]基于ITS序列位點(diǎn)特異性PCR的酸棗仁及其混偽品的鑒別[J]. 李桂林,宋雅迪,呂振暉,劉春暉,李佳,張夏楠. 中國(guó)現(xiàn)代中藥. 2016(12)
[9]中藥酸棗仁的真?zhèn)舞b別方法研究[J]. 劉薇,李明華,余坤子,程顯隆,魏鋒,馬雙成. 藥物分析雜志. 2015(09)
[10]五味子科的系統(tǒng)發(fā)育:核糖體DNAITS區(qū)序列證據(jù)[J]. 劉忠,汪小全,陳之端,林祁,路安民. 植物學(xué)報(bào). 2000(07)
本文編號(hào):3653239
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材料
1. 儀器
2. 試劑
方法
1.DNA提取
2. DNA濃度檢測(cè)
3. PCR擴(kuò)增
3.1 引物
3.2 反應(yīng)體系
3.3 PCR反應(yīng)體系條件考察
3.3.1 退火溫度的考察:實(shí)驗(yàn)隨機(jī)選用樣品T1和J2,設(shè)置溫
3.3.2 DNA模板濃度考察:實(shí)驗(yàn)選用樣品T1和J2考察PCR
3.4 循環(huán)參數(shù)
4. 電泳
5. PCR產(chǎn)物測(cè)序
5.1 種內(nèi)變異位點(diǎn)分
5.2 種間序列分析
結(jié)果與序列分析
討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]中藥白頭翁及混偽品的DNA條形碼分子鑒定[J]. 張丹純,宮璐,黃志海. 中華中醫(yī)藥雜志. 2020(02)
[2]南方紅豆杉不同組織總RNA提取方法研究[J]. 陶倩,范慧艷,張水利,陳如兵,樓柯浪,張春椿. 中華中醫(yī)藥雜志. 2018(08)
[3]酸棗仁湯治療失眠的有效成分預(yù)測(cè)與靶點(diǎn)通路分析[J]. 鄺梓君,湯順莉,黃雁,趙金龍,陳國(guó)銘,張家萌,張琳琳,張潔,田燕華,賴家文. 中華中醫(yī)藥雜志. 2018(08)
[4]酸棗仁、理?xiàng)椚始拌讞鹤拥娘@微鑒別[J]. 王雪,楊光,周修騰,邵愛(ài)娟,韋穎,池秀蓮,李穎,程蒙,李曉琳. 現(xiàn)代中藥研究與實(shí)踐. 2018(03)
[5]酸棗仁中黃酮成分及其藥理作用研究進(jìn)展[J]. 張婷,張巖,王文彤,陶遵威. 天津藥學(xué). 2018(01)
[6]Molecular Identification of Salvia miltiorrhiza Bge. and Its Adulterants Based on ITS2 Sequences[J]. Ping ZHANG,Xianjun LI,Weibo DU,Jingran CHEN,Jing FU,Zhiqiang ZHANG,Jianmei SHEN. Agricultural Biotechnology. 2018(01)
[7]市售中藥材冬葵子和苘麻子ITS2條形碼鑒定[J]. 高婷,辛天怡,宋潔潔,宋經(jīng)元. 中草藥. 2017(13)
[8]基于ITS序列位點(diǎn)特異性PCR的酸棗仁及其混偽品的鑒別[J]. 李桂林,宋雅迪,呂振暉,劉春暉,李佳,張夏楠. 中國(guó)現(xiàn)代中藥. 2016(12)
[9]中藥酸棗仁的真?zhèn)舞b別方法研究[J]. 劉薇,李明華,余坤子,程顯隆,魏鋒,馬雙成. 藥物分析雜志. 2015(09)
[10]五味子科的系統(tǒng)發(fā)育:核糖體DNAITS區(qū)序列證據(jù)[J]. 劉忠,汪小全,陳之端,林祁,路安民. 植物學(xué)報(bào). 2000(07)
本文編號(hào):3653239
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