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基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)聯(lián)合分子對(duì)接對(duì)逍遙散干預(yù)原發(fā)性肝癌的作用機(jī)制研究

發(fā)布時(shí)間:2022-01-23 12:32
  為探索逍遙散干預(yù)原發(fā)性肝癌(HCC)的作用機(jī)制。運(yùn)用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的方法,通過(guò)中藥系統(tǒng)藥理學(xué)技術(shù)平臺(tái)(TCMSP)網(wǎng)站檢索逍遙散的主要活性成分及對(duì)應(yīng)的作用靶點(diǎn),再利用GEO數(shù)據(jù)庫(kù)篩選并分析原發(fā)性肝癌的差異基因,采用Cytoscape3.7.2軟件構(gòu)建活性成分—靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)圖,利用Biso Genet插件分析篩選得出PPI蛋白互作網(wǎng)絡(luò)和PPI網(wǎng)絡(luò)的關(guān)鍵節(jié)點(diǎn),然后運(yùn)用生物信息學(xué)的方法對(duì)關(guān)鍵靶點(diǎn)進(jìn)行基因功能分析和通路富集分析。最后使用分子對(duì)接技術(shù)對(duì)化合物核心成分與關(guān)鍵靶點(diǎn)進(jìn)行對(duì)接驗(yàn)證。通過(guò)分析得到逍遙散作用于HCC的交集基因27個(gè),GO富集顯示逍遙散的生物功能主要設(shè)涉及無(wú)機(jī)物質(zhì)細(xì)胞反應(yīng)、趨化因子活動(dòng)、細(xì)胞周期性蛋白依賴復(fù)合物等方面;KEGG通路富集顯示逍遙散影響的通路主要有細(xì)胞衰老信號(hào)通路、甾類激素生物合成信號(hào)通路、p53信號(hào)通路等。分子對(duì)接結(jié)果顯示逍遙散核心成分與HCC關(guān)鍵靶點(diǎn)親和力良好。綜上逍遙散改善HCC存在多成分、多靶點(diǎn)和多重藥理作用,為進(jìn)一步研究治療HCC提供了線索。 

【文章來(lái)源】:天然產(chǎn)物研究與開(kāi)發(fā). 2020,32(08)北大核心CSCD

【文章頁(yè)數(shù)】:14 頁(yè)

【部分圖文】:

基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)聯(lián)合分子對(duì)接對(duì)逍遙散干預(yù)原發(fā)性肝癌的作用機(jī)制研究


HCC差異基因火山圖

活性成分,靶點(diǎn)


27個(gè)逍遙散—HCC交集基因影響了271個(gè)生物學(xué)過(guò)程,選取P值排名20的功能信息,圖5~7。圖表顯示逍遙散活性成分主要富集在無(wú)機(jī)物質(zhì)細(xì)胞反應(yīng)、細(xì)胞激素代謝過(guò)程金屬離子反應(yīng)、類固醇分解過(guò)程、伯醇代謝過(guò)程等生物過(guò)程中,在分子功能方面,主要涉及趨化因子活動(dòng)、氧化還原酶活性、趨化因子受體結(jié)合等,細(xì)胞組成主要影響細(xì)胞周期蛋白復(fù)合物、蛋白激酶全酶復(fù)合物、絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶復(fù)合物等。表1 逍遙散干預(yù)HCC的有效分子成分Table 1 The effective molecular components of Xiaoyaosan in the intervention of HCC Mol Drug Mol Drug MOL005016 Gancao MOL004835 Gancao MOL004913 Gancao MOL005020 Gancao MOL004653 Chaihu MOL004898 Gancao MOL013187 Chaihu MOL004814 Gancao MOL000296 Fuling MOL000449 multiDrug MOL004915 Gancao MOL000275 Fuling MOL004949 Gancao MOL004810 Gancao MOL004838 Gancao MOL004959 Gancao MOL004912 Gancao MOL004990 Gancao MOL000098 multiDrug MOL005003 Gancao MOL004829 Gancao MOL000279 Fuling MOL000359 multiDrug MOL004948 Gancao MOL004941 Gancao MOL004966 Gancao MOL005012 Gancao MOL000492 Baishao MOL002311 Gancao MOL000049 Baizhu MOL004808 Gancao MOL004827 Gancao MOL004904 Gancao MOL004855 Gancao

示意圖,富集,靶點(diǎn),功能分析


Symbol Uniprot ID Protein names Degree Betweenness CUL2 Q13617 Cullin-2,CUL-2 134 249.05 CUL3 Q13618 Cullin-3,CUL-3 282 848.13 CTNNB1 P35222 Catenin beta-1 136 327.95 CAND1 Q86VP6 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 176 297.83 CUL1 Q13616 Cullin-1,CUL-1 214 533.84 CDC5L Q99459 Cell division cycle 5-like protein 158 266.87 CDK1 P11440 Cyclin-dependent kinase 1 281 354.28圖5 GO富集功能分析柱狀圖(CC富集結(jié)果)

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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本文編號(hào):3604355

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