目的:利用網(wǎng)絡(luò)藥理學的研究方法,探索金蓮花抗炎作用機制。方法:利用中藥系統(tǒng)藥理學數(shù)據(jù)庫與分析平臺搜索金蓮花活性成分及活性成分相關(guān)靶點,在Uniprot數(shù)據(jù)庫進行靶點蛋白的基因校正后,利用Cytoscape 3.7.2軟件構(gòu)建活性成分-靶點基因網(wǎng)絡(luò);在NCBI數(shù)據(jù)庫,搜索"inflammation",得到與人類炎癥相關(guān)的基因,用Cytoscape 3.7.2軟件構(gòu)建炎癥靶點相互作用網(wǎng)絡(luò),將其與金蓮花活性成分-靶點網(wǎng)絡(luò)融合,獲得金蓮花活性成分的抗炎作用靶點。結(jié)果:中藥系統(tǒng)藥理學數(shù)據(jù)庫與分析平臺（TCMSP）檢索到金蓮花口服利用度≧30%,類藥性≧0.18的活性成分7個,7個活性成分作用靶點共計183個蛋白,在Uniprot數(shù)據(jù)庫檢索并校正得到靶點基因166個;將6個活性成分與靶點基因數(shù)據(jù)導(dǎo)入Cytoscape 3.7.2軟件,得到自由度≥5的靶點基因3個,分別是Ptgs1、Ptgs2、Ncoa2;在NCBI網(wǎng)站數(shù)據(jù)庫檢索"inflammation",得到與人類炎癥相關(guān)基因1882個;利用Cytoscape 3.7.2軟件將6個活性成分的166個靶點與炎癥相關(guān)1882個靶點構(gòu)建金蓮花-抗炎的... 

【文章來源】：中醫(yī)藥學報. 2020,48(08)

【文章頁數(shù)】：4 頁

【部分圖文】：

活性成分-靶點基因網(wǎng)絡(luò)圖

表2 靶點基因Ptgs1、Ptgs2、Ncoa2在網(wǎng)絡(luò)中的具體參數(shù)信息 名稱 平均最短路徑長度 中心度 接近中心度 自由度 Ptgs1 1.988 235 29 0.021 515 91 0.502 958 58 5 Ptgs2 1.988 235 29 0.021 515 91 0.502 958 58 5 Ncoa2 1.964 705 88 0.043 500 38 0.508 982 04 62.3 金蓮花活性成分-抗炎作用靶點網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建

將2.1所得6種活性化合物的166個靶點與2.2炎癥的相關(guān)1 882個靶點進行映射,即兩者取交集,構(gòu)建金蓮花-抗炎的預(yù)測靶點。即利用 Cytoscape 3.7.2軟件的merge功能獲得金蓮花活性成分-抗炎作用靶點網(wǎng)絡(luò),圖3。圖3中金蓮花活性成分與抗炎靶點的交集(去除重復(fù))共計87個。其中,刺槐素(acacetin)抗炎靶點16個,β-谷甾醇(beta-sitosterol)抗炎靶點15個,谷甾醇(sitosterol)抗炎靶點2個,果膠蛋白(Pectolinarigenin)抗炎靶點6個,玄參黃酮(Skrofulein)抗炎靶點5個,槲皮素(quercetin)抗炎靶點80個。6種活性成分相對應(yīng)的抗炎靶點個數(shù)及名稱見表3。表3 6種活性成分相對應(yīng)的抗炎靶點個數(shù)及名稱 分子名稱 個數(shù) 基因名稱 acacetin 16 Ptgs1/Ar/Ptgs2/Dpp4/Prss1/Pik3Cg/Adrb2/etc. beta-sitosterol 15 Pgr/Ptgs1Ptgs2/Pik3Cg/Scn5A/Adra1A/Adra1B/etc. sitosterol 2 Pgr/Nr3C2 Pectolinarigenin 6 Scn5A/Ptgs2/Adra1B/Dpp4/Prss1/Ptgs1 Skrofulein 5 Ptgs1/Scn5A/Ptgs2/Dpp4/Prss1 quercetin 80 Ptgs1/Ar/Pparg/Ptgs2/Dpp4/Prss1/Top2A/Scn5A/etc.

【參考文獻】：
期刊論文
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