目的運(yùn)用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和分子對(duì)接技術(shù)探究芩蘇膠囊防治新型冠狀病毒肺炎（COVID-19）的潛在藥效物質(zhì)。方法采用中藥系統(tǒng)藥理學(xué)分析平臺(tái)（TCMSP）檢索出芩蘇膠囊中4味藥材（黃芩、紫蘇子、苦參和丹參）所含有效成分與作用靶點(diǎn);通過(guò)UniProt、GeneCards和OMIM數(shù)據(jù)庫(kù),篩選出COVID-19相關(guān)靶點(diǎn),得到與芩蘇膠囊有效成分作用的共同靶點(diǎn),采用String數(shù)據(jù)庫(kù)構(gòu)建PPI網(wǎng)絡(luò);借助Cytoscape3.7.2構(gòu)建"中藥-化合物-靶點(diǎn)"網(wǎng)絡(luò);運(yùn)用DAVID數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)相關(guān)靶點(diǎn)進(jìn)行GO功能和KEGG通路的富集分析;通過(guò)分子對(duì)接技術(shù)評(píng)價(jià)"中藥-成分-靶點(diǎn)"網(wǎng)絡(luò)中核心成分與COVID-19的3CL水解酶及血管緊張素轉(zhuǎn)化酶Ⅱ（ACE2）的結(jié)合作用。結(jié)果芩蘇膠囊"中藥-成分-靶點(diǎn)"網(wǎng)絡(luò)121個(gè)化合物和274個(gè)相關(guān)靶點(diǎn),包含14個(gè)核心化合物和33個(gè)核心靶點(diǎn)。GO功能富集分析得到527個(gè)條目,主要涉及藥物應(yīng)答、炎癥反應(yīng)、RNA聚合酶Ⅱ啟動(dòng)子轉(zhuǎn)錄的正調(diào)控等。KEGG路富集共得到111條信號(hào)通路,篩選得到20條信號(hào)通路,涉及乙型肝炎、甲型流感、肺結(jié)核等與病毒感染相關(guān)的通路。分子對(duì)接表明,芩蘇膠囊中14個(gè)核... 

【文章來(lái)源】：上海中醫(yī)藥雜志. 2020,54(10)

【文章頁(yè)數(shù)】：11 頁(yè)

【部分圖文】：

芩蘇膠囊與COVID-19靶點(diǎn)韋恩圖

運(yùn)用Cytoscape 3.7.2軟件構(gòu)建“中藥-化合物-靶點(diǎn)”網(wǎng)絡(luò)(圖5),有4個(gè)藥材節(jié)點(diǎn)、121個(gè)化合物節(jié)點(diǎn)及274種靶點(diǎn)節(jié)點(diǎn),共計(jì)399個(gè)節(jié)點(diǎn)和1 960條邊。其中黃色圓形代表黃芩、丹參、苦參和紫蘇子的化合物,藍(lán)色長(zhǎng)方形代表活性成分所對(duì)應(yīng)的靶點(diǎn)。圖4 芩蘇膠囊作用的關(guān)鍵靶點(diǎn)

通過(guò)TCMSP、TCMID與已有文獻(xiàn)報(bào)道,檢索到芩蘇膠囊中5味中藥中的化合物共615個(gè)。由于芩蘇膠囊的給藥方式是通過(guò)口服,類(lèi)藥性(DL)值表示成分與已知化學(xué)藥物的相似性,對(duì)確定中藥成分是否具有活性有重要參考價(jià)值。一般認(rèn)為OB值越大代表藥物生物活性成分的DL越好[15-16]。以O(shè)B≥30%和DL≥0.18為篩選標(biāo)準(zhǔn),除重后有效成分共121個(gè),其中紫蘇梗已知化合物有29個(gè),但其有效成分均不在篩選標(biāo)準(zhǔn)內(nèi),4味藥材除重后共預(yù)測(cè)靶標(biāo)274個(gè)。方中各藥材有效成分和預(yù)測(cè)靶標(biāo)數(shù)量見(jiàn)圖1,部分藥材有效成分信息見(jiàn)表1。2.2 COVID-19靶點(diǎn)的收集與PPI網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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