發(fā)布時間：2021-11-20 00:40

　　目的:采用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和生物信息學(xué)方法探索"白術(shù)-茯苓"藥對治療膝骨關(guān)節(jié)炎（OA）的"中藥-成分-靶點"調(diào)控網(wǎng)絡(luò)和分子機(jī)制。方法:在BATMAN-TCM數(shù)據(jù)庫檢索白術(shù)（BAI ZHU）及茯苓（FU LING）對應(yīng)的有效成分和靶點,篩選條件為score≥20且Adjusted P-value <0.05;在Gene數(shù)據(jù)庫中獲得膝骨關(guān)節(jié)炎對應(yīng)的靶點,關(guān)鍵詞為"Osteoarthritis";白術(shù)-茯苓對應(yīng)的靶點和骨關(guān)節(jié)炎靶點的交集作為"白術(shù)-茯苓"藥對干預(yù)骨關(guān)節(jié)炎的潛在作用靶點;使用DAVID數(shù)據(jù)庫分析靶點的GO和KEGG信號通路富集結(jié)果;基于STRING數(shù)據(jù)庫的信息分析蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)互相作用,通過Cytoscape 3.7.0軟件進(jìn)行PPI網(wǎng)絡(luò)可視化構(gòu)建和關(guān)鍵基因篩選。結(jié)果:"白術(shù)-茯苓"藥對總共篩選出32個有效成分,對應(yīng)548個靶點;骨關(guān)節(jié)炎對應(yīng)得到626個靶點;通過映射,篩選出交集靶點為71個;中藥-有效成分-靶點調(diào)控網(wǎng)絡(luò)包含94個節(jié)點,133條邊;GO功能富集結(jié)果主要涉及RNA聚合酶II啟動子轉(zhuǎn)錄的正調(diào)控、炎癥反應(yīng)、轉(zhuǎn)錄的正調(diào)控,DNA模板、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、凋亡過程的負(fù)調(diào)控等,KEG... 

【文章來源】：按摩與康復(fù)醫(yī)學(xué). 2020,11(16)

【文章頁數(shù)】：6 頁

【部分圖文】：

“白術(shù)-茯苓”藥對干預(yù)骨關(guān)節(jié)炎的作用靶點

通過Cytoscape軟件構(gòu)建中藥-有效成分-靶點調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，得知調(diào)控網(wǎng)絡(luò)包含94個節(jié)點，133條邊。中藥-有效成分-靶點調(diào)控網(wǎng)絡(luò)包含2個中藥，21個有效成分，71個作用靶點。其中白術(shù)包含4個有效成分，12個作用靶點；茯苓包含17個有效成分，66個作用靶點。見表1、圖2。2.3 GO和KEGG信號通路富集結(jié)果

通過String在線數(shù)據(jù)庫分析作用靶點蛋白相互網(wǎng)絡(luò)，通過Cytoscape對PPI網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行可視化后得知PPI蛋白互作網(wǎng)絡(luò)包括68個節(jié)點，597條邊。借助cytohubba插件中3種不同算法對PPI網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行計算分析，得到3個核心網(wǎng)絡(luò)，MCC算法核心網(wǎng)絡(luò)包括10個節(jié)點，45條邊；MNC算法核心網(wǎng)絡(luò)包括10個節(jié)點，44條邊；Degree算法核心網(wǎng)絡(luò)包括10個節(jié)點，44條邊。綜合3種算法的前10個核心靶點，得到13個核心靶點，分別為：白介素6(Interleukin.6,.IL-6）、腫瘤壞死因子（Tumor.Necrosis.Factor,.TNF）、白介素1β（Interleukin.1.Beta,.IL-1β）、基質(zhì)金屬肽酶9(Matrix.Metallopeptidase.9,.MMP-9）、前列腺素內(nèi)過氧化物合酶2(Prostaglandin-Endoperoxide.Synthase.2,.PTGS2）、腫瘤蛋白P53(Tumor.Protein.P53,.TP53）、轉(zhuǎn)化生長因子β1(Transforming.Growth.Factor.Beta.1,.TGF-β1）、過氧化物酶體增殖物激活受體γ（Peroxisome.Proliferator.Activated.Receptor.Gamma,.PPARG）、胰島素樣生長因子1(Insulin.Like.Growth.Factor.1,.IGF-1）、內(nèi)皮素1(Endothelin.1,.EDN1）、Fos原癌基因，AP-1轉(zhuǎn)錄因子亞基（Fos.Proto-Oncogene,.AP-1.Transcription Factor.Subunit,.FOS）、白介素4(Interleukin.4,.IL-4）、雌激素受體1(Estrogen.Receptor.1,.ESR1），見圖3。3 討論

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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碩士論文
[1]基于中醫(yī)傳承輔助系統(tǒng)分析中藥治療膝骨關(guān)節(jié)炎的應(yīng)用規(guī)律[D]. 高曼.北京中醫(yī)藥大學(xué) 2019



本文編號：3506214