基于網絡藥理學分析北劉寄奴的活性成分及其藥效作用機制
發(fā)布時間:2021-10-12 06:40
目的:基于網絡藥理學研究北劉寄奴藥理作用的物質基礎和作用機制。方法:通過中藥系統(tǒng)藥理學分析平臺(TCMSP)篩選北劉寄奴的化學成分、作用靶點、治療疾病。通過蛋白數據庫預測候選活性靶點相互關系,用生物信息學技術分析靶點的功能,通過基因本體(GO)功能和通路富集分析,研究北劉寄奴作用機制。結果:篩選共獲得5個有效化合物(其中1個化合物沒有相應的靶點),共44個相關靶點,涉及79種疾病。PPI網絡中有44個靶點,關鍵靶點有EGFR、CCND1等;蚬δ芨患Y果分析共涉及12個條目,包括細胞組成5個,分子功能2個,生物過程5個。通路富集分析得到7條通路,包括乙型肝炎、PI3K-Akt信號通路、細胞凋亡等。結論:北劉寄奴中木犀草素等活性成分通過作用于PTGS1、PRSS1、NCOA2等靶點,協同參與多條通路的調節(jié),發(fā)揮其抗炎、抗菌等作用。
【文章來源】:中醫(yī)藥導報. 2020,26(10)
【文章頁數】:6 頁
【部分圖文】:
北劉寄奴化合物-靶點網絡圖
將從STRING數據庫中所得的靶蛋白作用信息導入Cytoscape 3.6.0軟件,構建靶蛋白互作網絡圖,用軟件中的Network Analyzer進行網絡拓撲分析,得到靶點蛋白相互作用的關系。在圖2靶蛋白PPI網絡中,共有44個節(jié)點,259條邊。根據網絡圖中的Degree繪制排名前10的靶點蛋白的條形圖,見圖3。度值排名前3的是EGFR、CCND1、CASP3,分別可以與27、25、24個蛋白發(fā)生相互作用。2.4 北劉寄奴靶點-疾病網絡關系圖
通路富集分析,得到85條信號通路,根據FDR<0.01篩選出來7條信號通路(見表4、圖5),包括前列腺癌、乙型肝炎、PI3K-Akt信號通路、軍團病、細胞凋亡、胰腺癌、膀胱癌,結果表明北劉寄奴中的化合物發(fā)揮藥理作用治療疾病,要通過這幾條通路來實現。其中富集基因數排名前3的有前列腺癌、乙型肝炎、PI3K-Akt信號通路,有11個基因富集在前列腺癌通路上,分別為EGFR、AR、CCND1、CASP9、RELA、GSK3B、BCL2、ERBB2、NFKBIA、MDM2、RB1;有12個基因富集在乙型肝炎上,分別為PRKCA、CASP3、IL6、CCND1、CASP9、RELA、BCL2、CASP8、PC-NA、NFKBIA、BIRC5、RB1;有13個基因富集在PI3K-Akt信號通路上分別為EGFR、PRKCA、IL6、MCL1、RELA、CCND1、CASP9、CHRM2、BCL2、GSK3B、CHRM1、VEGFA、MDM2。3 討論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]木犀草素對人非小細胞肺癌A549細胞增殖、凋亡、侵襲及遷移能力的影響[J]. 任開明,周兆麗,石文君. 解剖科學進展. 2019(04)
[2]木犀草素逆轉由TGF-β1誘導的人肺癌細胞上皮-間充質轉化的實驗研究[J]. 繆存靜,陳俊杰,歷星,林鵬程,胡全. 中國病理生理雜志. 2019(07)
[3]木犀草素對哮喘患兒外周血單核細胞TNF-α和IL-6分泌的影響及機制研究[J]. 余潔,彭哲,謝婷,莫運波. 中國免疫學雜志. 2019(13)
[4]EBP50和EGFR在食管癌中的表達和臨床意義[J]. 蔡仁中,李高,蔡用清. 基因組學與應用生物學. 2018(12)
[5]肺腺癌細胞EGFR基因過表達和突變通過介導CXCR4/CXCL12信號通路表達導致腫瘤生物學行為改變的機制研究[J]. 馮佳,魏學燕,李闖,郭明雄,彭敏,宋啟斌,韓光. 中國肺癌雜志. 2018(07)
[6]木犀草素抑制與前列腺癌PC3細胞共培養(yǎng)的內皮細胞增殖、遷移及其分子機制[J]. 平耀東,梁泰剛,張艷華. 中國藥學雜志. 2018(07)
[7]木犀草素通過抑制PTEN PI3K-AKT信號通路以及對免疫功能的調節(jié)作用介導對肺癌模型大鼠的干預研究[J]. 周亮,喬印玲,王莉,朱蕾,張建勇. 天然產物研究與開發(fā). 2017(12)
[8]β-谷甾醇對阿司匹林致胃黏膜損傷副作用及其藥理作用的影響[J]. 肖志彬,劉小雷,成日青,賈韓學,王雪瑩,孔麗娜,李雨潔,崔婷婷,曲航達,馮晨,蒙婧. 中國實驗方劑學雜志. 2016(01)
[9]網絡藥理學與中醫(yī)藥現代研究的若干進展[J]. 張彥瓊,李梢. 中國藥理學與毒理學雜志. 2015(06)
[10]劉寄奴藥理研究及其臨床應用進展[J]. 賴慶. 浙江中醫(yī)雜志. 2015(07)
本文編號:3432071
【文章來源】:中醫(yī)藥導報. 2020,26(10)
【文章頁數】:6 頁
【部分圖文】:
北劉寄奴化合物-靶點網絡圖
將從STRING數據庫中所得的靶蛋白作用信息導入Cytoscape 3.6.0軟件,構建靶蛋白互作網絡圖,用軟件中的Network Analyzer進行網絡拓撲分析,得到靶點蛋白相互作用的關系。在圖2靶蛋白PPI網絡中,共有44個節(jié)點,259條邊。根據網絡圖中的Degree繪制排名前10的靶點蛋白的條形圖,見圖3。度值排名前3的是EGFR、CCND1、CASP3,分別可以與27、25、24個蛋白發(fā)生相互作用。2.4 北劉寄奴靶點-疾病網絡關系圖
通路富集分析,得到85條信號通路,根據FDR<0.01篩選出來7條信號通路(見表4、圖5),包括前列腺癌、乙型肝炎、PI3K-Akt信號通路、軍團病、細胞凋亡、胰腺癌、膀胱癌,結果表明北劉寄奴中的化合物發(fā)揮藥理作用治療疾病,要通過這幾條通路來實現。其中富集基因數排名前3的有前列腺癌、乙型肝炎、PI3K-Akt信號通路,有11個基因富集在前列腺癌通路上,分別為EGFR、AR、CCND1、CASP9、RELA、GSK3B、BCL2、ERBB2、NFKBIA、MDM2、RB1;有12個基因富集在乙型肝炎上,分別為PRKCA、CASP3、IL6、CCND1、CASP9、RELA、BCL2、CASP8、PC-NA、NFKBIA、BIRC5、RB1;有13個基因富集在PI3K-Akt信號通路上分別為EGFR、PRKCA、IL6、MCL1、RELA、CCND1、CASP9、CHRM2、BCL2、GSK3B、CHRM1、VEGFA、MDM2。3 討論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]木犀草素對人非小細胞肺癌A549細胞增殖、凋亡、侵襲及遷移能力的影響[J]. 任開明,周兆麗,石文君. 解剖科學進展. 2019(04)
[2]木犀草素逆轉由TGF-β1誘導的人肺癌細胞上皮-間充質轉化的實驗研究[J]. 繆存靜,陳俊杰,歷星,林鵬程,胡全. 中國病理生理雜志. 2019(07)
[3]木犀草素對哮喘患兒外周血單核細胞TNF-α和IL-6分泌的影響及機制研究[J]. 余潔,彭哲,謝婷,莫運波. 中國免疫學雜志. 2019(13)
[4]EBP50和EGFR在食管癌中的表達和臨床意義[J]. 蔡仁中,李高,蔡用清. 基因組學與應用生物學. 2018(12)
[5]肺腺癌細胞EGFR基因過表達和突變通過介導CXCR4/CXCL12信號通路表達導致腫瘤生物學行為改變的機制研究[J]. 馮佳,魏學燕,李闖,郭明雄,彭敏,宋啟斌,韓光. 中國肺癌雜志. 2018(07)
[6]木犀草素抑制與前列腺癌PC3細胞共培養(yǎng)的內皮細胞增殖、遷移及其分子機制[J]. 平耀東,梁泰剛,張艷華. 中國藥學雜志. 2018(07)
[7]木犀草素通過抑制PTEN PI3K-AKT信號通路以及對免疫功能的調節(jié)作用介導對肺癌模型大鼠的干預研究[J]. 周亮,喬印玲,王莉,朱蕾,張建勇. 天然產物研究與開發(fā). 2017(12)
[8]β-谷甾醇對阿司匹林致胃黏膜損傷副作用及其藥理作用的影響[J]. 肖志彬,劉小雷,成日青,賈韓學,王雪瑩,孔麗娜,李雨潔,崔婷婷,曲航達,馮晨,蒙婧. 中國實驗方劑學雜志. 2016(01)
[9]網絡藥理學與中醫(yī)藥現代研究的若干進展[J]. 張彥瓊,李梢. 中國藥理學與毒理學雜志. 2015(06)
[10]劉寄奴藥理研究及其臨床應用進展[J]. 賴慶. 浙江中醫(yī)雜志. 2015(07)
本文編號:3432071
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