基于網(wǎng)絡藥理學與分子對接探索血必凈治療新型冠狀病毒感染所致的ARDS的分子機制
發(fā)布時間:2021-10-06 19:27
目的:采用網(wǎng)絡藥理學和分子對接探索血必凈治療新型冠狀病毒(SARS-CoV-2)感染所致的急性呼吸窘迫綜合征(ARDS)的分子機制。方法:從數(shù)據(jù)庫中篩選ARDS差異基因及血必凈的有效活性成分和靶點,然后對二者的共同靶點進行基因本體(GO)富集分析及基因組百科全書(KEGG)通路分析,應用STRING平臺構建蛋白互作(PPI)網(wǎng)絡模型,利用Cytoscape軟件構建中藥-活性化學成分-靶點-疾病網(wǎng)絡圖、靶點-富集通路網(wǎng)絡圖以篩選出核心化合物、靶點以及通路,最后對核心靶點和化合物通過分子對接進行初步驗證。結果:得到ARDS差異表達基因349個,在血必凈中共有125個主要活性成分和1 447個預測靶點,篩選出7個核心化合物,6個藥物-疾病共同靶點,16條富集信號通路。分子對接結果顯示血必凈中的核心化合物與ACE2、SARS-CoV-2 3CL水解酶、AKT1、MAPK14具有較好的結合活性。結論:血必凈可能通過調(diào)控AKT1、MAPK14、ACE2、VEGF信號通路、色氨酸代謝、C型凝集素信號通路等多靶點、多途徑發(fā)揮對SARS-CoV-2導致的ARDS的治療作用。
【文章來源】:中藥藥理與臨床. 2020,36(03)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:8 頁
【部分圖文】:
ARDS患者差異基因火山圖
ARDS患者差異基因熱圖(前40個)
利用Perl軟件對ARDS差異基因、藥物預測靶點取交集,獲得藥物-疾病共同靶點,應用Cytoscape(3.7.2 )軟件構建中藥-活性化學成分-靶點-疾病網(wǎng)絡圖,見圖3,在網(wǎng)絡中有76個節(jié)點、80個邊緣、70個活性成分和6個藥物-疾病共同靶點有相互作用。使用network analyzer工具,分析網(wǎng)絡中的拓撲參數(shù),根據(jù) degree值得到7個核心化學成分:山柰酚(MOL000422,kaempferol)、槲皮素(MOL000098,quercetin)、楊梅酮(MOL002135,Myricanone)、豆甾醇(MOL000449,Stigmasterol)、β-胡蘿卜素(MOL002773,beta-carotene)、木犀草素(MOL000006,luteolin)、黃芩素(MOL002714,baicalein),主要集中在紅花和丹參中,AKT1,MAPK14和PTGS2為血必凈干預ARDS的主要靶點。2.5 PPI網(wǎng)絡構建
【參考文獻】:
期刊論文
[1]新型冠狀病毒肺炎診療方案(試行第六版)[J]. 中國感染控制雜志. 2020(02)
[2]新型冠狀病毒肺炎死亡尸體系統(tǒng)解剖大體觀察報告[J]. 劉茜,王榮帥,屈國強,王云云,劉盼,朱英芝,費耿,任亮,周亦武,劉良. 法醫(yī)學雜志. 2020(01)
[3]血必凈注射液治療新型冠狀病毒感染的肺炎(COVID-19)證據(jù)基礎及研究前瞻[J]. 李承羽,張曉雨,劉斯,商洪才. 世界科學技術-中醫(yī)藥現(xiàn)代化. 2020(02)
[4]新型冠狀病毒肺炎中醫(yī)預防及診療方案匯總分析[J]. 于明坤,柴倩云,梁昌昊,丁硯秋,林子宜,高佳琪,王涵,張立山,劉建平,費宇彤. 中醫(yī)雜志. 2020(05)
[5]血必凈注射液聯(lián)合人免疫球蛋白對重癥病毒性肺炎的療效[J]. 李衍生,陳煥明,曾捷. 中外醫(yī)學研究. 2019(09)
[6]血必凈注射液干預甲型H1N1流感重癥肺炎小鼠的療效及機制研究[J]. 馬月霞,郭亞麗,劉建,王玉光. 世界中醫(yī)藥. 2015(02)
本文編號:3420609
【文章來源】:中藥藥理與臨床. 2020,36(03)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:8 頁
【部分圖文】:
ARDS患者差異基因火山圖
ARDS患者差異基因熱圖(前40個)
利用Perl軟件對ARDS差異基因、藥物預測靶點取交集,獲得藥物-疾病共同靶點,應用Cytoscape(3.7.2 )軟件構建中藥-活性化學成分-靶點-疾病網(wǎng)絡圖,見圖3,在網(wǎng)絡中有76個節(jié)點、80個邊緣、70個活性成分和6個藥物-疾病共同靶點有相互作用。使用network analyzer工具,分析網(wǎng)絡中的拓撲參數(shù),根據(jù) degree值得到7個核心化學成分:山柰酚(MOL000422,kaempferol)、槲皮素(MOL000098,quercetin)、楊梅酮(MOL002135,Myricanone)、豆甾醇(MOL000449,Stigmasterol)、β-胡蘿卜素(MOL002773,beta-carotene)、木犀草素(MOL000006,luteolin)、黃芩素(MOL002714,baicalein),主要集中在紅花和丹參中,AKT1,MAPK14和PTGS2為血必凈干預ARDS的主要靶點。2.5 PPI網(wǎng)絡構建
【參考文獻】:
期刊論文
[1]新型冠狀病毒肺炎診療方案(試行第六版)[J]. 中國感染控制雜志. 2020(02)
[2]新型冠狀病毒肺炎死亡尸體系統(tǒng)解剖大體觀察報告[J]. 劉茜,王榮帥,屈國強,王云云,劉盼,朱英芝,費耿,任亮,周亦武,劉良. 法醫(yī)學雜志. 2020(01)
[3]血必凈注射液治療新型冠狀病毒感染的肺炎(COVID-19)證據(jù)基礎及研究前瞻[J]. 李承羽,張曉雨,劉斯,商洪才. 世界科學技術-中醫(yī)藥現(xiàn)代化. 2020(02)
[4]新型冠狀病毒肺炎中醫(yī)預防及診療方案匯總分析[J]. 于明坤,柴倩云,梁昌昊,丁硯秋,林子宜,高佳琪,王涵,張立山,劉建平,費宇彤. 中醫(yī)雜志. 2020(05)
[5]血必凈注射液聯(lián)合人免疫球蛋白對重癥病毒性肺炎的療效[J]. 李衍生,陳煥明,曾捷. 中外醫(yī)學研究. 2019(09)
[6]血必凈注射液干預甲型H1N1流感重癥肺炎小鼠的療效及機制研究[J]. 馬月霞,郭亞麗,劉建,王玉光. 世界中醫(yī)藥. 2015(02)
本文編號:3420609
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