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基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和分子對(duì)接研究淫羊藿治療抑郁癥的抗炎作用機(jī)制

發(fā)布時(shí)間:2021-10-01 04:40
  目的:采用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法預(yù)測(cè)淫羊藿治療抑郁癥的抗炎靶點(diǎn)及相關(guān)信號(hào)通路,探討其抗抑郁作用的潛在機(jī)制。方法:通過(guò)中藥系統(tǒng)藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)與分析平臺(tái)(TCMSP)數(shù)據(jù)庫(kù)搜集和篩選淫羊藿的活性成分;利用PharmMapper服務(wù)器,TCMSP數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)蛋白靶點(diǎn)進(jìn)行預(yù)測(cè)和篩選;利用OMIM數(shù)據(jù)庫(kù),CTD數(shù)據(jù)庫(kù)和GeneCards數(shù)據(jù)庫(kù)篩選抑郁癥的相關(guān)靶點(diǎn)以及抗炎靶點(diǎn);通過(guò)DAVID數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)關(guān)鍵抗炎靶點(diǎn)進(jìn)行基因本體(GO)功能富集和京都基因與基因組百科全書(KEGG)通路富集分析;利用Cytoscape 3.6.0軟件構(gòu)建淫羊藿"活性成分-作用靶點(diǎn)-信號(hào)通路"網(wǎng)絡(luò)圖,并對(duì)網(wǎng)絡(luò)拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)分析;采用GOLD分子對(duì)接軟件對(duì)活性成分與關(guān)鍵抗炎靶點(diǎn)進(jìn)行結(jié)果驗(yàn)證。結(jié)果:篩選得到淫羊藿與抑郁癥相關(guān)的12個(gè)活性成分,30個(gè)作用靶點(diǎn),5個(gè)關(guān)鍵抗炎靶點(diǎn);GO功能富集得到生物過(guò)程65個(gè),細(xì)胞組成4個(gè),分子功能1個(gè),KEGG通路富集分析得到41條,其中與炎癥相關(guān)的信號(hào)通路9個(gè);分子對(duì)接驗(yàn)證淫羊藿苷與關(guān)鍵抗炎靶點(diǎn)能夠形成最佳復(fù)合體。結(jié)論:揭示了淫羊藿通過(guò)抗炎靶點(diǎn)及其相關(guān)信號(hào)通路網(wǎng)絡(luò)作用于抑郁癥的分子機(jī)制,為進(jìn)一步研究淫羊藿抗抑郁作... 

【文章來(lái)源】:中國(guó)實(shí)驗(yàn)方劑學(xué)雜志. 2020,26(17)北大核心CSCD

【文章頁(yè)數(shù)】:8 頁(yè)

【部分圖文】:

基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和分子對(duì)接研究淫羊藿治療抑郁癥的抗炎作用機(jī)制


關(guān)鍵抗炎靶點(diǎn)蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)

網(wǎng)絡(luò)圖,靶點(diǎn),富集,網(wǎng)絡(luò)圖


關(guān)鍵抗炎靶點(diǎn)GO富集分析柱狀

網(wǎng)絡(luò)圖,靶點(diǎn),富集,活性成分


將上述所得活性成分、作用靶點(diǎn)以及信號(hào)通路同導(dǎo)入Cytoscape軟件進(jìn)行可視化處理構(gòu)建活性成分-作用靶點(diǎn)-信號(hào)通路網(wǎng)絡(luò)圖。該網(wǎng)絡(luò)圖中共83個(gè)節(jié)點(diǎn),224條邊,其中30個(gè)菱形節(jié)點(diǎn)為作用靶點(diǎn)(橙色為淫羊藿治療抑郁癥的抗炎靶點(diǎn),綠色為非抗炎靶點(diǎn)),12個(gè)六邊形節(jié)點(diǎn)代表活性成分,41個(gè)圓形節(jié)點(diǎn)表示共有抗炎靶點(diǎn)信號(hào)通路。淫羊藿的作用靶點(diǎn)蛋白有IL-1β,IL-2,IL-6,IL-10,TNF,MAPK1等。網(wǎng)絡(luò)圖中節(jié)點(diǎn)以不同形狀和顏色代表淫羊藿的活性成分,作用靶點(diǎn)和信號(hào)通路,兩節(jié)點(diǎn)之間的連線表示活性成分和作用靶點(diǎn)之間的相互作用。從圖中可知,一個(gè)活性成分不只是對(duì)應(yīng)一個(gè)作用靶點(diǎn),一個(gè)作用靶點(diǎn)也可對(duì)應(yīng)一個(gè)或多個(gè)活性成分,網(wǎng)絡(luò)圖充分體現(xiàn)了淫羊藿多成分、多靶點(diǎn)的相互作用的特征。見圖5。圖5 成分-靶點(diǎn)-通路網(wǎng)絡(luò)

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究梔子入血成分抗阿爾茨海默病的作用機(jī)制[J]. 張銳,張季林,李冰濤,花昌林,劉芮祺.  中國(guó)中藥雜志. 2020(11)
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博士論文
[1]利用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法探討連夏寧心方治療冠心病痰熱證藥理學(xué)機(jī)制的臨床與基礎(chǔ)研究[D]. 楊陽(yáng).北京中醫(yī)藥大學(xué) 2019
[2]百合地黃湯對(duì)CUMS抑郁模型大鼠的作用及機(jī)理研究[D]. 薛劍.黑龍江中醫(yī)藥大學(xué) 2018
[3]白介素-10抑制神經(jīng)炎癥和多巴胺能神經(jīng)元凋亡的研究[D]. 朱燕.蘇州大學(xué) 2016

碩士論文
[1]苦豆根中抗抑郁物質(zhì)基礎(chǔ)與分子機(jī)制研究[D]. 肖東.寧夏醫(yī)科大學(xué) 2019
[2]基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的復(fù)方中藥止顫粉治療帕金森病作用機(jī)制研究[D]. 齊心暢.吉林大學(xué) 2018
[3]皮質(zhì)酮啟動(dòng)增強(qiáng)小膠質(zhì)細(xì)胞免疫炎癥機(jī)制初探及淫羊藿黃酮類成分干預(yù)研究[D]. 邵麗飛.南京大學(xué) 2017



本文編號(hào):3417173

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