基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)推測和分子生物學(xué)驗(yàn)證探討半枝蓮抗胰腺癌的活性成分及其作用機(jī)制
發(fā)布時(shí)間:2021-09-02 04:26
目的運(yùn)用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)預(yù)測和分子生物學(xué)驗(yàn)證探討半枝蓮抗胰腺癌的活性成分及其作用機(jī)制。方法通過中醫(yī)藥系統(tǒng)藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫和分析平臺(TCMSP)篩選半枝蓮的活性成分和相關(guān)潛在靶點(diǎn);應(yīng)用毒性與基因比較數(shù)據(jù)庫(CTD)、治療靶點(diǎn)數(shù)據(jù)庫(TTD)、藥物基因組學(xué)知識庫(PharmGKB)建立胰腺腫瘤靶點(diǎn)數(shù)據(jù)庫;基于半枝蓮潛在靶點(diǎn)與胰腺腫瘤靶點(diǎn)的匹配結(jié)果,構(gòu)建PPI網(wǎng)絡(luò),拓?fù)浞治龊Y選核心靶點(diǎn);基于核心靶點(diǎn)的GO功能富集分析和KEGG通路富集分析建立半枝蓮抗胰腺癌的信號通路圖;采用Westernblotting驗(yàn)證半枝蓮中核心成分木犀草素對胰腺癌細(xì)胞PANC-1中P53、Bax和Bcl-2關(guān)鍵靶點(diǎn)的調(diào)控作用。結(jié)果共篩選出28種活性成分,包括槲皮素、木犀草素、漢黃芩素等;91個(gè)半枝蓮作用靶點(diǎn),經(jīng)拓?fù)浜Y選獲得24個(gè)核心靶點(diǎn),涉及TP53、AKT1、JUN、VEGF等。GO功能富集分析顯示,半枝蓮作用靶點(diǎn)共涉及到73條生物學(xué)過程,KEGG通路富集篩選出18條信號通路參與胰腺癌的治療,主要是通過NF-κB、p53、PI3K-Akt和VEGF信號通路來調(diào)節(jié)腫瘤炎性微環(huán)境、細(xì)胞周期阻滯、促細(xì)胞凋亡以及抗血管生成。分子生...
【文章來源】:中草藥. 2020,51(12)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:12 頁
【部分圖文】:
胰腺癌靶點(diǎn)和半枝蓮靶點(diǎn)的韋恩圖
將24個(gè)核心靶點(diǎn)與67個(gè)其他靶點(diǎn)進(jìn)一步構(gòu)建PPI網(wǎng)絡(luò)分析,并按節(jié)點(diǎn)大小降序排序(圖3)。節(jié)點(diǎn)越大說明該靶點(diǎn)連接的邊越多在網(wǎng)絡(luò)中作用越關(guān)鍵,如TP53、AKT1、JUN、MYC、CASP3、VEGFA和EGFR等。2.4 C-T網(wǎng)絡(luò)
GO功能富集獲得526條生物學(xué)過程,按照FDR≤0.01進(jìn)行篩選后獲得73條生物學(xué)過程,并對前25條顯著的生物學(xué)功能做圖展示,歸類后主要涉及到細(xì)胞凋亡、細(xì)胞周期、炎癥反應(yīng)和細(xì)胞增殖4個(gè)方面(圖5)。圖4 C-T網(wǎng)絡(luò)
本文編號:3378307
【文章來源】:中草藥. 2020,51(12)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:12 頁
【部分圖文】:
胰腺癌靶點(diǎn)和半枝蓮靶點(diǎn)的韋恩圖
將24個(gè)核心靶點(diǎn)與67個(gè)其他靶點(diǎn)進(jìn)一步構(gòu)建PPI網(wǎng)絡(luò)分析,并按節(jié)點(diǎn)大小降序排序(圖3)。節(jié)點(diǎn)越大說明該靶點(diǎn)連接的邊越多在網(wǎng)絡(luò)中作用越關(guān)鍵,如TP53、AKT1、JUN、MYC、CASP3、VEGFA和EGFR等。2.4 C-T網(wǎng)絡(luò)
GO功能富集獲得526條生物學(xué)過程,按照FDR≤0.01進(jìn)行篩選后獲得73條生物學(xué)過程,并對前25條顯著的生物學(xué)功能做圖展示,歸類后主要涉及到細(xì)胞凋亡、細(xì)胞周期、炎癥反應(yīng)和細(xì)胞增殖4個(gè)方面(圖5)。圖4 C-T網(wǎng)絡(luò)
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