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基于“蛋白質(zhì)組-修飾組”研究砂炒炮制對(duì)穿山甲蛋白質(zhì)類成分的影響

發(fā)布時(shí)間:2021-08-31 23:20
  目的基于蛋白質(zhì)、肽類物質(zhì)組成及修飾組成的變化,研究砂炒炮制對(duì)穿山甲物質(zhì)基礎(chǔ)的影響。方法采用Nano LC-MS/MS對(duì)炮制前后穿山甲蛋白質(zhì)、肽類組成及變化進(jìn)行分析鑒定,對(duì)鑒定的蛋白質(zhì)、肽類發(fā)生的脫酰胺修飾與氧化修飾進(jìn)行比較。結(jié)果穿山甲主要由角蛋白、連接蛋白、橋粒蛋白等結(jié)構(gòu)蛋白及促進(jìn)角質(zhì)致密結(jié)構(gòu)形成的異構(gòu)酶類組成。穿山甲經(jīng)炮制后,可溶性蛋白質(zhì)、肽類的鑒定數(shù)量未見(jiàn)明顯變化,難溶性蛋白質(zhì)鑒定數(shù)量顯著降低;炮制后蛋白質(zhì)、肽類的脫酰胺修飾數(shù)量顯著增加;炮制后I型、II型角蛋白的鑒定肽段數(shù)量顯著增加,Asn與Gln發(fā)生脫酰胺修飾的數(shù)量顯著增加;穿山甲炮制前后鑒定肽段的相對(duì)分子質(zhì)量分布及親疏水性無(wú)顯著變化。結(jié)論盡管炮制會(huì)降低穿山甲整體蛋白質(zhì)鑒定的數(shù)量,但可顯著增加角蛋白的鑒定肽段數(shù)量,可顯著提高蛋白質(zhì)、肽類成分的脫酰胺修飾數(shù)量。結(jié)果提示炮制過(guò)程有利于角蛋白等結(jié)構(gòu)蛋白的蛋白質(zhì)、肽類成分的溶出與釋放。為穿山甲物質(zhì)基礎(chǔ)研究,炮制對(duì)角質(zhì)類動(dòng)物藥物質(zhì)基礎(chǔ)的影響研究等提供依據(jù),也為穿山甲替代資源尋找與評(píng)價(jià)提供研究思路與方法。 

【文章來(lái)源】:中草藥. 2020,51(13)北大核心CSCD

【文章頁(yè)數(shù)】:8 頁(yè)

【部分圖文】:

基于“蛋白質(zhì)組-修飾組”研究砂炒炮制對(duì)穿山甲蛋白質(zhì)類成分的影響


穿山甲中鑒定的蛋白質(zhì)、肽段韋恩圖

流程圖,穿山甲,樣品,流程


穿山甲主要含有角質(zhì)類成分,提取方法參照前期研究[12],稍作改動(dòng)。提取流程如圖1所示,取穿山甲樣品(MS-1~MS-3)、炮山甲樣品(PMS-1~PMS-3)各10 mg,每個(gè)樣品加入1 mL提取液(含4%SDS,20 mmol/L DTT的Tris緩沖液),在65℃水浴孵育過(guò)夜,10 000 r/min離心10 min,取上清液為穿山甲提取液,沉淀部分重復(fù)上述提取步驟2次,將3次提取液合并,分別為穿山甲提取液(MSs-1~MSs-3)與炮山甲提取液(PMSs-1~PMSs-3),沉淀部分用PBS反復(fù)洗滌3次,分別為穿山甲渣(MSp-1~MSp-3)與炮山甲渣(PMSp-1~PMSp-3)。測(cè)定穿山甲提取液樣品(MSs-1~MSs-3、PMSs-1~PMSs-3)蛋白質(zhì)量濃度,每個(gè)樣品中取200μg蛋白質(zhì)總量的提取液,分別加入3倍體積的丙酮,至于-20℃靜置4 h后,10 000 r/min離心10min,棄去上清,用丙酮洗滌1次,揮干丙酮。加入200μL裂解液(含8 mol/L尿素的Tris緩沖液,pH 8)充分溶解蛋白后,加入pH 8的Tris緩沖液1 400μL稀釋,按質(zhì)量百分比加入1%胰蛋白酶,置于37℃水浴孵育過(guò)夜;穿山甲渣樣品(MSp-1~MSp-3、PMSp-1~PMSp-3)用pH 8的Tris緩沖液混懸,扣除提取液中蛋白質(zhì)總量后,按質(zhì)量百分比加入1%胰蛋白酶,置于37℃水浴孵育過(guò)夜。穿山甲提取液酶解樣品與穿山甲渣酶解樣品脫鹽,干燥,純水復(fù)溶后測(cè)定多肽總量,取20μg多肽溶液,再次干燥后用初始流動(dòng)相復(fù)溶至多肽質(zhì)量濃度為1μg/μL,待進(jìn)樣。

酰胺,蛋白,位點(diǎn)


以I型角蛋白炮制前后的變化為例說(shuō)明脫酰胺位點(diǎn)、肽段數(shù)量、PSM及肽段序列的差異。如圖3所示,紫色箭頭表示炮制后的I型角蛋白較炮制前新出現(xiàn)的脫酰胺修飾位點(diǎn),包括Gln75、Asn80、Asn101、Gln178、Gln203與Gln336。以胰蛋白酶酶切后形成的肽段GDLERQNQEYQVLLDVR為例,在炮制前的樣品中,僅測(cè)到GDLERQNQEYQVLLD VR與GDLERQNQEYQ(+0.98)VLLDVR 2條肽段;而炮制后的樣品中,測(cè)到了序列相同但是含有不同脫酰胺修飾的肽段共7個(gè),除了炮制前檢測(cè)到的肽段GDLERQNQEYQVLLDVR與GDLERQNQEYQ(+0.98)VLLDVR外,還包括GDLERQN(+0.98)QE YQVLLDVR、GDLERQ(+0.98)NQEYQVLLDVR、GDLERQ(+0.98)N(+0.98)QEYQVLLDVR、GDLER Q(+0.98)NQ(+0.98)EYQVLLDVR與GDLERQ(+0.98)NQEYQ(+0.98)VLLDVR,分別在Gln334、Asn335、Gln336及Gln339發(fā)生了不同組合的脫酰胺修飾。如圖3-C所示,比較MS/MS圖譜可以看出,根據(jù)b離子或y離子的偏差,可準(zhǔn)確計(jì)算出脫酰胺修飾的位點(diǎn),序列GDLERQNQEYQVLLDVR的b5+、b6+、b7+、b8+、b9+分別為571.29、699.34、813.39、941.44、1 070.49;而序列GDLERQ(+0.98)NQ(+0.98)EYQVLLDVR的b5+、b6+、b7+、b8+、b9+分別為571.29、700.33、814.37、943.41、1 072.46,兩者(b6+-b5+)值分別為128.05與129.04,表明肽段的6位Gln發(fā)生了修飾,兩者(b7+-b6+)值相同,表明7位Asn未發(fā)生修飾,(b8+-b7+)值分別為128.05與129.04,則表明8位Gln也發(fā)生了修飾,從而明確脫酰胺修飾的位點(diǎn)。圖3結(jié)果表明炮制后角蛋白修飾數(shù)量顯著增加,相同氨基酸序列上發(fā)生不同位點(diǎn)修飾使得肽段鑒定數(shù)量也明顯增加。2.6 穿山甲肽段相對(duì)分子質(zhì)量與親疏水性分布的對(duì)比分析

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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本文編號(hào):3375801

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