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基于IPA平臺預(yù)測龜芍平顫方抗帕金森病的機(jī)制

發(fā)布時間:2021-08-21 06:09
  目的基于生物信息學(xué)分析平臺探討龜芍平顫方抗帕金森病的分子機(jī)制。方法從1994年4月~2019年12月的中英文數(shù)據(jù)庫(相關(guān)期刊論文、維普期刊全文數(shù)據(jù)庫、中國生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫、中華本草、PubMed、Web of Science、SciFinder Scholar)中獲得龜芍平顫方(龜甲、白芍、川芎、天麻)的化學(xué)成分,并于PubChem數(shù)據(jù)庫中查找該方每種有效成分的人源活性靶蛋白。檢索Gene數(shù)據(jù)庫,查找帕金森病相關(guān)人源基因。將上述靶蛋白與基因上傳至生物信息學(xué)分析平臺,分析兩者共同涉及的分子網(wǎng)絡(luò)與生物學(xué)通路。結(jié)果獲得龜芍平顫方人源活性靶蛋白323個(龜甲58個、白芍119個、川芎72個、天麻74個);獲取帕金森病相關(guān)人源基因392個。建立上述靶蛋白及基因共同作用的主要分子網(wǎng)絡(luò),并甄選出G-蛋白偶聯(lián)受體信號傳導(dǎo)通路等10條主要的生物學(xué)通路。結(jié)論龜芍平顫方可能通過調(diào)控G-蛋白偶聯(lián)受體信號傳導(dǎo)通路等發(fā)揮抗帕金森病作用。 

【文章來源】:中國醫(yī)藥導(dǎo)報. 2020,17(16)

【文章頁數(shù)】:5 頁

【部分圖文】:

基于IPA平臺預(yù)測龜芍平顫方抗帕金森病的機(jī)制


帕金森病相關(guān)基因參與的主要生物學(xué)通路

疾病,蛋白,類型,分子


獲得GPF人類活性靶蛋白323個(龜甲58個、白芍119個、川芎72個、天麻74個),錄入其相應(yīng)的GI號,上傳至IPA平臺后,得到對應(yīng)的疾病與生物功能,主要集中在細(xì)胞凋亡與存活、機(jī)體損傷與異常等方面,圖1為前10位的疾病類型,表1為前5位的相關(guān)分子網(wǎng)及生物功能。GPF靶蛋白相關(guān)分子網(wǎng)絡(luò)共23個,運(yùn)用IPA構(gòu)建分子網(wǎng)絡(luò)(圖2)。2.2 PD相關(guān)基因生物功能與分子網(wǎng)絡(luò)

網(wǎng)絡(luò)圖,網(wǎng)絡(luò)圖,蛋白,分子


藥理學(xué)研究也證實了GPF所含藥物的抗PD作用。龜甲提取物活性部位可減輕神經(jīng)損傷癥狀,在神經(jīng)細(xì)胞缺血損傷后,可使神經(jīng)干細(xì)胞增殖,并向多種細(xì)胞系分化[16];有研究表明,龜甲提取物可能通過調(diào)控Otx2基因促進(jìn)神經(jīng)干細(xì)胞向多巴胺神經(jīng)元分化[17]。芍藥苷對紋狀體及黑質(zhì)多巴胺能神經(jīng)元具有明顯保護(hù)作用,能夠明顯改善6-羥基多巴胺誘導(dǎo)的PD大鼠神經(jīng)損傷[18]。天麻水煎液能顯著上調(diào)PD小鼠5-羥色胺受體、神經(jīng)肽Y受體、N-甲基-D-天門冬氨酸離子能谷氨酸受體2A和2B及多巴胺受體D3的表達(dá)[19]。有動物實驗表明,天麻素可以減慢多巴胺神經(jīng)元的代謝速度,進(jìn)而減少多巴胺的自身氧化,使多巴胺含量升高,并能保護(hù)多巴胺能神經(jīng)元[20]。川芎嗪可以減少PD大鼠的氧化應(yīng)激損傷,改善紋狀體細(xì)胞外液多巴胺代謝率,穩(wěn)定腦組織內(nèi)多巴胺濃度[21];同時川芎對PD小鼠也有神經(jīng)保護(hù)作用[22];贗PA平臺的分析,預(yù)測GPCRs信號傳導(dǎo)通路為GPF抗PD最可能的生物通路。GPCRs是一個超級膜蛋白家族,參與生物體內(nèi)大部分的信號調(diào)節(jié)和生理活動,其下游有多種信號通路,以環(huán)腺苷酸和磷脂酰肌醇為主要通路。多巴胺受體(DR)屬于GPCRs,DR家族共有5個成員,在中樞神經(jīng)系統(tǒng)以D1R和D2R分布最為廣泛。D1R和D2R可以通過G蛋白依賴的方式,通過cAMP/PKA信號通路、磷酯酶C信號通路和G蛋白門控內(nèi)向整流鉀離子通道信號通路介導(dǎo)腦內(nèi)多巴胺能信號轉(zhuǎn)導(dǎo),調(diào)控運(yùn)動、認(rèn)知等神經(jīng)功能,并參與PD等神經(jīng)退行性病的發(fā)生、發(fā)展[23]。GPCRs和PI3K AKT信號通路通過鳥苷三磷酸酶產(chǎn)生聯(lián)系,并可保護(hù)殘存的多巴胺能神經(jīng)元[24]。近來研究表明,小鼠GPCR6缺乏會顯著影響黑質(zhì)紋狀體多巴胺能系統(tǒng),同時在紋狀體多巴胺耗竭后產(chǎn)生激動劑激活DR[25]。GPF可能正是通過GPCRs等生物學(xué)通路發(fā)揮抗PD效應(yīng),但尚需進(jìn)一步的研究進(jìn)行驗證。

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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本文編號:3355035

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