發(fā)布時(shí)間：2021-07-11 00:11

　　目的:基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué),篩選柴胡疏肝散（CSS）化學(xué)成分和潛在作用靶點(diǎn),探究其治療急性胰腺炎（AP）可能的作用機(jī)制。方法:采用TCMSP數(shù)據(jù)庫(kù)檢索、篩選CSS中七味中藥柴胡、川芎、香附、白芍、枳殼、陳皮、甘草的主要活性成分及對(duì)應(yīng)蛋白靶標(biāo)。通過(guò)Drugbank和TTD數(shù)據(jù)庫(kù)收集已知調(diào)控AP的蛋白靶標(biāo),與成分對(duì)應(yīng)蛋白相對(duì)應(yīng),篩選出共有基因作為候選預(yù)測(cè)靶標(biāo)。采用String數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)預(yù)測(cè)靶標(biāo)進(jìn)行基因本體（GO）功能分析以及KEGG通路富集分析,Discovery studio 3.0軟件對(duì)候選活性成分與候選靶標(biāo)進(jìn)行虛擬對(duì)接。利用Cytoscape 3.7.2繪制"成分-靶標(biāo)"和"蛋白-通路"網(wǎng)絡(luò)圖。結(jié)果:通過(guò)口服利用度（OB）、類藥性（DL）、藥物半衰期（HL）篩選CSS全方成分,共得68個(gè)活性成分。網(wǎng)絡(luò)分析表明,CSS中的柴胡皂苷C、柴胡皂苷D、葉酸、柚皮苷、橙皮苷和甘草苷可能通過(guò)癌癥、PI3K-Akt、細(xì)胞凋亡、AGE-RAGE等信號(hào)通路來(lái)調(diào)控BCL2L1、PTGS2、MCL1、RAF1、IL-6、AKT1等25個(gè)靶點(diǎn)治療急性胰腺炎。結(jié)論:建立CSS-AP-靶點(diǎn)互作網(wǎng)絡(luò)來(lái)詮釋多成分-多靶點(diǎn)-... 

【文章來(lái)源】：陜西中醫(yī). 2020,41(07)

【文章頁(yè)數(shù)】：5 頁(yè)

【部分圖文】：

FDR前10名GO分析

通過(guò)TCMSP收集68個(gè)活性化合物對(duì)應(yīng)靶點(diǎn),去重得到249個(gè)蛋白靶標(biāo),與TTD數(shù)據(jù)庫(kù)和DrugBank數(shù)據(jù)庫(kù)去重所得354個(gè)蛋白靶標(biāo)進(jìn)行比對(duì)取交集,利用韋恩圖展示疾病靶點(diǎn)與成分靶點(diǎn)之間交集情況(圖1),紅色代表AP靶點(diǎn),綠色代表CSS靶點(diǎn),重疊部分為共同靶點(diǎn)。共得到25個(gè)交集靶點(diǎn),分別為PRKCA、PPARG、PTGS1、PTGS2、MAPK14、MAPK8、MAPK1、MAPK10、GSK3B、PTGES、MDM2、APP、CASP3、CASP7、IL6、ACHE、BCL2、BCL2L1、IKBKB、AKT1、CHEK2、HMOX1、VEGFA、MCL1、RAF1,用于后續(xù)網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析。3 GO與KEGG富集分析

將25個(gè)預(yù)測(cè)蛋白導(dǎo)入STRING數(shù)據(jù)庫(kù),物種選Homo sapiens,為提高準(zhǔn)確率,置信度設(shè)置為0.9,共包含25個(gè)節(jié)點(diǎn),46條邊的蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)圖(PPI)(圖2)。同時(shí),對(duì)預(yù)測(cè)蛋白進(jìn)行GO分析,選取FDR排名前10名的條目建立柱狀圖(圖3),藍(lán)色為生物過(guò)程,粉色為細(xì)胞組成,黃色為分子功能。對(duì)預(yù)測(cè)蛋白進(jìn)行KEGG通路分析并采用Cytoscape軟件展示FDR前20名的通路的蛋白富集情況(圖4),結(jié)果顯示,蛋白較多富集在癌癥信號(hào)通路、PI3K-Akt信號(hào)通路、細(xì)胞凋亡信號(hào)通路、AGE-RAGE信號(hào)通路和TNF信號(hào)通路等,說(shuō)明CSS的活性成分可通過(guò)這些通路來(lái)干預(yù)急性胰腺炎。圖3 FDR前10名GO分析

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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碩士論文
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本文編號(hào)：3276931