[目的]基于計算機輔助藥物設(shè)計（CADD）研究白術(shù)揮發(fā)油中的白術(shù)內(nèi)酯Ⅰ、白術(shù)內(nèi)酯Ⅱ、白術(shù)內(nèi)酯Ⅲ、蒼術(shù)酮、β-欖香烯、香橙烯和異香橙烯分子潛在作用靶點,并預(yù)測這7個分子的藥效。[方法]查閱文獻建立含有上述7個配體分子結(jié)構(gòu)的分子庫,使用Discovery Studio 2016（DS）軟件對分子庫的分子結(jié)構(gòu)進行優(yōu)化,運用DS中的反向找靶（Target Fishing）功能模塊對含有超過117000個藥效團模型的PharmaDB藥效團數(shù)據(jù)庫搜索;根據(jù)反向找靶的運行結(jié)果,篩選出配體與藥效團的契合值（Fit value）≥0.9且對應(yīng)打分最高的靶點蛋白。從PDB數(shù)據(jù)庫下載靶點蛋白,運用DS中的分子對接（Molecular Docking）技術(shù)查看篩選出的配體分子與對應(yīng)靶點蛋白的非鍵相互作用情況。[結(jié)果]反向找靶結(jié)果中篩選出6個靶點蛋白分別為酪蛋白激酶2、MDMX蛋白、維生素D3羥化酶、細胞周期蛋白A和細胞周期蛋白依賴性蛋白激酶2的復(fù)合物、CDC樣激酶3和酪蛋白激酶2α亞基。根據(jù)分子對接的結(jié)果并結(jié)合生物技術(shù)信息中心（National Center for Biotechnology Informa... 

【文章來源】：化工設(shè)計通訊. 2020,46(10)

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【部分圖文】：

白術(shù)揮發(fā)油的主要成分分子結(jié)構(gòu)式

(2)篩選出與配體分子的Fit value≥0.8的靶標藥效團,利用生物信息分析熱圖聚類分析軟件HemI 1.0做配體分子與對應(yīng)的各靶標藥效團的Fit value值的熱圖。橫坐標為各靶標藥效團模型,縱坐標為配體分子;圖中右側(cè)的標尺顏色為漸變色,從藍色至紅色逐漸過渡,表示Fit value值從“0.800”逐級遞增。Fit value值越大,表示小分子與靶標蛋白契合得越好,說明對應(yīng)的蛋白是小分子潛在作用的靶點的可能性高。熱圖結(jié)果如圖2所示。3.2 分子對接結(jié)果和藥效預(yù)測

(1)2OXX是蛋白激酶—酪蛋白激酶2或II(casein kinase,CK2)。CK2是高度多效性的絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶,在特定情況下能夠促進細胞存活并增強腫瘤表型[10]。CK2調(diào)控許多細胞功能,目前它是研究癌癥的目標。圖3～圖4分別為白術(shù)內(nèi)酯Ⅰ和白術(shù)內(nèi)酯Ⅱ與2OXX相互作用圖。圖4 白術(shù)內(nèi)酯Ⅱ與2OXX相互作用圖

【參考文獻】：
期刊論文
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博士論文
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碩士論文
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本文編號：3276244