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三七-白及藥對作用機制的網(wǎng)絡(luò)藥理學分析

發(fā)布時間:2021-06-07 15:01
  通過網(wǎng)絡(luò)藥理學的方法,研究三七-白及藥對在疾病治療過程中潛在的藥理作用機制.采用TCMSP數(shù)據(jù)庫篩選三七-白及藥對的活性成分和作用靶點,并用Uniprot數(shù)據(jù)庫校正靶點信息得到靶點基因,利用CTD數(shù)據(jù)庫獲得靶點基因相關(guān)的疾病類型,通過STRING數(shù)據(jù)庫構(gòu)建靶點蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò),分析得到核心蛋白,運用DAVID數(shù)據(jù)庫富集分析靶點基因參與的基因本體論(GO)生物學過程及京都基因與基因百科全書(KEGG)通路.共篩選得到17個活性成分,涉及193個作用靶點.結(jié)果表明:槲皮素、β-谷甾醇和豆甾醇的作用靶點數(shù)目最多;靶點基因與35類疾病相關(guān),主要包括癌癥、神經(jīng)系統(tǒng)疾病、心血管疾病等;蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)分析得到核心蛋白AKT1,MAPK1,c-Jun,P53,TNF等;靶點基因主要涉及藥物反應(yīng),RNA聚合酶Ⅱ啟動子轉(zhuǎn)錄的正調(diào)控等91條GO生物學過程,KEGG通路顯著富集到癌癥通路、乙型肝炎等66條通路,與前述疾病分析結(jié)果相符. 

【文章來源】:華僑大學學報(自然科學版). 2020,41(04)北大核心

【文章頁數(shù)】:9 頁

【部分圖文】:

三七-白及藥對作用機制的網(wǎng)絡(luò)藥理學分析


靶點基因與癌癥通路

關(guān)系圖,靶點,活性成分,藥物


篩選得到的17個活性成分中,三七活性成分MOL007475和白及活性成分MOL005776未檢索到相關(guān)作用靶點;15個活性成分共獲得193個靶點蛋白,三七活性成分靶點有184個,白及活性成分靶點有27個;2味藥物共同作用靶點有18個,分別為AR,DPP4,EGFR,ESR1,PRKACA,PPARG,KCNH2,PTGS1,PTGS2,RXRA,SCN5A,F2,PRSS1,NOS3,NCOA2,TOP2A,F7,PPARD.三七-白及藥對既有不同作用靶點,又有共同作用靶點,提示三七和白及在用藥過程中存在一定的協(xié)同或拮抗作用.將三七、白及2味藥物和15個活性成分及193個靶點蛋白導入Cytoscape軟件,得到藥物-活性成分-靶點網(wǎng)絡(luò)關(guān)系圖,如圖1所示.圖1中:網(wǎng)路共包含210個節(jié)點和336條邊;紅色六邊形分別代表三七和白及;粉色圓形代表三七的活性成分;橙色圓形代表白及的活性成分;綠色菱形代表作用靶點;連接線代表相互關(guān)系.經(jīng)Cytoscape軟件分析,槲皮素(quercetin)作用靶點有150個,數(shù)量最多,其次為β-谷甾醇(beta-sitosteroll)37個和豆甾醇(stigmasterol)31個.從作用靶點角度分析,PTGS2相互作用活性成分數(shù)目最多,有12個,PTGS1相互作用活性成份有9個,SCN5A有8個.結(jié)果表明:前述活性成分和靶點蛋白在三七-白及藥對疾病治療過程中發(fā)揮重要作用,活性成分與靶點蛋白間復(fù)雜的相互作用關(guān)系體現(xiàn)了中藥在應(yīng)用中“多組分-多靶點”綜合調(diào)節(jié)的特點.

相互作用,蛋白,疾病,基因


表2 前10類靶點基因相關(guān)疾病的富集Tab.2 Enrichment of target gene related diseases (top 10) 序號 疾病類型 疾病種類 基因數(shù) 基因 1 Cancer 124 139 ABCG2,ACACA,ACHE,ADCYAP1,ADH1C,ADRA1A,ADRB1,ADRB2,AHR,AKR1B1,AKT1,ALOX5,AR,BAX,BCL2,BCL2L1,BIRC5,CASP8,CASP9,CAV1 2 Nervous systemdisease 83 116 ABCG2,ACHE,ADCYAP1,ADH1C,ADRA1B,ADRA2A,ADRB2,AHR,AKT1,ALOX5,AR,BAX,BCL2,BCL2L1,CALM1,CASP1,CASP3,CASP8,CASP9,CAV1 3 Cardiovascular disease 70 120 ACACA,ADCYAP1,ADRA1B,ADRA2A,ADRB1,ADRB2,AHR,AKT1,ALOX5,AR,BAX,BCL2,BCL2L1,CALM1,CASP1,CASP3,CASP8,CASP9,CAV1,CCL2 4 Digestive systemdisease 59 128 ABCG2,ACACA,ACHE,ADCYAP1,ADRA1A,ADRA1B,ADRB1,ADRB2,AHR,AKR1B1,AKT1,ALOX5,AR,BAX,BCL2,BCL2L1,BIRC5,CASP1,CASP3,CASP8 5 Urogenital disease(female) 50 119 ACHE,ADCYAP1,ADRA1B,AHR,AKR1B1,AKT1,ALOX5,AR,BAX,BCL2,BIRC5,CASP1,CASP8,CAV1,CCL2,CCNB1,CCND1,CDKN1A,CDKN2A,CHRM2 6 Pathology (process) 43 116 ABCG2,ACHE,ADH1C,ADRA1B,ADRA2A,ADRB1,ADRB2,AHR,AKT1,ALOX5,AR,BAX,BCL2,BCL2L1,CALM1,CASP1,CASP3,CASP8,CASP9,CAV1 7 Urogenital disease(male) 41 111 ACHE,ADCYAP1,ADRA1B,ADRB2,AHR,AKT1,ALOX5,AR,BAX,BCL2,BCL2L1,BIRC5,CASP1,CASP3,CASP8,CASP9,CAV1,CCL2,CCND1,CDKN1A 8 Immune systemdisease 40 91 ABCG2,ACPP,ADRB2,AHR,AKT1,ALOX5,BAX,BCL2,BCL2L1,BIRC5,CASP1,CASP8,CAV1,CCL2,CCND1,CD40LG,CDKN1A,CDKN2A,CHEK2,CHRM2 9 Signs and symptoms 38 96 ACHE,ADCYAP1,ADRA1B,ADRB1,ADRB2,AHR,AKT1,ALOX5,BCL2,BCL2L1,CALM1,CASP1,CASP3,CASP8,CASP9,CAV1,CCL2,CCNA2,CHRM1,CHRM2 10 Metabolic disease 35 93 ABCG2,ACACA,ACHE,ADRA1A,ADRB1,ADRB2,AHR,AKT1,AR,BAX,BCL2,BCL2L1,CASP1,CASP3,CASP8,CAV1,CCL2,CD40LG,CHEK2,CHRM2 注: 每個疾病分類僅列出前 20 位的基因.2.4 蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建與核心蛋白獲取

【參考文獻】:
期刊論文
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本文編號:3216800

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