目的:運用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究方法探討神術(shù)散治療新型冠狀病毒肺炎的作用機(jī)制。方法:通過中藥系統(tǒng)藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫（TCMSP）對神術(shù)散所包含的中藥進(jìn)行可能的活性成分和靶點預(yù)測,通過Cytoscape 3.7.2建立藥物-成分-靶點作用網(wǎng)絡(luò),并使用STRING網(wǎng)站進(jìn)行靶點蛋白互作分析、運用Cytoscape 3.7.2進(jìn)行可視化;利用DAVID數(shù)據(jù)庫進(jìn)行基因本體（GO）分析和京都基因與基因組百科全書（KEGG）通路富集分析。結(jié)果:篩選出36個神術(shù)散的有效成分和125個預(yù)測靶點。富集分析共得到生物學(xué)進(jìn)程23個,細(xì)胞學(xué)組分8個,分子功能9個,11條KEGG通路。結(jié)果顯示神術(shù)散作用于新型冠狀病毒肺炎的機(jī)制中,其主要為癌癥相關(guān)通路、PI3K-Akt信號通路、鈣離子信號通路、TNF信號通路和HIF-1信號通路。結(jié)論:神術(shù)散治療新型冠狀病毒肺炎可能存在多通路、多靶點,這為進(jìn)一步深入揭示其作用機(jī)制提供了參考,也為新型冠狀病毒肺炎的治療提供了生物信息學(xué)基礎(chǔ)。 

【文章來源】：中藥材. 2020,43(04)北大核心

【文章頁數(shù)】：6 頁

【部分圖文】：

神術(shù)散藥物-成分-靶點網(wǎng)絡(luò)圖

將125個預(yù)測靶點導(dǎo)入 STRING 數(shù)據(jù)庫，構(gòu)建蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用關(guān)系(Protein-Protein Interaction, PPI)網(wǎng)絡(luò)圖，以此來尋找靶點和靶點間直接及間接作用關(guān)系。根據(jù)自由度(degree值)的大小篩選核心靶點，degree值越大，參與的生物功能越多。如圖2所示，最左側(cè)圖片為原始PPI網(wǎng)絡(luò)圖，包含125個節(jié)點，14 520條邊，其中最小自由度1,最大自由度60,平均自由度19。拓?fù)浞治龊蠛Y選的關(guān)鍵靶點為：IL6、JUN、TP53、MAPK1、VEGFA、EGF、TNF、EGFR、ESR1、MAPK8、NOS3、PTGS2等。2.4 GO功能富集分析與KEGG分析

將神術(shù)散所預(yù)測的125個靶點導(dǎo)入DAVID 6.8數(shù)據(jù)庫，進(jìn)行基因本體論GO分析和KEGG分析，選擇物種為人，篩選條件為Count≥4,P≤0.01,FDR(False Discovery Rate)≤0.01,得到生物學(xué)進(jìn)程(biological process, BP)23個(圖3);主要涉及了細(xì)胞增殖、一氧化氮生物合成、血管收縮的正向調(diào)節(jié)、血管生成、積極調(diào)節(jié)發(fā)熱生成、脂多糖介導(dǎo)的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑、平滑肌細(xì)胞增殖的正向調(diào)節(jié)、基因表達(dá)的負(fù)調(diào)控、RNA轉(zhuǎn)錄等多個生物學(xué)進(jìn)程，多個生物學(xué)進(jìn)程涉及了IL6、CDK4、EGFR、CCL2、IL1B、MAPK1、VEGFA等靶點。GO分析共得到細(xì)胞學(xué)組分(cellular component, CC)8個，分子功能(molecular function, MF)9個(圖4),包括蛋白質(zhì)的結(jié)合、藥物結(jié)合、蛋白質(zhì)二聚體活性、類固醇激素受體活性、細(xì)胞外配體-門離子通道活性、絲氨酸型內(nèi)肽酶活性、RNA聚合酶Ⅱ轉(zhuǎn)錄因子活性等；并獲取KEGG通路11條(圖5)。得到神術(shù)散治療新型冠狀病毒肺炎的主要信號通路為PI3K-Akt信號通路、鈣離子信號通路、TNF信號通路和HIF-1信號通路、癌癥相關(guān)通路。圖4 神術(shù)散治療COVID-19的分子功能

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]“新型冠狀病毒肺炎（COVID-19）”特稿新型冠狀病毒肺炎（COVID-19）臨床影像學(xué)特征[J]. 管漢雄,熊穎,申楠茜,樊艷青,邵劍波,李宏軍,李小明,胡道予,朱文珍,金征宇.  放射學(xué)實踐. 2020(02)
[2]重癥甲型流感肺炎患兒血清細(xì)胞因子的檢測及其臨床意義[J]. 馮碧紅,楊子浩.  心電與循環(huán). 2019(02)
[3]淫羊藿治療股骨頭壞死的分子機(jī)制分析[J]. 梁學(xué)振,許波,李剛,駱帝,蓋帥帥,閻博昭,李嘉程,夏聰敏.  中國實驗方劑學(xué)雜志. 2018(14)
[4]慢性阻塞性肺疾病患者肺組織中缺氧誘導(dǎo)因子1α的表達(dá)變化[J]. 魏文婷,李冰,賈曄然,陳淼,張紅璇.  中國病理生理雜志. 2013(09)
[5]病毒感染性肺炎危重患兒血漿IL-1,IL-6,IL-8的變化及臨床意義[J]. 盧秀蘭,肖政輝,祝益民,方亦兵,趙蕊.  醫(yī)學(xué)臨床研究. 2003(12)

碩士論文
[1]HIF-1、VEGF在慢性阻塞性肺疾病中的表達(dá)及臨床意義[D]. 汪迎.南昌大學(xué) 2019



本文編號：3117847