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雞血藤及其混偽品的DNA條形碼分子鑒定研究

發(fā)布時間:2021-03-17 13:37
  目的采用分子生物學(xué)鑒定技術(shù),篩選合適的DNA條形碼序列,建立快速、準(zhǔn)確鑒定雞血藤的方法。方法采集72份雞血藤及其混偽品的樣本,分別提取樣品DNA,對ITS2、matK、psbA-trnH、ITS和rbcL序列擴(kuò)增、測序;計算各序列擴(kuò)增成功率和測序成功率,利用MEGA7.0分析比對序列特征;基于Kimura-2-Parameter(K2P)雙參數(shù)模型計算種內(nèi)、種間的遺傳距離評估Barcoding gap;利用Phylosuite軟件構(gòu)建ITS2、matK和psbA-trnH和多基因(I-M-P)聯(lián)合系統(tǒng)發(fā)育樹。結(jié)果 ITS2的擴(kuò)增成功率和測序成功率最高,均為100%,matK和psbA-trnH的測序成功率亦有94.4%、91.7%,而rbcL和ITS僅為69.4%和61.1%;ITS2較其他條形碼序列具有明顯的Barcoding gap,且種內(nèi)、種間重疊少;系統(tǒng)發(fā)育樹顯示,ITS2和psbA-trnH可將雞血藤及其混偽品明顯聚為不同分支,matK不能把滇雞血藤和南五味子分開;I-M-P系統(tǒng)發(fā)育樹同ITS2和psbA-trnH結(jié)果相同。結(jié)論以ITS2為主、psbA-trnH序列為輔的鑒定... 

【文章來源】:中草藥. 2020,51(12)北大核心

【文章頁數(shù)】:10 頁

【部分圖文】:

雞血藤及其混偽品的DNA條形碼分子鑒定研究


擴(kuò)增成功率和測序成功率

雞血藤及其混偽品的DNA條形碼分子鑒定研究


ITS2(A)、matK(B)和psbA(C)的遺傳距離分布

雞血藤及其混偽品的DNA條形碼分子鑒定研究


多基因聯(lián)合(I-M-P)貝葉斯系統(tǒng)發(fā)育樹

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]雞血藤、滇雞血藤、大血藤等血藤類藥材的psbA-trnH條形碼分子鑒定[J]. 周紅,馬雙姣,陳貝貝,韓正洲,姚輝.  世界科學(xué)技術(shù)-中醫(yī)藥現(xiàn)代化. 2016(01)
[2]中藥材DNA條形碼分子鑒定指導(dǎo)原則[J]. 陳士林,姚輝,韓建萍,辛天怡,龐曉慧,石林春,羅焜,宋經(jīng)元,侯典云,石上梅,錢忠直.  中國中藥雜志. 2013(02)
[3]雞血藤與其常見混淆品的薄層色譜鑒別研究[J]. 翟明,劉軍民.  廣州中醫(yī)藥大學(xué)學(xué)報. 2012(03)
[4]雞血藤的品種與考證[J]. 鄭立雄,丁艷芬,楊崇仁.  中國現(xiàn)代中藥. 2012(02)
[5]雞血藤化學(xué)成分及藥理作用研究進(jìn)展[J]. 符影,程悅,陳建萍,王冬梅.  中草藥. 2011(06)
[6]雞血藤的性狀鑒定[J]. 陳道峰,徐國鈞,徐珞珊,金蓉鸞.  中藥材. 1993(08)



本文編號:3087224

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