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青黛作用于急性幼粒細(xì)胞白血病的可視化“藥靶蛋白模型”分析

發(fā)布時(shí)間:2021-01-19 05:17
  目的:目前青黛已是治療急性幼粒細(xì)胞白血病(APL)的臨床有效藥物,但其分子機(jī)制與物質(zhì)基礎(chǔ)仍不明確�;诖吮狙芯繕�(gòu)建青黛與APL可視化藥靶蛋白模型,以探究青黛作用于APL的分子機(jī)制。方法:通過GEO數(shù)據(jù)庫檢索APL微陣列芯片分析APL差異表達(dá)基因,使用TCMSP數(shù)據(jù)庫篩選青黛活性成分,結(jié)合PubChem和SwissTargetPrediction匹配活性成分的靶基因并進(jìn)行富集分析。String用于挖掘并構(gòu)建APL可視化蛋白互作數(shù)據(jù),將其讀入Cytoscape,通過Centiscape實(shí)現(xiàn)網(wǎng)絡(luò)拓?fù)浞治�。綜合APL差異表達(dá)基因,通過Sybyl與青黛活性成分構(gòu)建藥靶蛋白模型。結(jié)果:篩選出3張APL微陣列芯片,164個(gè)差異表達(dá)基因,9種青黛活性成分,541個(gè)靶基因,這些靶點(diǎn)較多地參與細(xì)胞凋亡、藥物結(jié)合、癌癥途徑、慢性粒細(xì)胞白血病等,這些都在APL中起重要作用。拓?fù)浞治鲲@示ELANE,CTSS為核心基因,將其與青黛9種活性成分進(jìn)行藥靶蛋白模型預(yù)測,顯示靛玉紅和靛藍(lán)與核心基因結(jié)合度最佳。結(jié)論:APL是受多基因調(diào)控的復(fù)雜疾病,而青黛成分中靛玉紅和靛藍(lán)可通過結(jié)合ELANE,CTSS作用于APL的發(fā)生發(fā)展... 

【文章來源】:世界中醫(yī)藥. 2020,15(12)

【文章頁數(shù)】:8 頁

【部分圖文】:

青黛作用于急性幼粒細(xì)胞白血病的可視化“藥靶蛋白模型”分析


對(duì)青黛作用靶基因進(jìn)行GO富集分析

蛋白,活性成分,相互作用,屬性分析


通過將2個(gè)核心基因ELANE、CTSS與青黛9種活性成分構(gòu)建藥靶蛋白模擬發(fā)現(xiàn),青黛的活性成分靛玉紅、靛藍(lán)與ELANE,CTSS結(jié)合度較高,提示靛玉紅、靛藍(lán)干預(yù)ELANE,CTSS可能在青黛治療APL中起重要作用。見圖5。圖4 APL網(wǎng)絡(luò)拓?fù)鋵傩苑治?

網(wǎng)絡(luò)拓?fù)鋱D,屬性分析,網(wǎng)絡(luò)拓?fù)?蛋白


APL網(wǎng)絡(luò)拓?fù)鋵傩苑治?br>
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基于“蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)-分子對(duì)接技術(shù)-體外實(shí)驗(yàn)”三維模式分析青黛對(duì)慢性粒細(xì)胞白血病的作用機(jī)制[J]. 劉存,劉麗娟,周超,莊靜,劉宏,孫長崗.  中國實(shí)驗(yàn)方劑學(xué)雜志. 2017(21)
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[3]靛藍(lán)對(duì)潰瘍性結(jié)腸炎體外炎癥模型的作用[J]. 劉麗娟,王允亮,李軍祥.  中華中醫(yī)藥雜志. 2014(05)
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[5]周靄祥運(yùn)用青黃散治療白血病的經(jīng)驗(yàn)[J]. 胡曉梅,劉鋒,麻柔,鄧成珊.  中醫(yī)雜志. 2011(14)
[6]急性早幼粒細(xì)胞白血病發(fā)病機(jī)制及治療進(jìn)展[J]. 鐘少東,蔡曉燕.  安徽醫(yī)藥. 2011(03)
[7]復(fù)方黃黛片治療急性早幼粒細(xì)胞白血病204例經(jīng)驗(yàn)總結(jié)[J]. 孫鋒,陳楠楠,成玉斌.  中西醫(yī)結(jié)合學(xué)報(bào). 2008(06)
[8]靛玉紅對(duì)腫瘤細(xì)胞抑制作用的研究及相關(guān)機(jī)制探討[J]. 吳琦瑋,葛忠良,高月,張麗.  天津中醫(yī)藥. 2008(01)
[9]我國急性白血病的診斷治療現(xiàn)狀[J]. 秘營昌,王建祥.  國際輸血及血液學(xué)雜志. 2006(04)
[10]小劑量HA方案聯(lián)合ATRA、復(fù)方青黛片治療急性早幼粒細(xì)胞白血病30例臨床觀察[J]. 楊俊超,李麗,王建英,張瑞英,于艷芳.  現(xiàn)代中西醫(yī)結(jié)合雜志. 2004(19)

碩士論文
[1]中藥系統(tǒng)藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫和分析平臺(tái)的構(gòu)建和應(yīng)用[D]. 汝錦龍.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2015



本文編號(hào):2986409

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