基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和分子對(duì)接技術(shù)的藏藥三味龍膽花片用于新型冠狀病毒肺炎(COVID-19)的作用機(jī)制探討
發(fā)布時(shí)間:2021-01-01 22:45
目的:初步探尋藏藥三味龍膽花片治療新型冠狀病毒肺炎(COVID-19)的活性化合物及作用機(jī)制。方法:通過文獻(xiàn)及中藥系統(tǒng)藥理學(xué)分析平臺(tái)(TCMSP)檢索藏藥三味龍膽花片中白花龍膽、甘草、蜂蜜干膏的化學(xué)成分。通過Swiss Target Prediction數(shù)據(jù)庫查詢化學(xué)成分對(duì)應(yīng)靶點(diǎn),采用Cytoscape3.7.2構(gòu)建化合物-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò);結(jié)合DAVID基因本體GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,預(yù)測(cè)其作用機(jī)制;對(duì)核心成分與抗COVID-19藥物靶點(diǎn)進(jìn)行分子對(duì)接驗(yàn)證。結(jié)果:化合物-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)包含101個(gè)化合物,共對(duì)應(yīng)168個(gè)靶點(diǎn)。GO功能富集分析得到GO條目291個(gè)(P<0.05),其中生物過程(BP)條目186個(gè),細(xì)胞組成(CC)條目33個(gè),分子功能(MF)條目72個(gè)。KEGG通路富集篩選得到56條信號(hào)通路(P<0.05),涉及鈣離子信號(hào)通路、花生四烯酸代謝通路、MAPK信號(hào)通路等相關(guān)信號(hào)通路。分子對(duì)接結(jié)果顯示,甘草香豆酮、槲皮素、山柰酚等核心成分與抗COVID-19藥物潛在作用靶點(diǎn)的親和力可能較推薦用藥更強(qiáng)。結(jié)論:藏藥三味龍膽花片可通過多成分、多靶點(diǎn)、多通路的協(xié)同作用發(fā)揮療...
【文章來源】:中藥藥理與臨床. 2020年03期 北大核心
【文章頁數(shù)】:7 頁
【部分圖文】:
“三味龍膽花片藥物-化合物-靶點(diǎn)”網(wǎng)絡(luò)圖
將2.2中得到的168 個(gè)靶標(biāo)蛋白導(dǎo)入STRING 11.0數(shù)據(jù)庫中進(jìn)行分析,得到蛋白-蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)圖(見圖2)。其中節(jié)點(diǎn)代表靶標(biāo)蛋白,邊代表蛋白之間的相互作用關(guān)系,圖中含有168 個(gè)靶蛋白和889 條互作邊,導(dǎo)入cytoscape3.7.2 軟件分析得到degree值排名前5的靶點(diǎn)為MAPK3、EGFR、CASP3、STAT3、ESR1。2.4 靶點(diǎn)通路分析
GO功能富集分析得到GO條目291 個(gè)(P<0.05),其中生物過程(BP)條目186 個(gè),細(xì)胞組成(CC)條目33 個(gè),分子功能(MF)條目72 個(gè),根據(jù)保留P<0.05的結(jié)果,并分別對(duì)前10 個(gè)條目進(jìn)行可視化分析,見圖3。由圖3可知,涉及的主要生物過程富集條目為凋亡過程的負(fù)調(diào)控(negative regulation of apoptotic process)、蛋白質(zhì)磷酸化(protein phosphorylation)、炎癥反應(yīng)(inflammatory response)等;涉及的主要細(xì)胞組成為質(zhì)膜(plasma membrane)、細(xì)胞外泌體(extracellular exosome)、核質(zhì)(nucleoplasm)等;涉及的主要分子功能為類固醇激素受體活性(steroid hormone receptor activity)、蛋白激酶活性(protein kinase activity)、轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合(transcription factor binding)等。KEGG通路富集篩選得到56 條信號(hào)通路(P<0.05),對(duì)前20條通路進(jìn)行分析,其中涉及的主要信號(hào)通路有鈣離子信號(hào)通路、花生四烯酸代謝通路、MAPK信號(hào)通路、TRP通道、腎素血管緊張素系統(tǒng)等,見圖4。圖3 三味龍膽花片靶標(biāo)的GO功能富集分析
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]民族醫(yī)藥對(duì)新型冠狀病毒肺炎的認(rèn)識(shí)及防治措施[J]. 張吉仲,降擁彭措(噶布),納順達(dá)來,庫爾班·艾力,李鳳珍,王孝蓉,梅花·尼合買提,張之道,田華詠,祚穆-喏姿搟佈(楊福壽),單于德,李文兵,劉圓. 中草藥. 2020(06)
[2]抗新型冠狀病毒肺炎藥物靶點(diǎn)的研究進(jìn)展[J]. 鄧衛(wèi)寧,王利娜,崔艷麗. 現(xiàn)代藥物與臨床. 2020(03)
[3]抗新型冠狀病毒方劑基于花生四烯酸代謝通路防治“細(xì)胞因子風(fēng)暴”的研究[J]. 任越,姚美村,霍曉乾,谷宇,朱衛(wèi)星,喬延江,張燕玲. 中國(guó)中藥雜志. 2020(06)
[4]融合“成分-靶點(diǎn)-共有通路”網(wǎng)絡(luò)和分子對(duì)接技術(shù)的清肺口服液抗新型冠狀病毒肺炎的活性成分初探[J]. 姚衛(wèi)峰,翟園園,林麗麗,楊斌,莊莉,張麗,謝彤,趙霞,單進(jìn)軍,汪受傳. 南京中醫(yī)藥大學(xué)學(xué)報(bào). 2020(02)
[5]氨溴索治療2019新型冠狀病毒肺炎的研究現(xiàn)狀[J]. 李敏,王進(jìn). 中國(guó)臨床藥理學(xué)雜志. 2020(09)
[6]中西醫(yī)結(jié)合治療新型冠狀病毒肺炎的應(yīng)用分析[J]. 韓園園,趙夢(mèng)冉,石垚,宋兆輝,周水平,何毅. 中草藥. 2020(04)
[7]基于腎素-血管緊張素系統(tǒng)評(píng)析新冠病毒致多臟器損傷作用及中藥干預(yù)作用[J]. 張巖,唐德志,舒冰,李文雄,張佳莉,李鉞,赫明超,沙南南,施杞,王擁軍. 世界科學(xué)技術(shù)-中醫(yī)藥現(xiàn)代化. 2020(02)
[8]三味龍膽花片對(duì)克雷伯菌急性肺炎大鼠中NF-κB信號(hào)通路的影響[J]. 李彥橋,黃婉奕,高玥,趙學(xué)勇,古銳,曾勇,張靜波,江勇. 中藥新藥與臨床藥理. 2018(06)
[9]槲皮素藥理作用研究進(jìn)展[J]. 馬納,李亞靜,范吉平. 遼寧中醫(yī)藥大學(xué)學(xué)報(bào). 2018(08)
[10]淺談藏醫(yī)對(duì)疫病的認(rèn)識(shí)、預(yù)防及治療[J]. 俄措卓瑪. 西藏科技. 2016(09)
博士論文
[1]臭靈丹黃酮及倍半萜類化合物抗流感藥效研究[D]. 何家揚(yáng).廣州中醫(yī)藥大學(xué) 2018
本文編號(hào):2952128
【文章來源】:中藥藥理與臨床. 2020年03期 北大核心
【文章頁數(shù)】:7 頁
【部分圖文】:
“三味龍膽花片藥物-化合物-靶點(diǎn)”網(wǎng)絡(luò)圖
將2.2中得到的168 個(gè)靶標(biāo)蛋白導(dǎo)入STRING 11.0數(shù)據(jù)庫中進(jìn)行分析,得到蛋白-蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)圖(見圖2)。其中節(jié)點(diǎn)代表靶標(biāo)蛋白,邊代表蛋白之間的相互作用關(guān)系,圖中含有168 個(gè)靶蛋白和889 條互作邊,導(dǎo)入cytoscape3.7.2 軟件分析得到degree值排名前5的靶點(diǎn)為MAPK3、EGFR、CASP3、STAT3、ESR1。2.4 靶點(diǎn)通路分析
GO功能富集分析得到GO條目291 個(gè)(P<0.05),其中生物過程(BP)條目186 個(gè),細(xì)胞組成(CC)條目33 個(gè),分子功能(MF)條目72 個(gè),根據(jù)保留P<0.05的結(jié)果,并分別對(duì)前10 個(gè)條目進(jìn)行可視化分析,見圖3。由圖3可知,涉及的主要生物過程富集條目為凋亡過程的負(fù)調(diào)控(negative regulation of apoptotic process)、蛋白質(zhì)磷酸化(protein phosphorylation)、炎癥反應(yīng)(inflammatory response)等;涉及的主要細(xì)胞組成為質(zhì)膜(plasma membrane)、細(xì)胞外泌體(extracellular exosome)、核質(zhì)(nucleoplasm)等;涉及的主要分子功能為類固醇激素受體活性(steroid hormone receptor activity)、蛋白激酶活性(protein kinase activity)、轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合(transcription factor binding)等。KEGG通路富集篩選得到56 條信號(hào)通路(P<0.05),對(duì)前20條通路進(jìn)行分析,其中涉及的主要信號(hào)通路有鈣離子信號(hào)通路、花生四烯酸代謝通路、MAPK信號(hào)通路、TRP通道、腎素血管緊張素系統(tǒng)等,見圖4。圖3 三味龍膽花片靶標(biāo)的GO功能富集分析
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]民族醫(yī)藥對(duì)新型冠狀病毒肺炎的認(rèn)識(shí)及防治措施[J]. 張吉仲,降擁彭措(噶布),納順達(dá)來,庫爾班·艾力,李鳳珍,王孝蓉,梅花·尼合買提,張之道,田華詠,祚穆-喏姿搟佈(楊福壽),單于德,李文兵,劉圓. 中草藥. 2020(06)
[2]抗新型冠狀病毒肺炎藥物靶點(diǎn)的研究進(jìn)展[J]. 鄧衛(wèi)寧,王利娜,崔艷麗. 現(xiàn)代藥物與臨床. 2020(03)
[3]抗新型冠狀病毒方劑基于花生四烯酸代謝通路防治“細(xì)胞因子風(fēng)暴”的研究[J]. 任越,姚美村,霍曉乾,谷宇,朱衛(wèi)星,喬延江,張燕玲. 中國(guó)中藥雜志. 2020(06)
[4]融合“成分-靶點(diǎn)-共有通路”網(wǎng)絡(luò)和分子對(duì)接技術(shù)的清肺口服液抗新型冠狀病毒肺炎的活性成分初探[J]. 姚衛(wèi)峰,翟園園,林麗麗,楊斌,莊莉,張麗,謝彤,趙霞,單進(jìn)軍,汪受傳. 南京中醫(yī)藥大學(xué)學(xué)報(bào). 2020(02)
[5]氨溴索治療2019新型冠狀病毒肺炎的研究現(xiàn)狀[J]. 李敏,王進(jìn). 中國(guó)臨床藥理學(xué)雜志. 2020(09)
[6]中西醫(yī)結(jié)合治療新型冠狀病毒肺炎的應(yīng)用分析[J]. 韓園園,趙夢(mèng)冉,石垚,宋兆輝,周水平,何毅. 中草藥. 2020(04)
[7]基于腎素-血管緊張素系統(tǒng)評(píng)析新冠病毒致多臟器損傷作用及中藥干預(yù)作用[J]. 張巖,唐德志,舒冰,李文雄,張佳莉,李鉞,赫明超,沙南南,施杞,王擁軍. 世界科學(xué)技術(shù)-中醫(yī)藥現(xiàn)代化. 2020(02)
[8]三味龍膽花片對(duì)克雷伯菌急性肺炎大鼠中NF-κB信號(hào)通路的影響[J]. 李彥橋,黃婉奕,高玥,趙學(xué)勇,古銳,曾勇,張靜波,江勇. 中藥新藥與臨床藥理. 2018(06)
[9]槲皮素藥理作用研究進(jìn)展[J]. 馬納,李亞靜,范吉平. 遼寧中醫(yī)藥大學(xué)學(xué)報(bào). 2018(08)
[10]淺談藏醫(yī)對(duì)疫病的認(rèn)識(shí)、預(yù)防及治療[J]. 俄措卓瑪. 西藏科技. 2016(09)
博士論文
[1]臭靈丹黃酮及倍半萜類化合物抗流感藥效研究[D]. 何家揚(yáng).廣州中醫(yī)藥大學(xué) 2018
本文編號(hào):2952128
本文鏈接:http://sikaile.net/yixuelunwen/zhongyaolw/2952128.html
最近更新
教材專著