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基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和分子對(duì)接技術(shù)的藏藥三味龍膽花片用于新型冠狀病毒肺炎(COVID-19)的作用機(jī)制探討

發(fā)布時(shí)間:2021-01-01 22:45
  目的:初步探尋藏藥三味龍膽花片治療新型冠狀病毒肺炎(COVID-19)的活性化合物及作用機(jī)制。方法:通過文獻(xiàn)及中藥系統(tǒng)藥理學(xué)分析平臺(tái)(TCMSP)檢索藏藥三味龍膽花片中白花龍膽、甘草、蜂蜜干膏的化學(xué)成分。通過Swiss Target Prediction數(shù)據(jù)庫查詢化學(xué)成分對(duì)應(yīng)靶點(diǎn),采用Cytoscape3.7.2構(gòu)建化合物-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò);結(jié)合DAVID基因本體GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,預(yù)測(cè)其作用機(jī)制;對(duì)核心成分與抗COVID-19藥物靶點(diǎn)進(jìn)行分子對(duì)接驗(yàn)證。結(jié)果:化合物-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)包含101個(gè)化合物,共對(duì)應(yīng)168個(gè)靶點(diǎn)。GO功能富集分析得到GO條目291個(gè)(P<0.05),其中生物過程(BP)條目186個(gè),細(xì)胞組成(CC)條目33個(gè),分子功能(MF)條目72個(gè)。KEGG通路富集篩選得到56條信號(hào)通路(P<0.05),涉及鈣離子信號(hào)通路、花生四烯酸代謝通路、MAPK信號(hào)通路等相關(guān)信號(hào)通路。分子對(duì)接結(jié)果顯示,甘草香豆酮、槲皮素、山柰酚等核心成分與抗COVID-19藥物潛在作用靶點(diǎn)的親和力可能較推薦用藥更強(qiáng)。結(jié)論:藏藥三味龍膽花片可通過多成分、多靶點(diǎn)、多通路的協(xié)同作用發(fā)揮療... 

【文章來源】:中藥藥理與臨床. 2020年03期 北大核心

【文章頁數(shù)】:7 頁

【部分圖文】:

基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和分子對(duì)接技術(shù)的藏藥三味龍膽花片用于新型冠狀病毒肺炎(COVID-19)的作用機(jī)制探討


“三味龍膽花片藥物-化合物-靶點(diǎn)”網(wǎng)絡(luò)圖

網(wǎng)絡(luò)圖,蛋白,靶標(biāo),網(wǎng)絡(luò)圖


將2.2中得到的168 個(gè)靶標(biāo)蛋白導(dǎo)入STRING 11.0數(shù)據(jù)庫中進(jìn)行分析,得到蛋白-蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)圖(見圖2)。其中節(jié)點(diǎn)代表靶標(biāo)蛋白,邊代表蛋白之間的相互作用關(guān)系,圖中含有168 個(gè)靶蛋白和889 條互作邊,導(dǎo)入cytoscape3.7.2 軟件分析得到degree值排名前5的靶點(diǎn)為MAPK3、EGFR、CASP3、STAT3、ESR1。2.4 靶點(diǎn)通路分析

龍膽,靶點(diǎn),富集,條目


GO功能富集分析得到GO條目291 個(gè)(P<0.05),其中生物過程(BP)條目186 個(gè),細(xì)胞組成(CC)條目33 個(gè),分子功能(MF)條目72 個(gè),根據(jù)保留P<0.05的結(jié)果,并分別對(duì)前10 個(gè)條目進(jìn)行可視化分析,見圖3。由圖3可知,涉及的主要生物過程富集條目為凋亡過程的負(fù)調(diào)控(negative regulation of apoptotic process)、蛋白質(zhì)磷酸化(protein phosphorylation)、炎癥反應(yīng)(inflammatory response)等;涉及的主要細(xì)胞組成為質(zhì)膜(plasma membrane)、細(xì)胞外泌體(extracellular exosome)、核質(zhì)(nucleoplasm)等;涉及的主要分子功能為類固醇激素受體活性(steroid hormone receptor activity)、蛋白激酶活性(protein kinase activity)、轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合(transcription factor binding)等。KEGG通路富集篩選得到56 條信號(hào)通路(P<0.05),對(duì)前20條通路進(jìn)行分析,其中涉及的主要信號(hào)通路有鈣離子信號(hào)通路、花生四烯酸代謝通路、MAPK信號(hào)通路、TRP通道、腎素血管緊張素系統(tǒng)等,見圖4。圖3 三味龍膽花片靶標(biāo)的GO功能富集分析

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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博士論文
[1]臭靈丹黃酮及倍半萜類化合物抗流感藥效研究[D]. 何家揚(yáng).廣州中醫(yī)藥大學(xué) 2018



本文編號(hào):2952128

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