基于RNA-seq技術(shù)分析復(fù)方通絡(luò)飲治療腦梗死的轉(zhuǎn)錄組學(xué)特征
發(fā)布時(shí)間:2020-12-28 14:26
目的:通過(guò)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(RNA-seq, RNA-seqence)技術(shù)探討復(fù)方通絡(luò)飲治療腦梗死的可能機(jī)制。方法:雄性SD大鼠,造永久性大腦中動(dòng)脈梗死(pMCAO, permanent middle cerebral occlusion)模型后,分為模型對(duì)照組和復(fù)方通絡(luò)飲24 g/kg治療組,另設(shè)正常對(duì)照組。各組灌胃生理鹽水或等體積藥物,每日1次。術(shù)后7 d末次給藥后2 h斷頭處死,取缺血側(cè)腦組織進(jìn)行RNA-Seq轉(zhuǎn)錄組測(cè)序。結(jié)果:通過(guò)RNA-Seq測(cè)序發(fā)現(xiàn)與正常對(duì)照組比較,模型對(duì)照組差異表達(dá)基因功能主要集中在綁定分子功能(binding)、催化活性(catalytic activity)功能等方面;與模型對(duì)照組比較,復(fù)方通絡(luò)飲24 g/kg治療組差異表達(dá)基因集中在白細(xì)胞跨內(nèi)皮遷移(leukocyte transendothelial migration)與黏著斑通路(focal adhesion)。對(duì)部分差異基因進(jìn)行了蛋白表達(dá)水平的驗(yàn)證,發(fā)現(xiàn)與模型對(duì)照組比較,復(fù)方通絡(luò)飲24 g/kg治療組能夠明顯下調(diào)缺血側(cè)腦組織ICAM-1(細(xì)胞間黏附分子-1)、MMP-9 (基質(zhì)金屬蛋白酶-9)蛋白表...
【文章來(lái)源】:中藥藥理與臨床. 2020年03期 北大核心
【文章頁(yè)數(shù)】:6 頁(yè)
【部分圖文】:
腦梗死大鼠模型對(duì)照組與正常對(duì)照組比較差異基因表達(dá)火山圖
腦梗死大鼠模型對(duì)照組與正常對(duì)照組比較差異基因GO功能分析
表2 復(fù)方通絡(luò)飲24 g/kg組治療腦梗死大鼠與模型對(duì)照組比較顯著差異表達(dá)基因 基因 倍數(shù)(與模型對(duì)照組比較) 顯著上調(diào)基因 Gcc2 2.35 Dzip3 2.24 Gabrb2 3.22 Ccdc88a 2.26 Zfp386 2.43 Smc6 2.32 Rb1cc1 2.62 Zfp101 3.68 Kcnh7 3.38 Ccdc41 2.54 Phip 2.38 Kcnh5 4.52 Samd9l 2.62 Ttc14 2.58 Zfp638 2.41 Zfp458 5.03 Ermn 2.26 Herc6 2.73 Vps13a 2.56 Zfp292 2.27 Rock1 2.31 Slfn3 2.86 顯著下調(diào)基因 ICAM-1 -4.41 Igfbp3 -2.67 MMP-9 -4.97 Ctgf -2.72 Hif3a -2.72 顯著差異表達(dá)基因定義為 FDR≤0.01且倍數(shù)差異在2倍以上的基因。圖4 復(fù)方通絡(luò)飲治療組與腦梗死大鼠模型對(duì)照組比較顯著差異基因聚類熱圖
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]MMP-9與腦小血管病發(fā)生的關(guān)聯(lián)性研究[J]. 孫文珂,孔祥鋒. 世界最新醫(yī)學(xué)信息文摘. 2019(93)
[2]復(fù)方通絡(luò)飲對(duì)腦梗死急性期患者神經(jīng)功能及血管生長(zhǎng)相關(guān)因子的影響[J]. 惠振,張臻年,張敬華,劉孔江,肖婧,李靜波,鄭培華,王敬卿. 中醫(yī)雜志. 2018(16)
[3]復(fù)方通絡(luò)飲對(duì)腦梗死大鼠的神經(jīng)保護(hù)作用及其促血管新生機(jī)制研究[J]. 惠振,張敬華,石美玲,王敬卿. 中西醫(yī)結(jié)合心腦血管病雜志. 2018(02)
[4]中西醫(yī)結(jié)合治療腦梗死恢復(fù)期患者72例臨床研究[J]. 王敬卿,惠振,肖婧,趙峰,張敬華. 江蘇中醫(yī)藥. 2012(12)
[5]復(fù)方通絡(luò)膠囊預(yù)處理大腦中動(dòng)脈缺血再灌注大鼠后血漿vWFTM含量和MMP-2 mRNA表達(dá)的變化[J]. 王敬卿,肖婧,張絨. 遼寧中醫(yī)藥大學(xué)學(xué)報(bào). 2011(04)
[6]復(fù)方通絡(luò)膠囊對(duì)大腦中動(dòng)脈缺血再灌注大鼠的預(yù)防性保護(hù)作用[J]. 王敬卿,肖婧,張絨. 江蘇中醫(yī)藥. 2010(01)
[7]復(fù)方通絡(luò)膠囊對(duì)人臍靜脈內(nèi)皮細(xì)胞保護(hù)的作用機(jī)制[J]. 王敬卿,肖婧,張絨. 中國(guó)醫(yī)藥導(dǎo)報(bào). 2009(36)
本文編號(hào):2943913
【文章來(lái)源】:中藥藥理與臨床. 2020年03期 北大核心
【文章頁(yè)數(shù)】:6 頁(yè)
【部分圖文】:
腦梗死大鼠模型對(duì)照組與正常對(duì)照組比較差異基因表達(dá)火山圖
腦梗死大鼠模型對(duì)照組與正常對(duì)照組比較差異基因GO功能分析
表2 復(fù)方通絡(luò)飲24 g/kg組治療腦梗死大鼠與模型對(duì)照組比較顯著差異表達(dá)基因 基因 倍數(shù)(與模型對(duì)照組比較) 顯著上調(diào)基因 Gcc2 2.35 Dzip3 2.24 Gabrb2 3.22 Ccdc88a 2.26 Zfp386 2.43 Smc6 2.32 Rb1cc1 2.62 Zfp101 3.68 Kcnh7 3.38 Ccdc41 2.54 Phip 2.38 Kcnh5 4.52 Samd9l 2.62 Ttc14 2.58 Zfp638 2.41 Zfp458 5.03 Ermn 2.26 Herc6 2.73 Vps13a 2.56 Zfp292 2.27 Rock1 2.31 Slfn3 2.86 顯著下調(diào)基因 ICAM-1 -4.41 Igfbp3 -2.67 MMP-9 -4.97 Ctgf -2.72 Hif3a -2.72 顯著差異表達(dá)基因定義為 FDR≤0.01且倍數(shù)差異在2倍以上的基因。圖4 復(fù)方通絡(luò)飲治療組與腦梗死大鼠模型對(duì)照組比較顯著差異基因聚類熱圖
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]MMP-9與腦小血管病發(fā)生的關(guān)聯(lián)性研究[J]. 孫文珂,孔祥鋒. 世界最新醫(yī)學(xué)信息文摘. 2019(93)
[2]復(fù)方通絡(luò)飲對(duì)腦梗死急性期患者神經(jīng)功能及血管生長(zhǎng)相關(guān)因子的影響[J]. 惠振,張臻年,張敬華,劉孔江,肖婧,李靜波,鄭培華,王敬卿. 中醫(yī)雜志. 2018(16)
[3]復(fù)方通絡(luò)飲對(duì)腦梗死大鼠的神經(jīng)保護(hù)作用及其促血管新生機(jī)制研究[J]. 惠振,張敬華,石美玲,王敬卿. 中西醫(yī)結(jié)合心腦血管病雜志. 2018(02)
[4]中西醫(yī)結(jié)合治療腦梗死恢復(fù)期患者72例臨床研究[J]. 王敬卿,惠振,肖婧,趙峰,張敬華. 江蘇中醫(yī)藥. 2012(12)
[5]復(fù)方通絡(luò)膠囊預(yù)處理大腦中動(dòng)脈缺血再灌注大鼠后血漿vWFTM含量和MMP-2 mRNA表達(dá)的變化[J]. 王敬卿,肖婧,張絨. 遼寧中醫(yī)藥大學(xué)學(xué)報(bào). 2011(04)
[6]復(fù)方通絡(luò)膠囊對(duì)大腦中動(dòng)脈缺血再灌注大鼠的預(yù)防性保護(hù)作用[J]. 王敬卿,肖婧,張絨. 江蘇中醫(yī)藥. 2010(01)
[7]復(fù)方通絡(luò)膠囊對(duì)人臍靜脈內(nèi)皮細(xì)胞保護(hù)的作用機(jī)制[J]. 王敬卿,肖婧,張絨. 中國(guó)醫(yī)藥導(dǎo)報(bào). 2009(36)
本文編號(hào):2943913
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