基于分子描述符的中草藥化合物類藥性預(yù)測及應(yīng)用研究
發(fā)布時(shí)間:2020-12-14 18:54
目前,中草藥已經(jīng)在世界范圍內(nèi)得到了廣泛的關(guān)注。中草藥的治病機(jī)制與西藥的治病機(jī)制在分子水平上比較起來,大多數(shù)中草藥的治病機(jī)制卻尚不清晰。如何讓中草藥與現(xiàn)代醫(yī)學(xué)接軌,中草藥的計(jì)算機(jī)輔助現(xiàn)代化研究就顯得尤為重要。虛擬篩選、藥效團(tuán)模型、機(jī)器學(xué)習(xí)等中草藥化合物類藥性預(yù)測方法都是極為重要的計(jì)算機(jī)輔助中草藥現(xiàn)代化研究方法。當(dāng)下越來越多的中草藥化合物被廣泛應(yīng)用為候選類藥化合物。制藥公司開發(fā)藥物的一個(gè)重要途徑就是從中草藥中發(fā)現(xiàn)具有相關(guān)靶點(diǎn)的潛在活性化合物。在眾多中草藥化合物類藥性預(yù)測方法中,虛擬篩選技術(shù)可靠性強(qiáng)、預(yù)測速度快、預(yù)測精度好,因此一直處于中草藥化合物類藥性預(yù)測方法中的核心地位。特殊醫(yī)學(xué)用途配方食品采取直接食用或胃腸導(dǎo)管給藥的途徑對營養(yǎng)缺乏的臨床病人進(jìn)行營養(yǎng)支持,是一種全新的應(yīng)用于臨床患者營養(yǎng)支持的產(chǎn)品。特殊醫(yī)學(xué)用途配方食品由于具備防止患者胃腸功能退化、易于存儲運(yùn)輸、價(jià)格低廉的優(yōu)勢,逐漸被臨床醫(yī)生和營養(yǎng)師所推崇。但目前市面上的特殊醫(yī)學(xué)用途配方食品成分較為簡單,營養(yǎng)素來源單一。論文首先綜合研究了以上幾種基于生物信息學(xué)的類藥性預(yù)測方法,基于生物信息學(xué)的類藥性預(yù)測方法在對整體數(shù)據(jù)庫的類藥性分析和對特定...
【文章來源】:哈爾濱商業(yè)大學(xué)黑龍江省
【文章頁數(shù)】:62 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖2年發(fā)布化合物結(jié)構(gòu)與總結(jié)構(gòu)數(shù)jft統(tǒng)計(jì)圖??Fig?2?Statistics?of?compound?structure?and?total?structure?released?in??
對來自化學(xué)品目錄數(shù)據(jù)庫中的228362個(gè)化合物,來自藥物數(shù)據(jù)庫中的153365個(gè)化??合物和來自中藥化合物數(shù)據(jù)庫中的64352個(gè)化合物進(jìn)行基于相對分子質(zhì)量的分布分析,??得到如圖5所示的分布結(jié)果。??010?B@*ACD1??S3MDDR1??nOITCMCOI??0.08??¥?0?.06??:L?I?I??0?100?200?300?400?500?600?700??圖5相對分子質(zhì)量分布圖??Fig?5?Relative?molecular?mass?distribution?map??上表2和圖5中數(shù)據(jù)表明,Ml與A1數(shù)據(jù)庫中的化合物存在著明顯的和對分子質(zhì)??量差異,Ml數(shù)據(jù)庫中化合物的平均分子質(zhì)量力410,而A1數(shù)據(jù)庫屮化合物的平均分子??質(zhì)量為275。M1數(shù)據(jù)庫中化合物平均相對分子質(zhì)量較之A1數(shù)據(jù)庠中的化合物平均相對??分子質(zhì)M大,而T1數(shù)據(jù)庫中化合物的相對分子質(zhì)量介于二者之間,。睌(shù)據(jù)庫中化合物??的平均相對分子質(zhì)量368。而且,相對于A1數(shù)據(jù)庫中的化合物來說,TI數(shù)據(jù)庫中的化??合物與Ml數(shù)據(jù)庫中的平均相對分子質(zhì)量更為接近。如圖5所示,相對TA1數(shù)據(jù)庫中??化合物的相對分子質(zhì)量的分布來說,Ml數(shù)據(jù)庫中的化合物的相對分子質(zhì)跫分布與T1數(shù)??據(jù)庫中的相對分子質(zhì)量分布從形態(tài)學(xué)上來講更加接近。根據(jù)以上分析,可以發(fā)現(xiàn),T1??數(shù)據(jù)庫屮的化合物與Ml數(shù)據(jù)庫中的化合物從相對分子質(zhì)量這一性質(zhì)上來講較為相似。??由于相對分子質(zhì)量與藥物的人體吸收度聯(lián)系密切
圖7?PH=7.4情況下的表觀脂水分配系數(shù)分布圖??Fig?7?Distribution?of?apparent?lipid?water?distribution?coefficient?under??
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]中藥臨方炮制現(xiàn)狀與技術(shù)規(guī)范構(gòu)建探討[J]. 戴瑩,翟華強(qiáng),王寧寧,劉國秀,李絲雨,李寧寧,金世元. 中國中醫(yī)藥信息雜志. 2019(03)
[2]代謝組學(xué)技術(shù)在抗結(jié)核新藥研發(fā)中的應(yīng)用研究進(jìn)展[J]. 古秀娟,曾婭莉,鄧建軍,霍婷婷,王玉琳,楊潔. 中國藥房. 2019(04)
[3]不同類型丙烯酸酯壓敏膠中右旋酮洛芬的體內(nèi)外釋藥行為研究及原因探究[J]. 童想柳,楊雅麗,林國鋇,武余波,羅華菲. 中國醫(yī)藥工業(yè)雜志. 2019(01)
[4]木質(zhì)素的高附加值應(yīng)用研究進(jìn)展[J]. 黃曹興,何娟,梁辰,唐碩,勇強(qiáng). 林業(yè)工程學(xué)報(bào). 2019(01)
[5]水液相環(huán)境下α-丙氨酸分子的旋光異構(gòu)及氫氧根和羥基自由基的作用[J]. 楊曉翠,高峰,佟華,閆紅彥,王佐成. 武漢大學(xué)學(xué)報(bào)(理學(xué)版). 2019(01)
[6]淺談中藥炮制中的整體觀念與辯證論治觀[J]. 陳磊收. 世界最新醫(yī)學(xué)信息文摘. 2018(A5)
[7]生物活性測定法替代方法驗(yàn)證研究[J]. 李震,張媛,高華. 中國新藥雜志. 2018(24)
[8]大葉種茶葉中游離氨基酸的提取條件研究[J]. 陳春月,釧相龍,曹喜念,陳圓圓,肖涵. 昆明學(xué)院學(xué)報(bào). 2018(06)
[9]Luteolin與Galactose之間氫鍵相互作用的理論研究[J]. 羅冬梅,張賀,李可心,李明漢,高天,王俊麗. 赤峰學(xué)院學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2018(12)
[10]國內(nèi)藥食同源的產(chǎn)生與應(yīng)用[J]. 范保瑞,張悅,劉紅玉,薛玉菡,趙燕燕. 醫(yī)學(xué)研究與教育. 2018(06)
博士論文
[1]民國時(shí)期(1912-1949)中藥文獻(xiàn)及其學(xué)術(shù)考察與研究[D]. 李楠.中國中醫(yī)科學(xué)院 2014
碩士論文
[1]C-O單鍵官能團(tuán)在半焦-NO反應(yīng)中的作用[D]. 趙彤.中國科學(xué)院大學(xué)(中國科學(xué)院過程工程研究所) 2018
[2]復(fù)合薏仁油(C-ASO)防治皮膚癌變功效與機(jī)制研究[D]. 張真真.河南大學(xué) 2018
[3]相溶解度法結(jié)合分子模擬計(jì)算研究環(huán)糊精對六種天然藥物的增溶機(jī)理[D]. 李昊原.沈陽師范大學(xué) 2018
[4]精氨酸對改善肝膽術(shù)后病人氮平衡的研究[D]. 許曉紅.青島大學(xué) 2014
本文編號:2916850
【文章來源】:哈爾濱商業(yè)大學(xué)黑龍江省
【文章頁數(shù)】:62 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖2年發(fā)布化合物結(jié)構(gòu)與總結(jié)構(gòu)數(shù)jft統(tǒng)計(jì)圖??Fig?2?Statistics?of?compound?structure?and?total?structure?released?in??
對來自化學(xué)品目錄數(shù)據(jù)庫中的228362個(gè)化合物,來自藥物數(shù)據(jù)庫中的153365個(gè)化??合物和來自中藥化合物數(shù)據(jù)庫中的64352個(gè)化合物進(jìn)行基于相對分子質(zhì)量的分布分析,??得到如圖5所示的分布結(jié)果。??010?B@*ACD1??S3MDDR1??nOITCMCOI??0.08??¥?0?.06??:L?I?I??0?100?200?300?400?500?600?700??圖5相對分子質(zhì)量分布圖??Fig?5?Relative?molecular?mass?distribution?map??上表2和圖5中數(shù)據(jù)表明,Ml與A1數(shù)據(jù)庫中的化合物存在著明顯的和對分子質(zhì)??量差異,Ml數(shù)據(jù)庫中化合物的平均分子質(zhì)量力410,而A1數(shù)據(jù)庫屮化合物的平均分子??質(zhì)量為275。M1數(shù)據(jù)庫中化合物平均相對分子質(zhì)量較之A1數(shù)據(jù)庠中的化合物平均相對??分子質(zhì)M大,而T1數(shù)據(jù)庫中化合物的相對分子質(zhì)量介于二者之間,。睌(shù)據(jù)庫中化合物??的平均相對分子質(zhì)量368。而且,相對于A1數(shù)據(jù)庫中的化合物來說,TI數(shù)據(jù)庫中的化??合物與Ml數(shù)據(jù)庫中的平均相對分子質(zhì)量更為接近。如圖5所示,相對TA1數(shù)據(jù)庫中??化合物的相對分子質(zhì)量的分布來說,Ml數(shù)據(jù)庫中的化合物的相對分子質(zhì)跫分布與T1數(shù)??據(jù)庫中的相對分子質(zhì)量分布從形態(tài)學(xué)上來講更加接近。根據(jù)以上分析,可以發(fā)現(xiàn),T1??數(shù)據(jù)庫屮的化合物與Ml數(shù)據(jù)庫中的化合物從相對分子質(zhì)量這一性質(zhì)上來講較為相似。??由于相對分子質(zhì)量與藥物的人體吸收度聯(lián)系密切
圖7?PH=7.4情況下的表觀脂水分配系數(shù)分布圖??Fig?7?Distribution?of?apparent?lipid?water?distribution?coefficient?under??
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]中藥臨方炮制現(xiàn)狀與技術(shù)規(guī)范構(gòu)建探討[J]. 戴瑩,翟華強(qiáng),王寧寧,劉國秀,李絲雨,李寧寧,金世元. 中國中醫(yī)藥信息雜志. 2019(03)
[2]代謝組學(xué)技術(shù)在抗結(jié)核新藥研發(fā)中的應(yīng)用研究進(jìn)展[J]. 古秀娟,曾婭莉,鄧建軍,霍婷婷,王玉琳,楊潔. 中國藥房. 2019(04)
[3]不同類型丙烯酸酯壓敏膠中右旋酮洛芬的體內(nèi)外釋藥行為研究及原因探究[J]. 童想柳,楊雅麗,林國鋇,武余波,羅華菲. 中國醫(yī)藥工業(yè)雜志. 2019(01)
[4]木質(zhì)素的高附加值應(yīng)用研究進(jìn)展[J]. 黃曹興,何娟,梁辰,唐碩,勇強(qiáng). 林業(yè)工程學(xué)報(bào). 2019(01)
[5]水液相環(huán)境下α-丙氨酸分子的旋光異構(gòu)及氫氧根和羥基自由基的作用[J]. 楊曉翠,高峰,佟華,閆紅彥,王佐成. 武漢大學(xué)學(xué)報(bào)(理學(xué)版). 2019(01)
[6]淺談中藥炮制中的整體觀念與辯證論治觀[J]. 陳磊收. 世界最新醫(yī)學(xué)信息文摘. 2018(A5)
[7]生物活性測定法替代方法驗(yàn)證研究[J]. 李震,張媛,高華. 中國新藥雜志. 2018(24)
[8]大葉種茶葉中游離氨基酸的提取條件研究[J]. 陳春月,釧相龍,曹喜念,陳圓圓,肖涵. 昆明學(xué)院學(xué)報(bào). 2018(06)
[9]Luteolin與Galactose之間氫鍵相互作用的理論研究[J]. 羅冬梅,張賀,李可心,李明漢,高天,王俊麗. 赤峰學(xué)院學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2018(12)
[10]國內(nèi)藥食同源的產(chǎn)生與應(yīng)用[J]. 范保瑞,張悅,劉紅玉,薛玉菡,趙燕燕. 醫(yī)學(xué)研究與教育. 2018(06)
博士論文
[1]民國時(shí)期(1912-1949)中藥文獻(xiàn)及其學(xué)術(shù)考察與研究[D]. 李楠.中國中醫(yī)科學(xué)院 2014
碩士論文
[1]C-O單鍵官能團(tuán)在半焦-NO反應(yīng)中的作用[D]. 趙彤.中國科學(xué)院大學(xué)(中國科學(xué)院過程工程研究所) 2018
[2]復(fù)合薏仁油(C-ASO)防治皮膚癌變功效與機(jī)制研究[D]. 張真真.河南大學(xué) 2018
[3]相溶解度法結(jié)合分子模擬計(jì)算研究環(huán)糊精對六種天然藥物的增溶機(jī)理[D]. 李昊原.沈陽師范大學(xué) 2018
[4]精氨酸對改善肝膽術(shù)后病人氮平衡的研究[D]. 許曉紅.青島大學(xué) 2014
本文編號:2916850
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