目的探討丹參制劑輔助治療乳腺癌的安全風(fēng)險(xiǎn)。方法生物信息學(xué)技術(shù)篩選分析GEO數(shù)據(jù)庫(kù)中的基因芯片GSE85871,對(duì)丹參制劑的主要化學(xué)成分干預(yù)人乳腺癌細(xì)胞MCF7差異表達(dá)基因進(jìn)行GO功能注釋和KEGG通路分析,結(jié)合文獻(xiàn)挖掘方法梳理丹參制劑的不良反應(yīng)/事件。結(jié)果丹參制劑干預(yù)MCF7細(xì)胞時(shí),對(duì)神經(jīng)-配體信號(hào)通路、甲狀腺通路、免疫調(diào)節(jié)及CHRM2等基因顯示調(diào)節(jié)作用,該通路的異常會(huì)引起神經(jīng)受體功能異常、下丘腦分泌功能異常（甲狀腺）、呼吸系統(tǒng)功能異常（哮喘）。結(jié)論初步利用生物信息學(xué)方法結(jié)合文獻(xiàn)挖掘,預(yù)警丹參制劑輔助治療乳腺癌的潛在安全風(fēng)險(xiǎn),提示臨床醫(yī)護(hù)人員在應(yīng)用丹參制劑輔助治療乳腺癌時(shí),應(yīng)關(guān)注患者的神經(jīng)系統(tǒng)功能、甲狀腺功能、呼吸功能。為進(jìn)一步中藥制劑的安全性研究提供思路。 

【文章來(lái)源】：北京中醫(yī)藥大學(xué)學(xué)報(bào). 2020年05期 第414-422頁(yè) 北大核心

【文章頁(yè)數(shù)】：9 頁(yè)

【部分圖文】：

核心基因網(wǎng)絡(luò)圖

通過(guò)DAVID網(wǎng)站的GO富集分析,注釋相關(guān)基因及生物進(jìn)程,上調(diào)基因顯著富集在細(xì)胞外、質(zhì)膜,主要參與血小板活化、Rho蛋白信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、細(xì)胞黏附、外在凋亡信號(hào)等生物過(guò)程(表5)。下調(diào)基因顯著富集在胞外區(qū)域、突觸,主要參與細(xì)胞視黃酸反應(yīng)、鈣離子濃度、免疫反應(yīng)、細(xì)胞增殖負(fù)反饋等生物過(guò)程(表6)。表5 上調(diào)基因的GO功能注釋Table 5 GO function annotation of up-regulated 分類Classification GO編號(hào)GO ID 注釋Notes 基因數(shù)Gene number P 生物學(xué)過(guò)程 GO:0030168 platelet activation 血小板活化 13 2.50×10-7 BP GO:0030198 extracellular matrix organization 細(xì)胞外基質(zhì)組織 14 1.34×10-5 GO:0035025 positive regulation of Rho protein signal transduction Rho蛋白信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)的正調(diào)控 6 4.56×10-5 GO:0007155 cell adhesion 細(xì)胞粘附 20 1.19×10-4 GO:2001240 negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway in absence of ligand 外在凋亡信號(hào)通路的負(fù)調(diào)控 6 2.62×10-4 細(xì)胞定位CC GO:0005576 extracellular region 細(xì)胞外區(qū)域 55 5.11×10-9 GO:0005615 extracellular space 細(xì)胞外空間 49 6.51×10-9 GO:0005887 integral component of plasma membrane 質(zhì)膜的組成部分 46 5.57×10-7 GO:0005886 plasma membrane 質(zhì)膜 96 7.13×10-7 GO:0009986 cell surface 細(xì)胞表面 21 1.46×10-4 分子功能MF GO:0005520 insulin-like growth factor binding 胰島素樣生長(zhǎng)因子結(jié)合 5 1.44×10-4 GO:0005201 extracellular matrix structural constituent 細(xì)胞外基質(zhì)結(jié)構(gòu)成分 6 3.76×10-3 GO:0005178 integrin binding 整聯(lián)蛋白結(jié)合 7 5.80×10-3 GO:0005044 scavenger receptor activity 清道夫受體活性 5 6.37×10-3 GO:0005102 receptor binding 受體結(jié)合 13 9.01×10-3

差異基因經(jīng)STRING和Cytoscape構(gòu)建蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)。除去游離基因,可得到由266個(gè)節(jié)點(diǎn),618條邊構(gòu)成的網(wǎng)絡(luò)。利用Cytoscape中的插件Cyto Hubba計(jì)算分析該網(wǎng)絡(luò),按照degree值排序,得到相互作用程度最高的前10個(gè)基因,分別是C3、POMC、ADCY2、CXCL12、CHRM2、MCHR1、GPR17、CXCR5、IGF1、OPRM1。結(jié)果見(jiàn)圖3。圖3 核心基因網(wǎng)絡(luò)圖


本文編號(hào)：2904610