西醫(yī)治療動(dòng)脈粥樣硬化包括藥物治療、介入治療以及基因治療;藥物治療毒副作用大、容易產(chǎn)生耐藥性,介入治療產(chǎn)生血栓及再狹窄等問題,基因治療尚處于探索階段。而中藥毒副作用小,來源廣泛,在臨床治療疾病中發(fā)揮著重要的作用,在現(xiàn)代藥物研究中受到科研人員極大的關(guān)注和重視。因此,從中藥中發(fā)現(xiàn)和研究治療動(dòng)脈粥樣硬化的化學(xué)成分對于減少藥物的毒副作用,擴(kuò)大藥物來源具有積極意義。傳統(tǒng)的實(shí)驗(yàn)方法篩選藥物消耗巨大,因此需要開發(fā)新的方法進(jìn)行藥物篩選。隨著科學(xué)技術(shù)的不斷發(fā)展,新的藥物篩選方法應(yīng)運(yùn)而生,如虛擬篩選。本文采用兩種不同的虛擬篩選策略對中藥化學(xué)成分進(jìn)行篩選,獲得與動(dòng)脈粥樣硬化靶點(diǎn)相關(guān)的中藥活性化學(xué)成分。方法一采用支持向量機(jī)結(jié)合分子對接從中藥化學(xué)成分?jǐn)?shù)據(jù)庫TCMSP篩選出173個(gè)與動(dòng)脈粥樣硬化靶點(diǎn)相關(guān)的化學(xué)成分;方法二運(yùn)用藥物靶點(diǎn)相互配對關(guān)系從上述數(shù)據(jù)庫中篩選出358個(gè)中藥化學(xué)成分。分析兩種方法的篩選結(jié)果及查閱文獻(xiàn)可知:方法1中篩選出的部分化合物與動(dòng)脈粥樣硬化機(jī)制相關(guān),如Procyanidin B4與炎癥機(jī)制相關(guān),Oxypaeniflora與氧化和炎癥相關(guān);方法2篩選出的化合物中1,22-docosanediol... 

【文章來源】：廣東藥科大學(xué)廣東省

【文章頁數(shù)】：73 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

（a）1dp9靶蛋白處理結(jié)構(gòu)示意圖

圖 2-1（b）2ow2 靶蛋白處理結(jié)構(gòu)示意圖2 分子對接方法評(píng)價(jià)隨著分子對接理論和方法的不斷發(fā)展，分子對接軟件也越來越多，但每種軟方法自身也存在不足。根據(jù)不同的對接對象，我們需要采用不同的軟件和算完成實(shí)驗(yàn)。如何確定對接方法適用于所處理的任務(wù)，就需要對對接方法的可進(jìn)行評(píng)價(jià)。在篩選中藥化學(xué)成分之前，我們采用以下方法來對對接方法進(jìn)行評(píng)價(jià)，如果DB 數(shù)據(jù)庫中獲得的靶蛋白復(fù)合物中有小分子原配體，我們可以先將小分子蛋白中分離出來，再對接到活性位點(diǎn)，計(jì)算原始晶體中原配體小分子與對接分子對接構(gòu)象的均方根偏差（RMSD），當(dāng) RMSD 值小于 2 時(shí)，則該對接可靠，可以用于中藥化合物小分子的對接篩選；如果原始蛋白晶體中沒有小配體，我們可從該靶蛋白的抑制劑與非抑制劑中抽取一部分，計(jì)算靶蛋白對劑和非抑制劑的區(qū)分能力 P-value 值，當(dāng) P-value 值小于或等于 10-20時(shí)，則該對接流程可靠[82]。

廣東藥科大學(xué)碩士研究生論文為得到到黃芪甲苷含量最高的提取工藝，按黃芪甲苷總量最大化進(jìn)行優(yōu)繪制響應(yīng)面曲線圖（圖 4-1）。預(yù)測最優(yōu)條件為 A=12，B=1.53，C=3.00，即加量為 12 倍藥材量，煎煮時(shí)間為 1.53 h，煎煮次數(shù)為 3 次，預(yù)測結(jié)果為黃芪甲總量 25.16 mg（Solution Desirability 值 1.00）。


本文編號(hào)：2902674