基于網(wǎng)絡(luò)藥理學探討朱日亨滴丸治療大鼠急性心肌缺血再灌注損傷
發(fā)布時間:2020-12-07 01:35
目的:基于網(wǎng)絡(luò)藥理學方法探討朱日亨滴丸體內(nèi)、體外對大鼠心肌缺血再灌注損傷的干預(yù)作用。方法:實驗一:基礎(chǔ)方(三味檀香散)治療冠心病的網(wǎng)絡(luò)藥理學研究。通過文獻挖掘、多個中藥材成分數(shù)據(jù)庫檢索收集整理三味檀香散中化學成分并經(jīng)OB(Oral bioavailability,口服生物利用度)和DL(Drug-likeness,類藥性)分析篩選;利用PharmMapper、SWISS、Superpred在線平臺預(yù)測化合物潛在靶點;OMIM數(shù)據(jù)庫收集冠心病的相關(guān)靶標;利用STRING做蛋白互作分析;通過DAVID在線工具對關(guān)鍵靶標做通路富集;應(yīng)用Cytoscape軟件建立該方劑的“藥材-化合物-靶標-通路”網(wǎng)絡(luò)模型,并對網(wǎng)絡(luò)模型進行拓撲學分析;采用Schrodinger分子對接技術(shù)對網(wǎng)絡(luò)模型分析的部分結(jié)果進行驗證。實驗二:朱日亨滴丸對大鼠心肌缺血再灌注損傷的干預(yù)作用及體內(nèi)實驗驗證。大鼠隨機分為:正常組(Control)、模型組(Model)、廣棗組(GZ)、廣棗-肉豆蔻藥對組(GZ-RDK)、三味檀香散組(SWTX)和朱日亨滴丸組(ZRH)。各給藥組連續(xù)灌胃給藥10天后,除正常組外,其余各組均通過結(jié)扎...
【文章來源】:內(nèi)蒙古醫(yī)科大學內(nèi)蒙古自治區(qū)
【文章頁數(shù)】:128 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
三味檀香散網(wǎng)絡(luò)藥理學研究技術(shù)路線圖
內(nèi)蒙古醫(yī)科大學碩士研究生學位論文(2019) 8 Calcium 信號通路 0.0091049129 MAPK 信號通路 0.009695571注:根據(jù) P 值排序。3.3 三味檀香散“化合物-靶標-蛋白互作-通路”網(wǎng)絡(luò)模型3.3.1 采用 Cytoscape 軟件建立三味檀香散“藥材-疾病-靶標-通路”網(wǎng)絡(luò)模型,材、靶標以及通路結(jié)果的關(guān)聯(lián)直觀地呈現(xiàn)于圖 1.2。通過 Network Analyzer 分析三檀香散藥物分子與靶蛋白的 D-T 網(wǎng)絡(luò)特征,如連接度、介度、緊密度,觀察化合物靶標的作用情況以及靶標在生物通路中的分布情況,相關(guān)靶標的網(wǎng)絡(luò)拓撲學參數(shù)見1.7。網(wǎng)絡(luò)模型分析發(fā)現(xiàn),高網(wǎng)絡(luò)度化合物往往有較高的介度,而這些具有較高介度連接度和緊密度的靶標提示可能在生物網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)中發(fā)揮重要作用。
(注: 表示廣棗化合物; 表示肉豆蔻化合物; 表示檀香化合物; 表示草藥; 表示共靶; 表示化合物靶標)圖 1.4 連接度(Degree)分析相關(guān)網(wǎng)絡(luò)模型3.4 化合物與相應(yīng)靶標蛋白分子對接結(jié)果對上述圖 1.3(PI3K-Akt- FoxO 信號通路相關(guān)網(wǎng)絡(luò)模型)進行分析,結(jié)合表 1.7及表 1.8 網(wǎng)絡(luò)拓撲學參數(shù),可以發(fā)現(xiàn)在 PI3K-Akt 信號通路和 FoxO 信號通路這兩條通路中 AKT1、MAPK14、PIK3R1 為關(guān)鍵靶標,與其相對應(yīng)的化合物分別為廣棗中的鞣花酸(gallogen)、槲皮素(quercetin);肉豆蔻中的肉豆蔻木酚素(macelignan)、甲基丁香酚(methyleugenol)和檀香中的檀醇(santol)。經(jīng) RCSB PDB 網(wǎng)站查詢并整理出上述關(guān)鍵靶標的 PDB 編碼:MAPK14(3hv3)、AKT1(4ejn)、PIK3R1(5t8f)。應(yīng)用Schrodinger 分子對接技術(shù)進行對接,分析它們與周圍關(guān)鍵氨基酸的相互作用方式及其在活性位點結(jié)合情況見圖 1.5-1.9,對接結(jié)果顯示化合物能量值列于表 1.9。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]梔子的化學成分、藥理作用研究進展及質(zhì)量標志物預(yù)測分析[J]. 史永平,孔浩天,李昊楠,李曉彬,張云,韓利文,田青平,劉可春. 中草藥. 2019(02)
[2]缺血再灌注對大鼠心肌損傷及氧化應(yīng)激的影響[J]. 王雅楓,周璐,雷少青,夏中元. 中華實用診斷與治療雜志. 2018(12)
[3]基于多波長HPLC-DAD比較梔子不同部位化學成分差異[J]. 肖日傳,羅光明,董麗華,朱玉野,朱繼孝,張風波,伍珊娜. 中國中藥雜志. 2017(23)
[4]新疆阿魏化學成分及藥理活性研究進展[J]. 黃雅婷,岳麗君,申翔宇,王坤,劉春蘭. 國際藥學研究雜志. 2017(06)
[5]PI3K/Akt/FoxO3a/Bim信號通路介導硫化氫后處理對缺氧H9c2心肌細胞的保護作用[J]. 周波,錢坤,胡明珠,季永. 中國藥理學通報. 2017(07)
[6]梔子化學成分研究(Ⅵ)[J]. 左月明,嚴歡,張忠立,徐元利. 中藥材. 2017(03)
[7]基于網(wǎng)絡(luò)藥理學分析丹參山楂組分配伍抗動脈粥樣硬化的作用機制研究[J]. 張建永,王嵐,梁日欣,楊濱. 中國中藥雜志. 2016(23)
[8]廣棗舒心丸治療慢性心肌缺血綜合征66例臨床觀察[J]. 布仁吉日嘎拉,烏日嘎,薩仁高娃. 世界最新醫(yī)學信息文摘. 2016(61)
[9]蒙古族藥朱日很滴丸對缺血再灌注損傷及凝血功能的影響[J]. 陸景坤,那生桑,高甜,尚穎,徐彩霞,王躍武,王旭瑞,王義沖. 中國實驗方劑學雜志. 2016(10)
[10]PPAR-α通過PI3K/Akt/FoxO1信號通路對心肌細胞肥大的負性調(diào)控作用[J]. 王玉琴,王寶霞,郭媛媛,吳揚. 南通大學學報(醫(yī)學版). 2016(02)
博士論文
[1]基于“廣棗—冰片”配伍設(shè)計的沒食子酸冰片酯體內(nèi)外代謝研究[D]. 蘭薇.西北大學 2013
[2]廣棗抗心肌缺血再灌注損傷的物質(zhì)基礎(chǔ)及作用機制研究[D]. 湯喜蘭.北京中醫(yī)藥大學 2013
[3]檀香精油成分組成、分布及人工促成心材形成的研究[D]. 劉小金.中國林業(yè)科學研究院 2012
[4]檀香葉綜合利用物質(zhì)基礎(chǔ)研究[D]. 閆沖.廣州中醫(yī)藥大學 2011
[5]蒙藥山沉香揮發(fā)油成分分析及抗心肌缺血作用研究[D]. 顏彥.華中科技大學 2011
[6]白花油麻藤和香花崖豆藤化學成分及生物活性研究[D]. 鞏婷.中國協(xié)和醫(yī)科大學 2010
碩士論文
[1]基層農(nóng)村心血管病高危人群早期篩查與飲食習慣研究[D]. 毛叢林.山東大學 2018
[2]梔子豉湯神經(jīng)保護作用及其化學物質(zhì)基礎(chǔ)研究[D]. 果卉.中國人民解放軍海軍軍醫(yī)大學 2018
[3]廣棗核化學成分與廣棗質(zhì)量控制研究[D]. 向萍.內(nèi)蒙古醫(yī)科大學 2017
[4]基于“廣棗—冰片”配伍的原兒茶酸冰片酯的體內(nèi)代謝研究[D]. 吳一振.西北大學 2014
[5]PI3K/Akt/FoxO3a信號通路在FGF-2拮抗心肌細胞凋亡中的作用研究[D]. 劉米華.南華大學 2014
[6]檀香揮發(fā)油質(zhì)控及其對PC12細胞氧化損傷的保護作用研究[D]. 李麗月.廣州中醫(yī)藥大學 2013
[7]羧甲司坦對慢性氣道炎癥大鼠肺組織中PI3K/AKT和γ-GCS表達的影響[D]. 李國吾.鄭州大學 2012
本文編號:2902378
【文章來源】:內(nèi)蒙古醫(yī)科大學內(nèi)蒙古自治區(qū)
【文章頁數(shù)】:128 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
三味檀香散網(wǎng)絡(luò)藥理學研究技術(shù)路線圖
內(nèi)蒙古醫(yī)科大學碩士研究生學位論文(2019) 8 Calcium 信號通路 0.0091049129 MAPK 信號通路 0.009695571注:根據(jù) P 值排序。3.3 三味檀香散“化合物-靶標-蛋白互作-通路”網(wǎng)絡(luò)模型3.3.1 采用 Cytoscape 軟件建立三味檀香散“藥材-疾病-靶標-通路”網(wǎng)絡(luò)模型,材、靶標以及通路結(jié)果的關(guān)聯(lián)直觀地呈現(xiàn)于圖 1.2。通過 Network Analyzer 分析三檀香散藥物分子與靶蛋白的 D-T 網(wǎng)絡(luò)特征,如連接度、介度、緊密度,觀察化合物靶標的作用情況以及靶標在生物通路中的分布情況,相關(guān)靶標的網(wǎng)絡(luò)拓撲學參數(shù)見1.7。網(wǎng)絡(luò)模型分析發(fā)現(xiàn),高網(wǎng)絡(luò)度化合物往往有較高的介度,而這些具有較高介度連接度和緊密度的靶標提示可能在生物網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)中發(fā)揮重要作用。
(注: 表示廣棗化合物; 表示肉豆蔻化合物; 表示檀香化合物; 表示草藥; 表示共靶; 表示化合物靶標)圖 1.4 連接度(Degree)分析相關(guān)網(wǎng)絡(luò)模型3.4 化合物與相應(yīng)靶標蛋白分子對接結(jié)果對上述圖 1.3(PI3K-Akt- FoxO 信號通路相關(guān)網(wǎng)絡(luò)模型)進行分析,結(jié)合表 1.7及表 1.8 網(wǎng)絡(luò)拓撲學參數(shù),可以發(fā)現(xiàn)在 PI3K-Akt 信號通路和 FoxO 信號通路這兩條通路中 AKT1、MAPK14、PIK3R1 為關(guān)鍵靶標,與其相對應(yīng)的化合物分別為廣棗中的鞣花酸(gallogen)、槲皮素(quercetin);肉豆蔻中的肉豆蔻木酚素(macelignan)、甲基丁香酚(methyleugenol)和檀香中的檀醇(santol)。經(jīng) RCSB PDB 網(wǎng)站查詢并整理出上述關(guān)鍵靶標的 PDB 編碼:MAPK14(3hv3)、AKT1(4ejn)、PIK3R1(5t8f)。應(yīng)用Schrodinger 分子對接技術(shù)進行對接,分析它們與周圍關(guān)鍵氨基酸的相互作用方式及其在活性位點結(jié)合情況見圖 1.5-1.9,對接結(jié)果顯示化合物能量值列于表 1.9。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]梔子的化學成分、藥理作用研究進展及質(zhì)量標志物預(yù)測分析[J]. 史永平,孔浩天,李昊楠,李曉彬,張云,韓利文,田青平,劉可春. 中草藥. 2019(02)
[2]缺血再灌注對大鼠心肌損傷及氧化應(yīng)激的影響[J]. 王雅楓,周璐,雷少青,夏中元. 中華實用診斷與治療雜志. 2018(12)
[3]基于多波長HPLC-DAD比較梔子不同部位化學成分差異[J]. 肖日傳,羅光明,董麗華,朱玉野,朱繼孝,張風波,伍珊娜. 中國中藥雜志. 2017(23)
[4]新疆阿魏化學成分及藥理活性研究進展[J]. 黃雅婷,岳麗君,申翔宇,王坤,劉春蘭. 國際藥學研究雜志. 2017(06)
[5]PI3K/Akt/FoxO3a/Bim信號通路介導硫化氫后處理對缺氧H9c2心肌細胞的保護作用[J]. 周波,錢坤,胡明珠,季永. 中國藥理學通報. 2017(07)
[6]梔子化學成分研究(Ⅵ)[J]. 左月明,嚴歡,張忠立,徐元利. 中藥材. 2017(03)
[7]基于網(wǎng)絡(luò)藥理學分析丹參山楂組分配伍抗動脈粥樣硬化的作用機制研究[J]. 張建永,王嵐,梁日欣,楊濱. 中國中藥雜志. 2016(23)
[8]廣棗舒心丸治療慢性心肌缺血綜合征66例臨床觀察[J]. 布仁吉日嘎拉,烏日嘎,薩仁高娃. 世界最新醫(yī)學信息文摘. 2016(61)
[9]蒙古族藥朱日很滴丸對缺血再灌注損傷及凝血功能的影響[J]. 陸景坤,那生桑,高甜,尚穎,徐彩霞,王躍武,王旭瑞,王義沖. 中國實驗方劑學雜志. 2016(10)
[10]PPAR-α通過PI3K/Akt/FoxO1信號通路對心肌細胞肥大的負性調(diào)控作用[J]. 王玉琴,王寶霞,郭媛媛,吳揚. 南通大學學報(醫(yī)學版). 2016(02)
博士論文
[1]基于“廣棗—冰片”配伍設(shè)計的沒食子酸冰片酯體內(nèi)外代謝研究[D]. 蘭薇.西北大學 2013
[2]廣棗抗心肌缺血再灌注損傷的物質(zhì)基礎(chǔ)及作用機制研究[D]. 湯喜蘭.北京中醫(yī)藥大學 2013
[3]檀香精油成分組成、分布及人工促成心材形成的研究[D]. 劉小金.中國林業(yè)科學研究院 2012
[4]檀香葉綜合利用物質(zhì)基礎(chǔ)研究[D]. 閆沖.廣州中醫(yī)藥大學 2011
[5]蒙藥山沉香揮發(fā)油成分分析及抗心肌缺血作用研究[D]. 顏彥.華中科技大學 2011
[6]白花油麻藤和香花崖豆藤化學成分及生物活性研究[D]. 鞏婷.中國協(xié)和醫(yī)科大學 2010
碩士論文
[1]基層農(nóng)村心血管病高危人群早期篩查與飲食習慣研究[D]. 毛叢林.山東大學 2018
[2]梔子豉湯神經(jīng)保護作用及其化學物質(zhì)基礎(chǔ)研究[D]. 果卉.中國人民解放軍海軍軍醫(yī)大學 2018
[3]廣棗核化學成分與廣棗質(zhì)量控制研究[D]. 向萍.內(nèi)蒙古醫(yī)科大學 2017
[4]基于“廣棗—冰片”配伍的原兒茶酸冰片酯的體內(nèi)代謝研究[D]. 吳一振.西北大學 2014
[5]PI3K/Akt/FoxO3a信號通路在FGF-2拮抗心肌細胞凋亡中的作用研究[D]. 劉米華.南華大學 2014
[6]檀香揮發(fā)油質(zhì)控及其對PC12細胞氧化損傷的保護作用研究[D]. 李麗月.廣州中醫(yī)藥大學 2013
[7]羧甲司坦對慢性氣道炎癥大鼠肺組織中PI3K/AKT和γ-GCS表達的影響[D]. 李國吾.鄭州大學 2012
本文編號:2902378
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