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數(shù)據(jù)融合策略結(jié)合化學計量學對滇重樓產(chǎn)地溯源研究

發(fā)布時間:2020-05-13 10:31
【摘要】:在大健康理念推動下,中藥在預防、治療、保健、康復等方面顯示出特有優(yōu)勢,已引起國內(nèi)外醫(yī)學人士的廣泛關(guān)注。藥材質(zhì)量是影響臨床用藥安全性和有效性的重要因素,對中藥質(zhì)量進行評價,既是保證臨床用藥的前提,亦是中藥發(fā)展與研究的核心。中藥質(zhì)量受眾多因素影響,如品種、產(chǎn)地、采收期等均會使藥材次生代謝產(chǎn)物積累發(fā)生變化,導致藥材質(zhì)量參差不齊。光譜技術(shù)分析待測樣品時表現(xiàn)出快速、無損的優(yōu)勢,通過指紋圖譜分析化學信息,全面反映藥材品質(zhì),符合中醫(yī)藥傳統(tǒng)的整體觀。色譜作為常規(guī)的定量分析儀器,通過測定指標成分,可直觀評價藥材質(zhì)量。將光譜與色譜化學信息融合,輔以化學計量學分析方法,為快速、簡便、全面評價中藥質(zhì)量提供了實踐基礎(chǔ)。本論文以重樓(主要為滇重樓)為研究對象,采用衰減全反射傅里葉變換紅外光譜法(Attenuate total reflection Fourier transform infrared spectroscopy,ATR-FTIR)、紫外可見光譜法(Ultraviolet-visible spectrum,UV-Vis)、超高效液相色譜法(Ultra high performance liquid chromatography,UPLC),對不同產(chǎn)地(野生和栽培)和不同種(野生)重樓進行分析,結(jié)合主成分分析(Principal component analysis,PCA)、偏最小二乘判別分析(Partial least squares discriminant analysis,PLS-DA)、支持向量機網(wǎng)格式搜索(Support vector machine gird search,SVM-GS)、隨機森林(Random forest)等化學計量學方法,深入分析不同種和不同產(chǎn)地重樓樣品間差異,建立系統(tǒng)評價重樓質(zhì)量的模型,為重樓質(zhì)量評價提供基礎(chǔ)。論文包括五章,第一章對云南3個產(chǎn)區(qū)14個縣的177份野生滇重樓樣品進行FTIR和UV-Vis分析,采用低級和中級數(shù)據(jù)融合策略結(jié)合化學計量學分析方法,對產(chǎn)地進行鑒別研究;第二章對161份采自6個產(chǎn)區(qū)的野生滇重樓進行ATR-FTIR和UV-Vis分析,采用高級數(shù)據(jù)融合策略結(jié)合化學計量學,鑒別不同產(chǎn)地滇重樓;第三章對6個不同種重樓共87份野生樣品進行FTIR和UPLC分析,采用低級和中級數(shù)據(jù)融合結(jié)合化學計量學方法,對不同種重樓進行鑒別;第四章采集了219份栽培滇重樓根莖和葉(5個產(chǎn)地,3個年限)的ATR-FTIR光譜,結(jié)合生物量數(shù)據(jù),對產(chǎn)地進行鑒別;第五章對光譜和色譜在滇重樓質(zhì)量評價中的應(yīng)用進行了文獻綜述。1.本章節(jié)采集了177份野生滇重樓樣品的FTIR和UV-Vis光譜,FTIR的光譜范圍為4000-400 cm~(-1),UV-Vis光譜范圍為200-500 nm。光譜采用標準正態(tài)變換(Standard normal variate,SNV),二階導數(shù)(second derivative,SD)和卷積平滑(Savitsky-Golay,SG)預處理,建立單光譜數(shù)據(jù)矩陣(FTIR和UV-Vis)和融合數(shù)據(jù)矩陣(低級和中級)的PLS-DA和SVM-GS模型。與單光譜和低級數(shù)據(jù)融合建立的模型相比,基于中級數(shù)據(jù)融合策略建立的PLS-DA和SVM-GS模型對滇西北和滇東南樣品分類效果更好。對大樣本量(三個大產(chǎn)區(qū)177份樣本)和多分類(滇中樣本分為七個小產(chǎn)地)的研究結(jié)果顯示,中級數(shù)據(jù)融合結(jié)合化學計量學方法能正確鑒別不同產(chǎn)地樣品,且潛在變量(Latent variables,LVs)較主成分數(shù)(Principal components,PCs)更適用于中級數(shù)據(jù)融合特征變量的篩選。因此,相比于單光譜建立的PLS-DA和SVM-GS模型,基于數(shù)據(jù)融合,尤其是中級數(shù)據(jù)融合策略建立的產(chǎn)地鑒別模型,更適用于鑒別野生滇重樓的產(chǎn)地。該方法全面地反映了不同產(chǎn)地野生滇重樓之間化學組分差異,且模型穩(wěn)健性更好。2.在建立SVM-GS和隨機森林模型基礎(chǔ)上,比較了低級、中級、和高級數(shù)據(jù)融合策略對161份采自6個產(chǎn)區(qū)野生滇重樓樣品的產(chǎn)地鑒別效果。結(jié)果表明,低級數(shù)據(jù)融合建立的SVM-GS模型不能鑒別不同產(chǎn)地滇重樓樣品,中級數(shù)據(jù)融合方法可有效鑒別,高級數(shù)據(jù)融合建立的模型性能最優(yōu);诟呒墧(shù)據(jù)融合建立的隨機森林模型訓練集和測試集正確率分別為99%和98%,顯著高于單一的ATR-FTIR、UV-Vis、低級和中級數(shù)據(jù)融合建立的模型分類結(jié)果。3.根據(jù)錯判樣本數(shù)以及訓練集和測試集正確率,比較了3種模式識別方法(PLS-DA,SVM-GS和隨機森林)對不同種和產(chǎn)地重樓的鑒別效果。結(jié)果顯示,不同種重樓的模型鑒別正確率高于產(chǎn)地判別模型,表明不同種間化學組分差異大于不同產(chǎn)地樣品,該結(jié)論與重樓皂苷的定量結(jié)果和單因素方差分析(One-way analysis of variance,ANOVA)結(jié)果一致。此外,在鑒別不同種重樓方面,FTIR光譜表現(xiàn)出比UPLC色譜圖更優(yōu)的分類結(jié)果。通過對比十個數(shù)據(jù)矩陣建立判別模型得出:數(shù)據(jù)融合策略因提供了較重樓皂苷含量、單一FTIR光譜和UPLC色譜圖更多的化學信息,故建立的模型正確率更高,模型穩(wěn)健性更好,尤其是中級數(shù)據(jù)融合。4.將不同部位栽培滇重樓ATR-FTIR光譜融合,建立PLS-DA和隨機森林分類模型,追溯不同栽培產(chǎn)地滇重樓樣品。通過對比單一部位(根莖或葉)ATR-FTIR光譜和數(shù)據(jù)融合結(jié)果,表明基于數(shù)據(jù)融合策略建立的分類模型正確率更高。此外,PLS-DA模型訓練集和測試集中均無樣本錯分,該結(jié)果由5年生、6年生和7年生的栽培滇重樓樣品相互驗證。因此,ATR-FTIR光譜結(jié)合數(shù)據(jù)融合策略,可用于鑒別不同產(chǎn)地栽培滇重樓樣品,且該方法具有直接、快速、易操作等優(yōu)點。紅外光譜分析方法因不使用有機試劑,減少廢液產(chǎn)生,分析物可回收等,可視為一種綠色的分析方法。
【圖文】:

樣品預處理,滇東南,平均譜,滇西北


1735 v C=O 酯類 [50]1686, 1554 酰胺 I 和 II 帶 蛋白質(zhì) [5, 49]1619 v C=C 木質(zhì)素 [49]1446, 1336 δ CH2多糖類 [47, 51]1365 δ C-H 或 C-O-H 多糖類 [52]1235 v C-O 半纖維素 [53]1147 δ C-O 醇類或酯類 [49]1123 v C-O 葡萄糖 [54]1034 v C-C 和 C-O 皂苷類 [52, 55, 56]988 v C-O 碳水化合物類 [57]889 v C-O-C β-D-葡萄糖 [58]

模型圖,測試集,訓練集,數(shù)據(jù)集


品 FTIR 0.3726 0.0952 0.3618 0.4239 0.3883 70.43 71.1UV-Vis 0.6220 0.3623 0.2967 0.3727 0.4291 89.83 61.0SVM-GS 數(shù)據(jù)集 C γ 訓練集正確率 (%) 測試集正確率 FTIR 64.0000 0.0007 71.43 91.30UV-Vis 2.8284 45.2525 88.10 100.00南 FTIR 16.0000 0.0007 91.67 94.74UV-Vis 181.0190 0.0007 91.67 89.47北 FTIR 1.4142 0.0156 85.00 100.00UV-Vis 1.0000 0.0313 97.50 88.24品 FTIR 11.3137 0.0028 76.27 83.05UV-Vis 4.0000 0.0884 76.27 66.10
【學位授予單位】:云南中醫(yī)藥大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2019
【分類號】:R284.1

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4 吳U,

本文編號:2661821


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